Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G069200.1
Synonym Sb01g006250
Functional annotation expressed protein
UniProt C5WZ19
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g56860.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a008420
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G027400 - -
2 Sobic.010G097800 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
3 Sobic.007G157200 - -
4 Sobic.001G174300 GRAS family transcription factor containing protein, expressed -
5 Sobic.003G279600 - -
6 Sobic.002G245600 expressed protein -
7 Sobic.002G138200 domain of unknown function DUF966 domain containing protein, expressed -
8 Sobic.001G490600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@ribosomal L18p/L5e family protein, putative, expressed -
9 Sobic.005G230700 SCARECROW, putative, expressed -
10 Sobic.004G047001 - -
11 Sobic.002G234900 zinc-binding alcohol dehydrogenase domain-containing protein 2, putative, expressed -
12 Sobic.001G309000 glycosyl hydrolases family 16, putative, expressed K08235: xyloglucan:xyloglucosyl transferase
13 Sobic.002G076932 - -
14 Sobic.003G178400 - -
15 Sobic.001G212701 - -
16 Sobic.002G035100 - -
17 Sobic.009G184500 cysteine proteinase inhibitor precursor protein, putative, expressed -
18 Sobic.002G161200 OsSub44 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
19 Sobic.002G417201 - -
20 Sobic.003G294000 protein kinase domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic001G069200 Sobic001G069200 Sobic001G027400 Sobic001G027400 Sobic001G069200--Sobic001G027400 Sobic010G097800 Sobic010G097800 Sobic001G069200--Sobic010G097800 Sobic007G157200 Sobic007G157200 Sobic001G069200--Sobic007G157200 Sobic001G174300 Sobic001G174300 Sobic001G069200--Sobic001G174300 Sobic003G279600 Sobic003G279600 Sobic001G069200--Sobic003G279600 Sobic002G245600 Sobic002G245600 Sobic001G069200--Sobic002G245600 Sobic002G138200 Sobic002G138200 Sobic001G069200--Sobic002G138200 Sobic001G490600 Sobic001G490600 Sobic001G069200--Sobic001G490600 Sobic005G230700 Sobic005G230700 Sobic001G069200--Sobic005G230700 Sobic001G027400--Sobic010G097800 Sobic003G304900 Sobic003G304900 Sobic001G027400--Sobic003G304900 Sobic008G007100 Sobic008G007100 Sobic001G027400--Sobic008G007100 Sobic001G027400--Sobic001G174300 Sobic009G242032 Sobic009G242032 Sobic001G027400--Sobic009G242032 Sobic001G027400--Sobic007G157200 Sobic001G027400--Sobic005G230700 Sobic007G124800 Sobic007G124800 Sobic001G027400--Sobic007G124800 Sobic003G005332 Sobic003G005332 Sobic001G027400--Sobic003G005332 Sobic010G097800--Sobic007G157200 Sobic001G212701 Sobic001G212701 Sobic010G097800--Sobic001G212701 Sobic010G097800--Sobic001G027400 Sobic010G097800--Sobic003G279600 Sobic002G161200 Sobic002G161200 Sobic010G097800--Sobic002G161200 Sobic010G097800--Sobic002G138200 Sobic010G009532 Sobic010G009532 Sobic010G097800--Sobic010G009532 Sobic007G090406 Sobic007G090406 Sobic010G097800--Sobic007G090406 Sobic001G176800 Sobic001G176800 Sobic010G097800--Sobic001G176800 Sobic007G157200--Sobic010G097800 Sobic007G157200--Sobic001G212701 Sobic007G157200--Sobic003G279600 Sobic004G184500 Sobic004G184500 Sobic007G157200--Sobic004G184500 Sobic002G114600 Sobic002G114600 Sobic007G157200--Sobic002G114600 Sobic010G132300 Sobic010G132300 Sobic007G157200--Sobic010G132300 Sobic007G157200--Sobic001G176800 Sobic009G184500 