Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G006900.2
Synonym Sb01g000710, EXGT-A3, ATXTH27, XTH27
Functional annotation glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed
UniProt C5WRZ5
Pfam PF06955 PF00722
Panther DB PTHR31062 PTHR31062:SF39
NCBI CDD -
KEGG Orthology K08235; xyloglucan:xyloglucosyl transferase
Gene Ontology GO:0016762; xyloglucan:xyloglucosyl transferase activity GO:0006073cellular glucan metabolic process GO:0005618cell wall GO:0005975carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G01850 : endoxyloglucan transferase A3
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g63760.1 : glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052940 , Zm00025a046886
Brachypodium PNT64517 , KQJ90139
Barley HORVU5Hr1G123920.1 , HORVU5Hr1G123920.2 , HORVU5Hr1G123920.3 , HORVU5Hr1G060340.6 , HORVU5Hr1G060340.7 , HORVU5Hr1G060340.4 , HORVU5Hr1G060340.5 , HORVU5Hr1G060340.3 , HORVU5Hr1G060340.1
Wheat TraesCS5B02G202000 , TraesCS5D02G209700 , TraesCS6A02G266100 , TraesCS5A02G203300
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
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Rank Gene Function KEGG orthology
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Gene co-expression network
sample Sobic001G006900 Sobic001G006900 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic001G006900--Sobic002G316301 Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic001G006900--Sobic005G230700 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic001G006900--Sobic002G010500 Sobic008G065100 Sobic008G065100 Sobic001G006900--Sobic008G065100 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic001G006900--Sobic004G007032 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic001G006900--Sobic002G367850 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic001G006900--Sobic003G294000 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic001G006900--Sobic005G066800 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic001G006900--Sobic002G121701 Sobic002G316301--Sobic002G367850 Sobic002G316301--Sobic001G006900 Sobic002G316301--Sobic004G007032 Sobic001G040701 Sobic001G040701 Sobic002G316301--Sobic001G040701 Sobic002G331050 Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic002G331050 Sobic002G316301--Sobic005G066800 Sobic004G295400 Sobic004G295400 Sobic002G316301--Sobic004G295400 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic002G316301--Sobic007G124800 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic002G316301--Sobic008G108000 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic005G230700--Sobic001G027400 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic005G230700--Sobic003G371900 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic005G230700--Sobic001G174300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G230700--Sobic002G202200 Sobic005G230700--Sobic001G006900 Sobic009G027550 Sobic009G027550 Sobic005G230700--Sobic009G027550 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic005G230700--Sobic008G134000 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic005G230700--Sobic004G108900 Sobic005G230700--Sobic007G124800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic002G010500--Sobic005G231800 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G010500--Sobic004G224300 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic002G010500--Sobic001G457100 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic002G010500--Sobic004G089700 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic002G010500--Sobic008G023000 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic002G010500--Sobic001G527400 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic002G010500--Sobic003G337700 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic002G010500--Sobic008G002100 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic002G010500--Sobic007G183000 Sobic003G265300 Sobic003G265300 Sobic008G065100--Sobic003G265300 Sobic008G065100--Sobic003G337700 Sobic004G132700 Sobic004G132700 Sobic008G065100--Sobic004G132700 Sobic008G065100--Sobic002G010500 Sobic008G065100--Sobic002G121701 Sobic009G236500 Sobic009G236500 Sobic008G065100--Sobic009G236500 Sobic008G065100--Sobic004G224300 Sobic008G065100--Sobic001G457100 Sobic008G065100--Sobic004G295400 Sobic009G031000 Sobic009G031000 Sobic004G007032--Sobic009G031000 Sobic004G007032--Sobic002G331050 Sobic004G007032--Sobic005G066800 Sobic004G007032--Sobic003G265300 Sobic005G044900 Sobic005G044900 Sobic004G007032--Sobic005G044900 Sobic004G007032--Sobic002G316301 Sobic004G007032--Sobic002G367850 Sobic001G391000 Sobic001G391000 Sobic004G007032--Sobic001G391000 Sobic006G156500 Sobic006G156500 Sobic004G007032--Sobic006G156500 Sobic002G367850--Sobic005G066800 Sobic002G367850--Sobic003G265300 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic002G367850--Sobic007G206550 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic004G355401 Sobic002G367850--Sobic001G391000 Sobic002G367850--Sobic001G457100 Sobic002G367850--Sobic004G295400 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic002G367850--Sobic007G157550 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic002G367850--Sobic004G206900 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic003G294000--Sobic004G279150 Sobic002G245600 Sobic002G245600 Sobic003G294000--Sobic002G245600 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic003G294000--Sobic009G094000 Sobic002G180501 Sobic002G180501 Sobic003G294000--Sobic002G180501 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic003G294000--Sobic006G167200 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic003G294000--Sobic009G127600 Sobic006G019901 Sobic006G019901 Sobic003G294000--Sobic006G019901 Sobic002G165401 Sobic002G165401 Sobic003G294000--Sobic002G165401 Sobic001G481201 Sobic001G481201 Sobic003G294000--Sobic001G481201 Sobic005G066800--Sobic002G367850 Sobic005G066800--Sobic001G391000 Sobic005G066800--Sobic004G355401 Sobic005G066800--Sobic003G265300 Sobic005G066800--Sobic002G202200 Sobic005G066800--Sobic007G206550 Sobic005G066800--Sobic004G295400 Sobic005G066800--Sobic001G457100 Sobic005G066800--Sobic004G206900 Sobic002G121701--Sobic003G337700 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic002G121701--Sobic009G223700 Sobic002G121701--Sobic001G457100 Sobic002G121701--Sobic004G224300 Sobic002G120250 Sobic002G120250 Sobic002G121701--Sobic002G120250 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic002G121701--Sobic003G290700 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic002G121701--Sobic001G179680 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic002G121701--Sobic008G144100 Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic002G121701--Sobic009G061700
Octagon: transcription factors


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