Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G015400.1
Synonym Sb07g001390
Functional annotation a_IG002N01.7, putative, expressed
UniProt A0A1B6PF60
Pfam -
Panther DB PTHR10108 PTHR10108:SF720
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G05390 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g02150.1 : a_IG002N01.7, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a030268 , Zm00025a026507
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G083700 DNA binding protein, putative, expressed -
2 Sobic.003G265300 lectin-like receptor kinase, putative, expressed -
3 Sobic.001G029900 protein kinase domain containing protein, expressed -
4 Sobic.006G156500 glycosyltransferase sugar-binding region containing DXD motif, putative, expressed K01988: lactosylceramide 4-alpha-galactosyltransferase
5 Sobic.004G355401 - -
6 Sobic.008G083650 - -
7 Sobic.002G367850 - -
8 Sobic.005G066800 - -
9 Sobic.007G206550 - -
10 Sobic.007G157550 - -
11 Sobic.002G299800 expressed protein -
12 Sobic.002G001300 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
13 Sobic.001G457100 - -
14 Sobic.004G347866 - -
15 Sobic.003G104900 methyltransferase, putative, expressed K08241: jasmonate O-methyltransferase
16 Sobic.010G259200 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
17 Sobic.010G119600 embryogenesis transmembrane protein, putative, expressed -
18 Sobic.009G236500 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
19 Sobic.007G206700 lectin-like protein kinase, putative, expressed -
20 Sobic.009G187000 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic007G015400 Sobic007G015400 Sobic003G083700 Sobic003G083700 Sobic007G015400--Sobic003G083700 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic007G015400--Sobic003G265300 Sobic001G029900 Sobic001G029900 Sobic007G015400--Sobic001G029900 Sobic006G156500 Sobic006G156500 Sobic007G015400--Sobic006G156500 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic007G015400--Sobic004G355401 Sobic008G083650 Sobic008G083650 Sobic007G015400--Sobic008G083650 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic007G015400--Sobic002G367850 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic007G015400--Sobic005G066800 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic007G015400--Sobic007G206550 Sobic003G104900 Sobic003G104900 Sobic003G083700--Sobic003G104900 Sobic010G259200 Sobic010G259200 Sobic003G083700--Sobic010G259200 Sobic007G206700 Sobic007G206700 Sobic003G083700--Sobic007G206700 Sobic002G001300 Sobic002G001300 Sobic003G083700--Sobic002G001300 Sobic001G483700 Sobic001G483700 Sobic003G083700--Sobic001G483700 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic003G083700--Sobic010G002850 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic003G083700--Sobic005G209800 Sobic003G390300 Sobic003G390300 Sobic003G083700--Sobic003G390300 Sobic001G402701 Sobic001G402701 Sobic003G083700--Sobic001G402701 Sobic003G265300--Sobic002G367850 Sobic003G265300--Sobic007G206550 Sobic003G265300--Sobic005G066800 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic003G265300--Sobic001G391000 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic003G265300--Sobic003G337700 Sobic003G265300--Sobic004G355401 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic003G265300--Sobic001G179680 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic003G265300--Sobic001G457100 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic003G265300--Sobic007G157550 Sobic001G029900--Sobic003G265300 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic001G029900--Sobic009G236500 Sobic001G029900--Sobic004G355401 Sobic001G029900--Sobic001G457100 Sobic002G003100 Sobic002G003100 Sobic001G029900--Sobic002G003100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G029900--Sobic004G089700 Sobic001G029900--Sobic007G206550 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic001G029900--Sobic004G347866 Sobic001G029900--Sobic007G157550 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic006G156500--Sobic004G007032 Sobic006G156500--Sobic007G015400 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic006G156500--Sobic002G316301 Sobic006G156500--Sobic008G083650 Sobic006G156500--Sobic005G066800 Sobic006G156500--Sobic003G265300 Sobic006G156500--Sobic002G367850 Sobic002G299800 Sobic002G299800 Sobic006G156500--Sobic002G299800 Sobic006G156500--Sobic004G355401 Sobic004G355401--Sobic001G457100 Sobic004G355401--Sobic007G157550 Sobic004G355401--Sobic004G347866 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic004G355401--Sobic004G206900 Sobic004G355401--Sobic005G066800 Sobic004G355401--Sobic007G206550 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic004G355401--Sobic009G223700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic004G355401--Sobic006G169300 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic004G355401--Sobic002G339250 Sobic006G123100 Sobic006G123100 Sobic008G083650--Sobic006G123100 Sobic001G463650 Sobic001G463650 Sobic008G083650--Sobic001G463650 Sobic003G350000 Sobic003G350000 Sobic008G083650--Sobic003G350000 Sobic008G083650--Sobic004G355401 Sobic008G083650--Sobic002G367850 Sobic010G067950 Sobic010G067950 Sobic008G083650--Sobic010G067950 Sobic010G263101 Sobic010G263101 Sobic008G083650--Sobic010G263101 Sobic008G083650--Sobic007G157550 Sobic008G083650--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic004G206900 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic007G206550--Sobic007G157550 Sobic007G206550--Sobic004G347866 Sobic007G206550--Sobic001G179680 Sobic007G206550--Sobic001G457100 Sobic007G206550--Sobic004G089700 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic007G206550--Sobic002G048250 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic007G206550--Sobic007G183000 Sobic007G206550--Sobic004G355401 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic007G206550--Sobic004G224300
Octagon: transcription factors


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