Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G078800.1
Synonym Sb10g006830
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YIZ3
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g10610.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a042487 , Zm00025a049608
Brachypodium KQK19066 , PNT76236 , PNT76237
Barley HORVU7Hr1G035270.2 , HORVU7Hr1G035270.3 , HORVU7Hr1G035270.1 , HORVU7Hr1G035270.4
Wheat TraesCS7B02G073000 , TraesCS7A02G168200 , TraesCS7D02G169100
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G265300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
2 Sobic.002G367850 - -
3 Sobic.007G206550 - -
4 Sobic.005G066800 - -
5 Sobic.002G299800 expressed protein -
6 Sobic.001G075900 bZIP transcription factor domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G295400 amino acid kinase, putative, expressed K00930: acetylglutamate kinase
8 Sobic.003G073620 - -
9 Sobic.009G184300 AP2 domain containing protein, expressed -
10 Sobic.001G391000 aspartic proteinase nepenthesin precursor, putative, expressed -
11 Sobic.002G316301 - -
12 Sobic.007G157550 - -
13 Sobic.001G179680 - -
14 Sobic.006G186200 exostosin family domain containing protein, expressed -
15 Sobic.001G457100 - -
16 Sobic.001G523500 DUF623 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.004G347866 - -
18 Sobic.004G355401 - -
19 Sobic.004G310000 lipase, putative, expressed -
20 Sobic.001G040701 - -


Gene co-expression network
sample Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic010G078800--Sobic003G265300 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic010G078800--Sobic002G367850 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic010G078800--Sobic007G206550 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic010G078800--Sobic005G066800 Sobic002G299800 Sobic002G299800 Sobic010G078800--Sobic002G299800 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic010G078800--Sobic001G075900 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic010G078800--Sobic004G295400 Sobic003G073620 Sobic003G073620 Sobic010G078800--Sobic003G073620 Sobic009G184300 Sobic009G184300 Sobic010G078800--Sobic009G184300 Sobic003G265300--Sobic002G367850 Sobic003G265300--Sobic007G206550 Sobic003G265300--Sobic005G066800 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic003G265300--Sobic001G391000 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic003G265300--Sobic003G337700 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic003G265300--Sobic004G355401 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic003G265300--Sobic001G179680 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic003G265300--Sobic001G457100 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic003G265300--Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic002G367850--Sobic004G206900 Sobic007G206550--Sobic007G157550 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic007G206550--Sobic004G347866 Sobic007G206550--Sobic001G179680 Sobic007G206550--Sobic001G457100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic007G206550--Sobic004G089700 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic007G206550--Sobic002G048250 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic007G206550--Sobic007G183000 Sobic007G206550--Sobic004G355401 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic007G206550--Sobic004G224300 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic004G156600 Sobic004G156600 Sobic002G299800--Sobic004G156600 Sobic002G299800--Sobic010G078800 Sobic006G186200 Sobic006G186200 Sobic002G299800--Sobic006G186200 Sobic007G076800 Sobic007G076800 Sobic002G299800--Sobic007G076800 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic002G299800--Sobic004G061600 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic002G299800--Sobic003G390300 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic002G299800--Sobic001G062700 Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic002G299800--Sobic008G136900 Sobic002G299800--Sobic003G265300 Sobic001G075900--Sobic003G073620 Sobic001G213200 Sobic001G213200 Sobic001G075900--Sobic001G213200 Sobic001G075900--Sobic010G078800 Sobic001G354900 Sobic001G354900 Sobic001G075900--Sobic001G354900 Sobic001G037550 Sobic001G037550 Sobic001G075900--Sobic001G037550 Sobic001G075900--Sobic001G391000 Sobic001G075900--Sobic002G367850 Sobic001G075900--Sobic003G265300 Sobic001G523500 Sobic001G523500 Sobic001G075900--Sobic001G523500 Sobic004G295400--Sobic002G367850 Sobic004G295400--Sobic005G066800 Sobic004G295400--Sobic003G265300 Sobic004G295400--Sobic001G391000 Sobic004G295400--Sobic002G202200 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic004G295400--Sobic002G316301 Sobic004G295400--Sobic007G206550 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic004G295400--Sobic002G010500 Sobic004G295400--Sobic004G355401 Sobic003G073620--Sobic001G075900 Sobic003G073620--Sobic001G213200 Sobic003G073620--Sobic010G078800 Sobic003G073620--Sobic001G354900 Sobic003G073620--Sobic003G265300 Sobic003G073620--Sobic001G391000 Sobic003G073620--Sobic002G367850 Sobic003G073620--Sobic002G202200 Sobic003G073620--Sobic005G066800 Sobic009G184300--Sobic003G265300 Sobic009G184300--Sobic010G078800 Sobic008G065100 Sobic008G065100 Sobic009G184300--Sobic008G065100 Sobic004G132700 Sobic004G132700 Sobic009G184300--Sobic004G132700 Sobic009G184300--Sobic004G295400 Sobic009G184300--Sobic002G316301 Sobic009G184300--Sobic002G367850 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic009G184300--Sobic004G007032 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic009G184300--Sobic009G236500
Octagon: transcription factors


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