Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G219250.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1B6PN00
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G154850 - K00029: E1.1.1.40, malate dehydrogenase (oxaloacetate-decarboxylating)(NADP+)
2 Sobic.005G173366 - -
3 Sobic.009G085400 acyl-activating enzyme 14, putative, expressed -
4 Sobic.002G229200 zinc knuckle family protein, expressed -
5 Sobic.005G136900 - -
6 Sobic.006G240000 - -
7 Sobic.005G090401 - -
8 Sobic.003G028600 phosphoribosylaminoimidazole carboxylase, chloroplast precursor, putative, expressed K11808: phosphoribosylaminoimidazole carboxylase
9 Sobic.002G336800 PPR repeat domain containing protein, putative, expressed -
10 Sobic.005G079025 - -
11 Sobic.002G144966 - K02997: RP-S9e, small subunit ribosomal protein S9e
12 Sobic.005G039500 signal recognition particle 54 kDa protein, putative, expressed K03106: SRP54, signal recognition particle subunit SRP54
13 Sobic.008G178500 NBS-LRR disease resistance protein, putative, expressed -
14 Sobic.009G007800 TruB family pseudouridylate synthase, putative, expressed K03177: truB, PUS4, tRNA pseudouridine55 synthase
15 Sobic.001G016201 - -
16 Sobic.008G101000 powdery mildew resistance protein PM3b, putative, expressed -
17 Sobic.010G114600 expressed protein -
18 Sobic.002G197300 MSH-like DNA mismatch repair protein, putative, expressed K08737: DNA mismatch repair protein MSH6
19 Sobic.006G262200 - -
20 Sobic.001G186500 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic006G219250 Sobic006G219250 Sobic005G154850 Sobic005G154850 Sobic006G219250--Sobic005G154850 Sobic005G173366 Sobic005G173366 Sobic006G219250--Sobic005G173366 Sobic009G085400 Sobic009G085400 Sobic006G219250--Sobic009G085400 Sobic002G229200 Sobic002G229200 Sobic006G219250--Sobic002G229200 Sobic005G136900 Sobic005G136900 Sobic006G219250--Sobic005G136900 Sobic006G240000 Sobic006G240000 Sobic006G219250--Sobic006G240000 Sobic005G090401 Sobic005G090401 Sobic006G219250--Sobic005G090401 Sobic003G028600 Sobic003G028600 Sobic006G219250--Sobic003G028600 Sobic002G336800 Sobic002G336800 Sobic006G219250--Sobic002G336800 Sobic005G061601 Sobic005G061601 Sobic005G154850--Sobic005G061601 Sobic005G154850--Sobic005G090401 Sobic008G068500 Sobic008G068500 Sobic005G154850--Sobic008G068500 Sobic003G216100 Sobic003G216100 Sobic005G154850--Sobic003G216100 Sobic006G114000 Sobic006G114000 Sobic005G154850--Sobic006G114000 Sobic003G113200 Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic003G113200 Sobic005G154850--Sobic006G240000 Sobic003G439400 Sobic003G439400 Sobic005G154850--Sobic003G439400 Sobic008G026200 Sobic008G026200 Sobic005G154850--Sobic008G026200 Sobic007G129401 Sobic007G129401 Sobic005G173366--Sobic007G129401 Sobic009G026400 Sobic009G026400 Sobic005G173366--Sobic009G026400 Sobic002G060500 Sobic002G060500 Sobic005G173366--Sobic002G060500 Sobic005G043400 Sobic005G043400 Sobic005G173366--Sobic005G043400 Sobic004G196500 Sobic004G196500 Sobic005G173366--Sobic004G196500 Sobic009G101600 Sobic009G101600 Sobic005G173366--Sobic009G101600 Sobic003G416100 Sobic003G416100 Sobic005G173366--Sobic003G416100 SobicK010000 SobicK010000 Sobic005G173366--SobicK010000 Sobic007G059300 Sobic007G059300 Sobic005G173366--Sobic007G059300 Sobic009G085400--Sobic003G416100 Sobic010G248600 Sobic010G248600 Sobic009G085400--Sobic010G248600 Sobic006G214400 Sobic006G214400 Sobic009G085400--Sobic006G214400 Sobic002G114700 