Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G229200.1
Synonym
Functional annotation zinc knuckle family protein, expressed
UniProt A0A1B6QCZ7
Pfam -
Panther DB PTHR33075 PTHR33075:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os06g28300.1 : zinc knuckle family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G173366 - -
2 Sobic.007G129401 - -
3 Sobic.008G049000 diacylglycerol O-acyltransferase, putative, expressed -
4 Sobic.008G013900 O-methyltransferase, putative, expressed -
5 Sobic.003G219000 integral membrane protein TmpA, putative, expressed -
6 Sobic.010G114600 expressed protein -
7 Sobic.008G124100 - -
8 Sobic.002G060500 OsFBX237 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.003G416100 flowering promoting factor-like 1, putative, expressed -
10 Sobic.006G240000 - -
11 Sobic.001G164200 cytochrome P450, putative, expressed -
12 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
13 Sobic.009G196700 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@cytochrome P450, putative, expressed -
14 Sobic.008G108900 GRF zinc finger family protein, expressed -
15 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
16 Sobic.006G219250 - -
17 Sobic.007G059300 - -
18 Sobic.003G439400 OsDegp14 - Putative Deg protease homologue, expressed -
19 Sobic.005G136900 - -
20 Sobic.009G026400 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G229200 Sobic002G229200 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic002G229200--Sobic005G173366 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic002G229200--Sobic007G129401 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G229200--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic002G229200--Sobic008G013900 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic002G229200--Sobic003G219000 Sobic010G114600 Sobic010G114600 Sobic002G229200--Sobic010G114600 Sobic008G124100 Sobic008G124100 Sobic002G229200--Sobic008G124100 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic002G229200--Sobic002G060500 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic002G229200--Sobic003G416100 Sobic005G173366--Sobic007G129401 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G173366--Sobic009G026400 Sobic005G173366--Sobic002G060500 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G173366--Sobic005G043400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G173366--Sobic004G196500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G173366--Sobic009G101600 Sobic005G173366--Sobic003G416100 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G173366--SobicK010000 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic005G173366--Sobic007G059300 Sobic007G129401--Sobic009G026400 Sobic007G129401--Sobic002G060500 Sobic007G129401--Sobic005G173366 Sobic007G129401--Sobic004G196500 Sobic007G129401--Sobic008G013900 Sobic007G129401--Sobic005G043400 Sobic001G164200 Sobic001G164200 Sobic007G129401--Sobic001G164200 Sobic010G068200 Sobic010G068200 Sobic007G129401--Sobic010G068200 Sobic007G129401--Sobic009G101600 Sobic008G049000--Sobic003G219000 Sobic006G132200 Sobic006G132200 Sobic008G049000--Sobic006G132200 Sobic008G108900 Sobic008G108900 Sobic008G049000--Sobic008G108900 Sobic008G049000--Sobic001G164200 Sobic002G047100 Sobic002G047100 Sobic008G049000--Sobic002G047100 Sobic009G196700 Sobic009G196700 Sobic008G049000--Sobic009G196700 Sobic008G049000--Sobic008G013900 Sobic002G094500 Sobic002G094500 Sobic008G049000--Sobic002G094500 Sobic007G066050 Sobic007G066050 Sobic008G049000--Sobic007G066050 Sobic008G013900--Sobic001G164200 Sobic001G182300 Sobic001G182300 Sobic008G013900--Sobic001G182300 Sobic008G013900--Sobic008G124100 Sobic008G013900--Sobic003G219000 Sobic008G013900--Sobic007G129401 Sobic008G013900--Sobic008G049000 Sobic008G013900--Sobic002G094500 Sobic003G176100 Sobic003G176100 Sobic008G013900--Sobic003G176100 Sobic010G143400 Sobic010G143400 Sobic008G013900--Sobic010G143400 Sobic003G219000--Sobic008G049000 Sobic003G219000--Sobic001G182300 Sobic003G219000--Sobic008G013900 Sobic003G219000--Sobic001G164200 Sobic003G219000--Sobic002G094500 Sobic003G219000--Sobic002G060500 Sobic003G219000--Sobic007G066050 Sobic003G219000--Sobic007G129401 Sobic003G219000--Sobic006G132200 Sobic003G436900 Sobic003G436900 Sobic010G114600--Sobic003G436900 Sobic010G144000 Sobic010G144000 Sobic010G114600--Sobic010G144000 Sobic005G141801 Sobic005G141801 Sobic010G114600--Sobic005G141801 Sobic006G262200 Sobic006G262200 Sobic010G114600--Sobic006G262200 Sobic001G240400 Sobic001G240400 Sobic010G114600--Sobic001G240400 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic010G114600--Sobic004G092300 Sobic008G091900 Sobic008G091900 Sobic010G114600--Sobic008G091900 Sobic005G212600 Sobic005G212600 Sobic010G114600--Sobic005G212600 Sobic002G221200 Sobic002G221200 Sobic010G114600--Sobic002G221200 Sobic001G277000 Sobic001G277000 Sobic008G124100--Sobic001G277000 Sobic009G064766 Sobic009G064766 Sobic008G124100--Sobic009G064766 Sobic008G124100--Sobic008G013900 Sobic007G189800 Sobic007G189800 Sobic008G124100--Sobic007G189800 Sobic008G124100--Sobic003G176100 Sobic010G146200 Sobic010G146200 Sobic008G124100--Sobic010G146200 Sobic006G020600 Sobic006G020600 Sobic008G124100--Sobic006G020600 Sobic002G051400 Sobic002G051400 Sobic008G124100--Sobic002G051400 Sobic008G124100--Sobic001G164200 Sobic002G060500--Sobic009G026400 Sobic002G060500--Sobic009G101600 Sobic005G142200 Sobic005G142200 Sobic002G060500--Sobic005G142200 Sobic002G060500--SobicK010000 Sobic002G060500--Sobic004G196500 Sobic001G305400 Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic001G305400 Sobic002G060500--Sobic002G221200 Sobic002G060500--Sobic005G043400 Sobic002G060500--Sobic007G059300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic003G416100--Sobic002G051450 Sobic003G416100--Sobic005G173366 Sobic003G416100--Sobic002G060500 Sobic003G416100--Sobic007G129401 Sobic010G144100 Sobic010G144100 Sobic003G416100--Sobic010G144100 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic003G416100--Sobic009G085400 Sobic003G416100--Sobic005G141801 Sobic003G416100--SobicK010000 Sobic003G416100--Sobic009G026400
Octagon: transcription factors


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