Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G299800.1
Synonym Sb02g033050
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X8H4
Pfam -
Panther DB PTHR37259 PTHR37259:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G42330 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g29190.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014613 , Zm00025a047837
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G156600 - -
2 Sobic.010G078800 expressed protein -
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13 Sobic.007G015400 a_IG002N01.7, putative, expressed -
14 Sobic.004G355401 - -
15 Sobic.001G103400 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@FHA domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G367850 - -
17 Sobic.001G457100 - -
18 Sobic.008G083650 - -
19 Sobic.007G157550 - -
20 Sobic.003G040100 PHD-finger domain containing protein, putative, expressed K11380: NuA3 HAT complex component NTO1


Gene co-expression network
sample Sobic002G299800 Sobic002G299800 Sobic004G156600 Sobic004G156600 Sobic002G299800--Sobic004G156600 Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic002G299800--Sobic010G078800 Sobic006G186200 Sobic006G186200 Sobic002G299800--Sobic006G186200 Sobic007G076800 Sobic007G076800 Sobic002G299800--Sobic007G076800 Sobic004G061600 Sobic004G061600 Sobic002G299800--Sobic004G061600 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic002G299800--Sobic003G390300 Sobic001G062700 Sobic001G062700 Sobic002G299800--Sobic001G062700 Sobic008G136900 Sobic008G136900 Sobic002G299800--Sobic008G136900 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic002G299800--Sobic003G265300 Sobic004G156600--Sobic003G390300 Sobic004G156600--Sobic002G299800 Sobic004G156600--Sobic006G186200 Sobic004G156600--Sobic004G061600 Sobic004G107400 Sobic004G107400 Sobic004G156600--Sobic004G107400 Sobic004G156600--Sobic008G136900 Sobic004G156600--Sobic001G062700 Sobic003G040100 Sobic003G040100 Sobic004G156600--Sobic003G040100 Sobic004G156600--Sobic007G076800 Sobic010G078800--Sobic003G265300 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic010G078800--Sobic002G367850 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic010G078800--Sobic007G206550 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic010G078800--Sobic005G066800 Sobic010G078800--Sobic002G299800 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic010G078800--Sobic001G075900 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic010G078800--Sobic004G295400 Sobic003G073620 Sobic003G073620 Sobic010G078800--Sobic003G073620 Sobic009G184300 Sobic009G184300 Sobic010G078800--Sobic009G184300 Sobic006G273500 Sobic006G273500 Sobic006G186200--Sobic006G273500 Sobic006G186200--Sobic004G061600 Sobic006G186200--Sobic004G107400 Sobic006G186200--Sobic003G390300 Sobic010G014900 Sobic010G014900 Sobic006G186200--Sobic010G014900 Sobic007G158400 Sobic007G158400 Sobic006G186200--Sobic007G158400 Sobic006G186200--Sobic004G156600 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic006G186200--Sobic003G290700 Sobic001G137200 Sobic001G137200 Sobic006G186200--Sobic001G137200 Sobic007G076800--Sobic003G390300 Sobic007G076800--Sobic004G061600 Sobic007G076800--Sobic004G107400 Sobic007G076800--Sobic008G136900 Sobic009G005800 Sobic009G005800 Sobic007G076800--Sobic009G005800 Sobic007G076800--Sobic001G062700 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic007G076800--Sobic002G010500 Sobic010G119600 Sobic010G119600 Sobic007G076800--Sobic010G119600 Sobic007G206700 Sobic007G206700 Sobic007G076800--Sobic007G206700 Sobic004G061600--Sobic003G390300 Sobic004G061600--Sobic007G158400 Sobic004G061600--Sobic008G136900 Sobic004G061600--Sobic010G014900 Sobic004G061600--Sobic001G062700 Sobic004G061600--Sobic004G107400 Sobic005G168500 Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic005G168500 Sobic004G061600--Sobic001G137200 Sobic004G061600--Sobic006G273500 Sobic003G390300--Sobic004G107400 Sobic003G390300--Sobic004G061600 Sobic003G390300--Sobic008G136900 Sobic003G390300--Sobic001G062700 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic003G390300--Sobic003G104900 Sobic003G390300--Sobic010G014900 Sobic003G390300--Sobic007G158400 Sobic003G390300--Sobic001G137200 Sobic009G028600 Sobic009G028600 Sobic003G390300--Sobic009G028600 Sobic001G062700--Sobic003G390300 Sobic001G062700--Sobic004G061600 Sobic001G062700--Sobic008G136900 Sobic007G092300 Sobic007G092300 Sobic001G062700--Sobic007G092300 Sobic001G062700--Sobic010G119600 Sobic010G259200 Sobic010G259200 Sobic001G062700--Sobic010G259200 Sobic001G062700--Sobic007G206700 Sobic001G062700--Sobic010G014900 Sobic001G062700--Sobic004G107400 Sobic008G136900--Sobic003G390300 Sobic008G136900--Sobic004G061600 Sobic008G136900--Sobic004G107400 Sobic001G103400 Sobic001G103400 Sobic008G136900--Sobic001G103400 Sobic008G136900--Sobic007G158400 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic008G136900--Sobic001G483700 Sobic008G136900--Sobic010G014900 Sobic008G136900--Sobic003G104900 Sobic008G136900--Sobic009G028600 Sobic003G265300--Sobic002G367850 Sobic003G265300--Sobic007G206550 Sobic003G265300--Sobic005G066800 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic003G265300--Sobic001G391000 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic003G265300--Sobic003G337700 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic003G265300--Sobic004G355401 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic003G265300--Sobic001G179680 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic003G265300--Sobic001G457100 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic003G265300--Sobic007G157550
Octagon: transcription factors


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