Sobic002G114700 Sobic009G085400--Sobic002G114700 Sobic003G106200 Sobic003G106200 Sobic009G085400--Sobic003G106200 Sobic005G046500 Sobic005G046500 Sobic009G085400--Sobic005G046500 Sobic004G035000 Sobic004G035000 Sobic009G085400--Sobic004G035000 Sobic007G002000 Sobic007G002000 Sobic009G085400--Sobic007G002000 Sobic009G085400--Sobic005G173366 Sobic002G229200--Sobic005G173366 Sobic002G229200--Sobic007G129401 Sobic008G049000 Sobic008G049000 Sobic002G229200--Sobic008G049000 Sobic008G013900 Sobic008G013900 Sobic002G229200--Sobic008G013900 Sobic003G219000 Sobic003G219000 Sobic002G229200--Sobic003G219000 Sobic010G114600 Sobic010G114600 Sobic002G229200--Sobic010G114600 Sobic008G124100 Sobic008G124100 Sobic002G229200--Sobic008G124100 Sobic002G229200--Sobic002G060500 Sobic002G229200--Sobic003G416100 Sobic001G186500 Sobic001G186500 Sobic005G136900--Sobic001G186500 Sobic005G210300 Sobic005G210300 Sobic005G136900--Sobic005G210300 Sobic005G136900--Sobic005G173366 Sobic008G045166 Sobic008G045166 Sobic005G136900--Sobic008G045166 Sobic005G136900--Sobic006G114000 Sobic005G136900--Sobic005G154850 Sobic004G092300 Sobic004G092300 Sobic005G136900--Sobic004G092300 Sobic005G136900--Sobic005G061601 Sobic005G136900--Sobic006G240000 Sobic006G240000--Sobic006G114000 Sobic006G240000--Sobic003G216100 Sobic006G240000--Sobic005G154850 Sobic008G026100 Sobic008G026100 Sobic006G240000--Sobic008G026100 Sobic006G240000--Sobic004G092300 Sobic002G051450 Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic002G051450 Sobic006G240000--Sobic008G068500 Sobic001G415600 Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic001G415600 Sobic006G240000--Sobic005G061601 Sobic004G007100 Sobic004G007100 Sobic005G090401--Sobic004G007100 Sobic006G182900 Sobic006G182900 Sobic005G090401--Sobic006G182900 Sobic006G048500 Sobic006G048500 Sobic005G090401--Sobic006G048500 Sobic006G048600 Sobic006G048600 Sobic005G090401--Sobic006G048600 Sobic002G173000 Sobic002G173000 Sobic005G090401--Sobic002G173000 Sobic002G243900 Sobic002G243900 Sobic005G090401--Sobic002G243900 Sobic005G110200 Sobic005G110200 Sobic005G090401--Sobic005G110200 Sobic007G161300 Sobic007G161300 Sobic005G090401--Sobic007G161300 Sobic005G032800 Sobic005G032800 Sobic005G090401--Sobic005G032800 Sobic005G225800 Sobic005G225800 Sobic003G028600--Sobic005G225800 Sobic006G105400 Sobic006G105400 Sobic003G028600--Sobic006G105400 Sobic001G035900 Sobic001G035900 Sobic003G028600--Sobic001G035900 Sobic007G161000 Sobic007G161000 Sobic003G028600--Sobic007G161000 Sobic007G185700 Sobic007G185700 Sobic003G028600--Sobic007G185700 Sobic004G258700 Sobic004G258700 Sobic003G028600--Sobic004G258700 Sobic006G274600 Sobic006G274600 Sobic003G028600--Sobic006G274600 Sobic003G028600--Sobic004G035000 Sobic001G028100 Sobic001G028100 Sobic003G028600--Sobic001G028100 Sobic005G079025 Sobic005G079025 Sobic002G336800--Sobic005G079025 Sobic008G011100 Sobic008G011100 Sobic002G336800--Sobic008G011100 Sobic004G087600 Sobic004G087600 Sobic002G336800--Sobic004G087600 Sobic003G144950 Sobic003G144950 Sobic002G336800--Sobic003G144950 Sobic006G078600 Sobic006G078600 Sobic002G336800--Sobic006G078600 Sobic009G005100 Sobic009G005100 Sobic002G336800--Sobic009G005100 Sobic009G007800 Sobic009G007800 Sobic002G336800--Sobic009G007800 Sobic001G360900 Sobic001G360900 Sobic002G336800--Sobic001G360900 Sobic009G103600 Sobic009G103600 Sobic002G336800--Sobic009G103600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.