Sobic009G184500 Sobic007G157200--Sobic009G184500 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic007G157200--Sobic002G018133 Sobic001G174300--Sobic007G124800 Sobic001G174300--Sobic001G027400 Sobic010G217001 Sobic010G217001 Sobic001G174300--Sobic010G217001 Sobic001G316500 Sobic001G316500 Sobic001G174300--Sobic001G316500 Sobic001G174300--Sobic002G138200 Sobic005G066800 Sobic005G066800 Sobic001G174300--Sobic005G066800 Sobic001G174300--Sobic007G157200 Sobic010G059900 Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic010G059900 Sobic001G174300--Sobic003G304900 Sobic003G178400 Sobic003G178400 Sobic003G279600--Sobic003G178400 Sobic004G160950 Sobic004G160950 Sobic003G279600--Sobic004G160950 Sobic001G309000 Sobic001G309000 Sobic003G279600--Sobic001G309000 Sobic002G284701 Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic002G284701 Sobic003G279600--Sobic010G132300 Sobic003G279600--Sobic007G157200 Sobic002G188100 Sobic002G188100 Sobic003G279600--Sobic002G188100 Sobic004G069600 Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic004G069600 Sobic003G279600--Sobic001G212701 Sobic003G294000 Sobic003G294000 Sobic002G245600--Sobic003G294000 Sobic007G209400 Sobic007G209400 Sobic002G245600--Sobic007G209400 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic002G245600--Sobic009G094000 Sobic004G279150 Sobic004G279150 Sobic002G245600--Sobic004G279150 Sobic009G127600 Sobic009G127600 Sobic002G245600--Sobic009G127600 Sobic001G434450 Sobic001G434450 Sobic002G245600--Sobic001G434450 Sobic006G256801 Sobic006G256801 Sobic002G245600--Sobic006G256801 Sobic002G245600--Sobic007G157200 Sobic006G167200 Sobic006G167200 Sobic002G245600--Sobic006G167200 Sobic004G288900 Sobic004G288900 Sobic002G138200--Sobic004G288900 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic002G138200--Sobic003G043650 Sobic004G047001 Sobic004G047001 Sobic002G138200--Sobic004G047001 Sobic003G093500 Sobic003G093500 Sobic002G138200--Sobic003G093500 Sobic002G138200--Sobic009G184500 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic002G138200--Sobic001G214400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic002G138200--Sobic010G041500 Sobic005G094500 Sobic005G094500 Sobic002G138200--Sobic005G094500 Sobic007G017300 Sobic007G017300 Sobic002G138200--Sobic007G017300 Sobic001G490600--Sobic009G184500 Sobic001G368000 Sobic001G368000 Sobic001G490600--Sobic001G368000 Sobic001G490600--Sobic007G017300 Sobic009G004500 Sobic009G004500 Sobic001G490600--Sobic009G004500 Sobic001G312801 Sobic001G312801 Sobic001G490600--Sobic001G312801 Sobic008G185000 Sobic008G185000 Sobic001G490600--Sobic008G185000 Sobic009G170301 Sobic009G170301 Sobic001G490600--Sobic009G170301 Sobic001G483200 Sobic001G483200 Sobic001G490600--Sobic001G483200 Sobic005G155001 Sobic005G155001 Sobic001G490600--Sobic005G155001 Sobic005G230700--Sobic001G027400 Sobic003G371900 Sobic003G371900 Sobic005G230700--Sobic003G371900 Sobic005G230700--Sobic001G174300 Sobic002G202200 Sobic002G202200 Sobic005G230700--Sobic002G202200 Sobic001G006900 Sobic001G006900 Sobic005G230700--Sobic001G006900 Sobic009G027550 Sobic009G027550 Sobic005G230700--Sobic009G027550 Sobic008G134000 Sobic008G134000 Sobic005G230700--Sobic008G134000 Sobic004G108900 Sobic004G108900 Sobic005G230700--Sobic004G108900 Sobic005G230700--Sobic007G124800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.