Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G215866.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0W5E7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047150
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G279900 tRNA-splicing endonuclease positive effector-related, putative, expressed K10706: SETX, senataxin
2 Sobic.003G008200 thioesterase family protein, putative, expressed -
3 Sobic.008G123700 expressed protein -
4 Sobic.004G208201 - -
5 Sobic.006G205800 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@plant protein of unknown function domain containing protein, expressed -
6 Sobic.004G233100 - -
7 Sobic.009G206900 - -
8 Sobic.004G061100 - -
9 Sobic.001G476201 - -
10 Sobic.003G223600 hydroquinone glucosyltransferase, putative, expressed K08237: hydroquinone glucosyltransferase
11 Sobic.009G116832 - -
12 Sobic.006G224600 harpin-induced protein 1 domain containing protein, expressed -
13 Sobic.001G509901 - -
14 Sobic.002G417101 - -
15 Sobic.010G227600 - -
16 Sobic.009G248200 - -
17 Sobic.001G452800 - -
18 Sobic.004G121500 expansin precursor, putative, expressed -
19 Sobic.006G090450 - -
20 Sobic.008G142450 - -


Gene co-expression network
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Sobic001G476201--Sobic006G244900 Sobic006G024101 Sobic006G024101 Sobic001G476201--Sobic006G024101 Sobic007G151900 Sobic007G151900 Sobic001G476201--Sobic007G151900
Octagon: transcription factors


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