Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G230700.2
Synonym GRAS2, SCL14, ATGRAS2, Sb05g027800
Functional annotation SCARECROW, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RL82
Pfam PF03514
Panther DB PTHR31636 PTHR31636:SF59
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G29065 : GRAS family transcription factor
RAP-DB (Rice) LOC_Os12g38490.1 : SCARECROW, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a029079
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G027400 - -
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20 Sobic.004G306700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase CYP40, putative, expressed K05864: PPID, peptidyl-prolyl isomerase D


Gene co-expression network
sample Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic005G230700--Sobic001G027400 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic005G230700--Sobic003G371900 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic005G230700--Sobic001G174300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G230700--Sobic002G202200 Sobic001G006900 Sobic001G006900 Sobic005G230700--Sobic001G006900 Sobic009G027550 Sobic009G027550 Sobic005G230700--Sobic009G027550 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic005G230700--Sobic008G134000 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic005G230700--Sobic004G108900 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic005G230700--Sobic007G124800 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic001G027400--Sobic010G097800 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic001G027400--Sobic003G304900 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic001G027400--Sobic008G007100 Sobic001G027400--Sobic001G174300 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic001G027400--Sobic009G242032 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G027400--Sobic007G157200 Sobic001G027400--Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic007G124800 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic001G027400--Sobic003G005332 Sobic003G371900--Sobic003G304900 Sobic003G371900--Sobic001G027400 Sobic005G080100 Sobic005G080100 Sobic003G371900--Sobic005G080100 Sobic003G371900--Sobic005G230700 Sobic003G371900--Sobic008G007100 Sobic006G111400 Sobic006G111400 Sobic003G371900--Sobic006G111400 Sobic003G371900--Sobic003G005332 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic003G371900--Sobic001G316500 Sobic001G140101 Sobic001G140101 Sobic003G371900--Sobic001G140101 Sobic001G174300--Sobic007G124800 Sobic001G174300--Sobic001G027400 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic001G174300--Sobic010G217001 Sobic001G174300--Sobic001G316500 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G174300--Sobic002G138200 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic001G174300--Sobic005G066800 Sobic001G174300--Sobic007G157200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic003G304900 Sobic002G202200--Sobic005G066800 Sobic002G202200--Sobic009G242032 Sobic002G202200--Sobic007G124800 Sobic002G202200--Sobic001G316500 Sobic002G202200--Sobic001G027400 Sobic002G367850 Sobic002G367850 Sobic002G202200--Sobic002G367850 Sobic002G202200--Sobic008G007100 Sobic002G202200--Sobic001G174300 Sobic002G187350 Sobic002G187350 Sobic002G202200--Sobic002G187350 Sobic002G316301 Sobic002G316301 Sobic001G006900--Sobic002G316301 Sobic001G006900--Sobic005G230700 Sobic002G010500 Sobic002G010500 Sobic001G006900--Sobic002G010500 Sobic008G065100 Sobic008G065100 Sobic001G006900--Sobic008G065100 Sobic004G007032 Sobic004G007032 Sobic001G006900--Sobic004G007032 Sobic001G006900--Sobic002G367850 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic001G006900--Sobic003G294000 Sobic001G006900--Sobic005G066800 Sobic002G121701 Sobic002G121701 Sobic001G006900--Sobic002G121701 Sobic009G027550--Sobic001G027400 Sobic009G027550--Sobic010G097800 Sobic002G161200 Sobic002G161200 Sobic009G027550--Sobic002G161200 Sobic009G027550--Sobic009G242032 Sobic009G027550--Sobic003G304900 Sobic009G027550--Sobic005G230700 Sobic009G027550--Sobic007G157200 Sobic009G027550--Sobic002G202200 Sobic009G027550--Sobic007G124800 Sobic008G134000--Sobic004G108900 Sobic003G075901 Sobic003G075901 Sobic008G134000--Sobic003G075901 Sobic009G061700 Sobic009G061700 Sobic008G134000--Sobic009G061700 Sobic008G134000--Sobic002G121701 Sobic008G144100 Sobic008G144100 Sobic008G134000--Sobic008G144100 Sobic009G223700 Sobic009G223700 Sobic008G134000--Sobic009G223700 Sobic006G169300 Sobic006G169300 Sobic008G134000--Sobic006G169300 Sobic001G457100 Sobic001G457100 Sobic008G134000--Sobic001G457100 Sobic001G399501 Sobic001G399501 Sobic008G134000--Sobic001G399501 Sobic004G108900--Sobic006G169300 Sobic004G108900--Sobic009G223700 Sobic004G108900--Sobic008G134000 Sobic004G108900--Sobic009G061700 Sobic002G285525 Sobic002G285525 Sobic004G108900--Sobic002G285525 Sobic004G128800 Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic004G128800 Sobic004G108900--Sobic001G457100 Sobic004G224300 Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic004G224300 Sobic004G108900--Sobic002G121701 Sobic007G124800--Sobic001G174300 Sobic007G124800--Sobic001G316500 Sobic008G108000 Sobic008G108000 Sobic007G124800--Sobic008G108000 Sobic007G124800--Sobic010G217001 Sobic004G045700 Sobic004G045700 Sobic007G124800--Sobic004G045700 Sobic008G086300 Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic008G086300 Sobic007G124800--Sobic001G027400 Sobic008G007200 Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic008G007200 Sobic007G124800--Sobic002G202200
Octagon: transcription factors


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