Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G184300.1
Synonym ERF12, ATERF12
Functional annotation AP2 domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6P959
Pfam PF00847
Panther DB PTHR31677 PTHR31677:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G28360 : ERF domain protein 12
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g41760.1 : AP2 domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a035951 , Zm00025a003372 , Zm00025a044109 , Zm00025a011638 , Zm00025a029907 , Zm00025a055961 , Zm00025a049099 , Zm00025a037864 , Zm00025a037862
Brachypodium KQJ82336 , KQK09018 , KQK05591 , KQK05592 , KQJ95602 , KQJ93763 , KQK14788
Barley HORVU1Hr1G067160.1 , HORVU3Hr1G030310.1 , HORVU2Hr1G071470.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic009G184300 Sobic009G184300 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic009G184300--Sobic003G265300 Sobic010G078800 Sobic010G078800 Sobic009G184300--Sobic010G078800 Sobic008G065100 Sobic008G065100 Sobic009G184300--Sobic008G065100 Sobic004G132700 Sobic004G132700 Sobic009G184300--Sobic004G132700 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic009G184300--Sobic004G295400 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic009G184300--Sobic002G316301 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic009G184300--Sobic002G367850 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic009G184300--Sobic004G007032 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic009G184300--Sobic009G236500 Sobic003G265300--Sobic002G367850 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic003G265300--Sobic007G206550 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic003G265300--Sobic005G066800 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic003G265300--Sobic001G391000 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic003G265300--Sobic003G337700 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic003G265300--Sobic004G355401 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic003G265300--Sobic001G179680 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic003G265300--Sobic001G457100 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic003G265300--Sobic007G157550 Sobic010G078800--Sobic003G265300 Sobic010G078800--Sobic002G367850 Sobic010G078800--Sobic007G206550 Sobic010G078800--Sobic005G066800 Sobic002G299800 Sobic002G299800 Sobic010G078800--Sobic002G299800 Sobic001G075900 Sobic001G075900 Sobic010G078800--Sobic001G075900 Sobic010G078800--Sobic004G295400 Sobic003G073620 Sobic003G073620 Sobic010G078800--Sobic003G073620 Sobic010G078800--Sobic009G184300 Sobic008G065100--Sobic003G265300 Sobic008G065100--Sobic003G337700 Sobic008G065100--Sobic004G132700 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic008G065100--Sobic002G010500 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic008G065100--Sobic002G121701 Sobic008G065100--Sobic009G236500 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic008G065100--Sobic004G224300 Sobic008G065100--Sobic001G457100 Sobic008G065100--Sobic004G295400 Sobic001G180500 Sobic001G180500 Sobic004G132700--Sobic001G180500 Sobic004G132700--Sobic002G121701 Sobic004G132700--Sobic008G065100 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic004G132700--Sobic008G144100 Sobic004G132700--Sobic003G265300 Sobic004G132700--Sobic009G236500 Sobic004G132700--Sobic003G337700 Sobic004G132700--Sobic001G391000 Sobic004G132700--Sobic009G184300 Sobic004G295400--Sobic002G367850 Sobic004G295400--Sobic005G066800 Sobic004G295400--Sobic003G265300 Sobic004G295400--Sobic001G391000 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic004G295400--Sobic002G202200 Sobic004G295400--Sobic002G316301 Sobic004G295400--Sobic007G206550 Sobic004G295400--Sobic002G010500 Sobic004G295400--Sobic004G355401 Sobic002G316301--Sobic002G367850 Sobic001G006900 Sobic001G006900 Sobic002G316301--Sobic001G006900 Sobic002G316301--Sobic004G007032 Sobic001G040701 Sobic001G040701 Sobic002G316301--Sobic001G040701 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic005G066800 Sobic002G316301--Sobic004G295400 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic002G316301--Sobic007G124800 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic002G316301--Sobic008G108000 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic002G367850--Sobic004G206900 Sobic009G031000 Sobic009G031000 Sobic004G007032--Sobic009G031000 Sobic004G007032--Sobic002G331050 Sobic004G007032--Sobic005G066800 Sobic004G007032--Sobic003G265300 Sobic005G044900 Sobic005G044900 Sobic004G007032--Sobic005G044900 Sobic004G007032--Sobic002G316301 Sobic004G007032--Sobic002G367850 Sobic004G007032--Sobic001G391000 Sobic006G156500 Sobic006G156500 Sobic004G007032--Sobic006G156500 Sobic009G236500--Sobic003G337700 Sobic009G236500--Sobic004G224300 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic009G236500--Sobic004G089700 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic009G236500--Sobic002G339250 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic009G236500--Sobic005G209800 Sobic009G236500--Sobic001G457100 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic009G236500--Sobic010G002850 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic009G236500--Sobic002G048250 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic009G236500--Sobic004G226300
Octagon: transcription factors


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