Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G120250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W3C5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G121701 - -
2 Sobic.003G337700 WRKY20, expressed -
3 Sobic.004G241850 - -
4 Sobic.004G224300 5-azacytidine resistance protein related, putative, expressed -
5 Sobic.001G457100 - -
6 Sobic.006G169300 - -
7 Sobic.004G355401 - -
8 Sobic.009G223700 - -
9 Sobic.002G285525 - -
10 Sobic.008G144100 receptor-like protein kinase 5 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.004G226300 expressed protein -
12 Sobic.004G089700 - -
13 Sobic.007G183000 helix-loop-helix DNA-binding domain containing protein, expressed -
14 Sobic.008G023000 expressed protein -
15 Sobic.010G002850 - -
16 Sobic.001G527400 - -
17 Sobic.008G002100 zinc finger, C3HC4 type domain containing protein -
18 Sobic.006G171000 Highest expression level in primordial inflorescence(PubMedID : 27501690)@OsSPL7 - SBP-box gene family member, expressed -
19 Sobic.001G179680 - -
20 Sobic.002G010500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G120250 Sobic002G120250 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic002G120250--Sobic002G121701 Sobic003G337700 Sobic003G337700 Sobic002G120250--Sobic003G337700 Sobic004G241850 Sobic004G241850 Sobic002G120250--Sobic004G241850 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic002G120250--Sobic004G224300 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic002G120250--Sobic001G457100 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic002G120250--Sobic006G169300 Sobic004G355401 Sobic004G355401 Sobic002G120250--Sobic004G355401 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic002G120250--Sobic009G223700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic002G120250--Sobic002G285525 Sobic002G121701--Sobic003G337700 Sobic002G121701--Sobic009G223700 Sobic002G121701--Sobic001G457100 Sobic002G121701--Sobic004G224300 Sobic002G121701--Sobic002G120250 Sobic003G290700 Sobic003G290700 Sobic002G121701--Sobic003G290700 Sobic001G179680 Sobic001G179680 Sobic002G121701--Sobic001G179680 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic002G121701--Sobic008G144100 Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic002G121701--Sobic009G061700 Sobic003G337700--Sobic004G224300 Sobic008G023000 Sobic008G023000 Sobic003G337700--Sobic008G023000 Sobic008G002100 Sobic008G002100 Sobic003G337700--Sobic008G002100 Sobic001G527400 Sobic001G527400 Sobic003G337700--Sobic001G527400 Sobic007G183000 Sobic007G183000 Sobic003G337700--Sobic007G183000 Sobic004G226300 Sobic004G226300 Sobic003G337700--Sobic004G226300 Sobic005G209800 Sobic005G209800 Sobic003G337700--Sobic005G209800 Sobic005G231800 Sobic005G231800 Sobic003G337700--Sobic005G231800 Sobic003G173032 Sobic003G173032 Sobic003G337700--Sobic003G173032 Sobic004G241850--Sobic002G120250 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic004G241850--Sobic004G108900 Sobic004G241850--Sobic002G121701 Sobic004G241850--Sobic004G355401 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic004G241850--Sobic008G134000 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic004G241850--Sobic005G066800 Sobic004G241850--Sobic006G169300 Sobic004G241850--Sobic009G223700 Sobic004G241850--Sobic001G457100 Sobic004G224300--Sobic008G023000 Sobic004G224300--Sobic001G527400 Sobic004G224300--Sobic007G183000 Sobic002G048250 Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic002G048250 Sobic004G224300--Sobic008G002100 Sobic004G224300--Sobic003G337700 Sobic004G224300--Sobic004G226300 Sobic004G224300--Sobic005G231800 Sobic004G224300--Sobic005G209800 Sobic001G457100--Sobic009G223700 Sobic004G347866 Sobic004G347866 Sobic001G457100--Sobic004G347866 Sobic004G089700 Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G089700 Sobic001G457100--Sobic004G226300 Sobic001G457100--Sobic002G048250 Sobic001G457100--Sobic007G183000 Sobic007G157550 Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic007G157550 Sobic001G457100--Sobic005G231800 Sobic001G457100--Sobic003G290700 Sobic006G169300--Sobic009G223700 Sobic006G169300--Sobic002G285525 Sobic006G169300--Sobic004G224300 Sobic010G002850 Sobic010G002850 Sobic006G169300--Sobic010G002850 Sobic006G169300--Sobic004G226300 Sobic006G169300--Sobic007G183000 Sobic006G171000 Sobic006G171000 Sobic006G169300--Sobic006G171000 Sobic006G169300--Sobic001G527400 Sobic006G169300--Sobic002G048250 Sobic004G355401--Sobic001G457100 Sobic004G355401--Sobic007G157550 Sobic004G355401--Sobic004G347866 Sobic004G206900 Sobic004G206900 Sobic004G355401--Sobic004G206900 Sobic004G355401--Sobic005G066800 Sobic007G206550 Sobic007G206550 Sobic004G355401--Sobic007G206550 Sobic004G355401--Sobic009G223700 Sobic004G355401--Sobic006G169300 Sobic002G339250 Sobic002G339250 Sobic004G355401--Sobic002G339250 Sobic009G223700--Sobic001G457100 Sobic009G223700--Sobic004G226300 Sobic009G223700--Sobic007G183000 Sobic009G223700--Sobic002G048250 Sobic009G223700--Sobic002G285525 Sobic009G223700--Sobic003G290700 Sobic009G223700--Sobic006G169300 Sobic009G223700--Sobic001G527400 Sobic009G223700--Sobic004G347866 Sobic002G285525--Sobic007G183000 Sobic002G285525--Sobic001G527400 Sobic002G285525--Sobic004G226300 Sobic002G285525--Sobic003G290700 Sobic002G285525--Sobic008G023000 Sobic002G285525--Sobic008G002100 Sobic002G285525--Sobic002G048250 Sobic002G285525--Sobic005G209800 Sobic002G285525--Sobic004G224300
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.