Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G010500.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q8N7
Pfam -
Panther DB PTHR33377
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g02980.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G231800 tropinone reductase, putative, expressed K08081: tropinone reductase I
2 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
3 Sobic.001G457100 - -
4 Sobic.004G089700 - -
5 Sobic.008G023000 expressed protein -
6 Sobic.001G527400 - -
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8 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
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11 Sobic.002G048250 - -
12 Sobic.003G173032 - -
13 Sobic.005G209800 nodulin, putative, expressed -
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15 Sobic.002G285525 - -
16 Sobic.009G005800 formin-like protein 6 precursor, putative, expressed -
17 Sobic.003G290700 anthocyanidin 5,3-O-glucosyltransferase, putative, expressed -
18 Sobic.002G003100 gibberellin 2-beta-dioxygenase 7, putative, expressed K04125: gibberellin 2beta-dioxygenase
19 Sobic.010G002850 - -
20 Sobic.006G169300 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic002G010500--Sobic005G231800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G010500--Sobic004G224300 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic002G010500--Sobic001G457100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic002G010500--Sobic004G089700 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic002G010500--Sobic008G023000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic002G010500--Sobic001G527400 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic002G010500--Sobic003G337700 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic002G010500--Sobic008G002100 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic002G010500--Sobic007G183000 Sobic005G231800--Sobic008G023000 Sobic005G231800--Sobic001G527400 Sobic005G231800--Sobic008G002100 Sobic005G231800--Sobic007G183000 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic005G231800--Sobic004G226300 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic005G231800--Sobic005G209800 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic005G231800--Sobic002G048250 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic005G231800--Sobic003G173032 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic005G231800--Sobic006G171000 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic004G089700--Sobic002G048250 Sobic004G089700--Sobic007G183000 Sobic004G089700--Sobic005G231800 Sobic004G089700--Sobic008G023000 Sobic004G089700--Sobic001G527400 Sobic004G089700--Sobic004G226300 Sobic004G089700--Sobic008G002100 Sobic004G089700--Sobic005G209800 Sobic004G089700--Sobic004G347866 Sobic008G023000--Sobic008G002100 Sobic008G023000--Sobic001G527400 Sobic008G023000--Sobic007G183000 Sobic008G023000--Sobic005G209800 Sobic008G023000--Sobic004G226300 Sobic008G023000--Sobic003G173032 Sobic008G023000--Sobic005G231800 Sobic008G023000--Sobic002G048250 Sobic008G023000--Sobic006G171000 Sobic001G527400--Sobic008G023000 Sobic001G527400--Sobic008G002100 Sobic001G527400--Sobic007G183000 Sobic001G527400--Sobic004G226300 Sobic001G527400--Sobic002G048250 Sobic001G527400--Sobic005G209800 Sobic001G527400--Sobic005G231800 Sobic001G527400--Sobic003G173032 Sobic001G527400--Sobic006G171000 Sobic003G337700--Sobic004G224300 Sobic003G337700--Sobic008G023000 Sobic003G337700--Sobic008G002100 Sobic003G337700--Sobic001G527400 Sobic003G337700--Sobic007G183000 Sobic003G337700--Sobic004G226300 Sobic003G337700--Sobic005G209800 Sobic003G337700--Sobic005G231800 Sobic003G337700--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic008G023000 Sobic008G002100--Sobic001G527400 Sobic008G002100--Sobic005G209800 Sobic008G002100--Sobic007G183000 Sobic008G002100--Sobic004G226300 Sobic008G002100--Sobic005G231800 Sobic008G002100--Sobic003G173032 Sobic008G002100--Sobic002G048250 Sobic008G002100--Sobic006G171000 Sobic007G183000--Sobic004G226300 Sobic007G183000--Sobic001G527400 Sobic007G183000--Sobic002G048250 Sobic007G183000--Sobic008G023000 Sobic007G183000--Sobic008G002100 Sobic007G183000--Sobic005G231800 Sobic007G183000--Sobic005G209800 Sobic007G183000--Sobic003G173032 Sobic007G183000--Sobic006G171000
Octagon: transcription factors


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