Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G264100.1
Synonym Sb02g029870
Functional annotation transcription factor RF2a, putative, expressed
UniProt C5X5E5
Pfam PF00170
Panther DB PTHR13690 PTHR13690:SF80
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0006355; regulation of transcription, DNA-templated GO:0003700DNA-binding transcription factor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G31370 : Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g34060.1 : transcription factor RF2a, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014347 , Zm00025a047690
Brachypodium KQJ90976 , KQJ91037
Barley HORVU5Hr1G079160.13 , HORVU5Hr1G079160.10 , HORVU5Hr1G079160.11 , HORVU5Hr1G079160.1 , HORVU5Hr1G079160.2 , HORVU5Hr1G079160.3 , HORVU5Hr1G079160.4 , HORVU5Hr1G079160.5 , HORVU5Hr1G079160.6 , HORVU5Hr1G079160.7 , HORVU5Hr1G079160.9
Wheat TraesCS5A02G299400 , TraesCS5B02G301900 , TraesCS5D02G308600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G264100


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Gene co-expression network
sample Sobic002G264100 Sobic002G264100 Sobic001G205600 Sobic001G205600 Sobic002G264100--Sobic001G205600 Sobic003G440100 Sobic003G440100 Sobic002G264100--Sobic003G440100 Sobic009G247601 Sobic009G247601 Sobic002G264100--Sobic009G247601 Sobic010G091366 Sobic010G091366 Sobic002G264100--Sobic010G091366 Sobic003G318350 Sobic003G318350 Sobic002G264100--Sobic003G318350 Sobic007G003300 Sobic007G003300 Sobic002G264100--Sobic007G003300 Sobic002G292400 Sobic002G292400 Sobic002G264100--Sobic002G292400 Sobic006G223700 Sobic006G223700 Sobic002G264100--Sobic006G223700 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic002G264100--Sobic003G146450 Sobic007G145300 Sobic007G145300 Sobic001G205600--Sobic007G145300 Sobic009G197350 Sobic009G197350 Sobic001G205600--Sobic009G197350 Sobic009G156700 Sobic009G156700 Sobic001G205600--Sobic009G156700 Sobic002G269800 Sobic002G269800 Sobic001G205600--Sobic002G269800 Sobic002G124766 Sobic002G124766 Sobic001G205600--Sobic002G124766 Sobic003G126700 Sobic003G126700 Sobic001G205600--Sobic003G126700 Sobic001G205600--Sobic003G440100 Sobic001G205600--Sobic007G003300 Sobic001G205600--Sobic006G223700 Sobic003G440100--Sobic007G145300 Sobic003G440100--Sobic009G197350 Sobic003G440100--Sobic009G156700 Sobic003G242300 Sobic003G242300 Sobic003G440100--Sobic003G242300 Sobic003G440100--Sobic002G124766 Sobic002G082350 Sobic002G082350 Sobic003G440100--Sobic002G082350 Sobic003G440100--Sobic002G269800 Sobic010G064050 Sobic010G064050 Sobic003G440100--Sobic010G064050 Sobic001G100650 Sobic001G100650 Sobic003G440100--Sobic001G100650 Sobic009G247601--Sobic007G145300 Sobic009G247601--Sobic009G197350 Sobic009G247601--Sobic009G156700 Sobic009G247601--Sobic007G003300 Sobic008G191800 Sobic008G191800 Sobic009G247601--Sobic008G191800 Sobic009G247601--Sobic002G269800 Sobic009G247601--Sobic003G126700 Sobic009G247601--Sobic002G124766 Sobic009G247601--Sobic006G223700 Sobic005G181700 Sobic005G181700 Sobic010G091366--Sobic005G181700 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic010G091366--Sobic002G069601 Sobic003G318400 Sobic003G318400 Sobic010G091366--Sobic003G318400 Sobic007G059800 Sobic007G059800 Sobic010G091366--Sobic007G059800 Sobic003G034250 Sobic003G034250 Sobic010G091366--Sobic003G034250 Sobic006G053500 Sobic006G053500 Sobic010G091366--Sobic006G053500 Sobic004G082200 Sobic004G082200 Sobic010G091366--Sobic004G082200 Sobic009G150100 Sobic009G150100 Sobic010G091366--Sobic009G150100 Sobic004G201200 Sobic004G201200 Sobic010G091366--Sobic004G201200 Sobic008G154200 Sobic008G154200 Sobic003G318350--Sobic008G154200 Sobic003G318350--Sobic003G126700 Sobic003G318350--Sobic006G223700 Sobic003G064000 Sobic003G064000 Sobic003G318350--Sobic003G064000 Sobic003G318350--Sobic002G269800 Sobic003G372950 Sobic003G372950 Sobic003G318350--Sobic003G372950 Sobic004G286450 Sobic004G286450 Sobic003G318350--Sobic004G286450 Sobic006G167850 Sobic006G167850 Sobic003G318350--Sobic006G167850 Sobic007G193000 Sobic007G193000 Sobic003G318350--Sobic007G193000 Sobic007G003300--Sobic007G145300 Sobic007G003300--Sobic009G197350 Sobic007G003300--Sobic009G156700 Sobic007G003300--Sobic002G269800 Sobic007G003300--Sobic002G124766 Sobic007G003300--Sobic003G126700 Sobic007G003300--Sobic002G082350 Sobic007G003300--Sobic006G223700 Sobic007G003300--Sobic007G193000 Sobic007G183500 Sobic007G183500 Sobic002G292400--Sobic007G183500 Sobic002G292400--Sobic001G205600 Sobic005G026500 Sobic005G026500 Sobic002G292400--Sobic005G026500 Sobic002G292400--Sobic006G223700 Sobic002G292400--Sobic003G318350 Sobic004G149433 Sobic004G149433 Sobic002G292400--Sobic004G149433 Sobic001G423900 Sobic001G423900 Sobic002G292400--Sobic001G423900 Sobic002G292400--Sobic007G003300 Sobic003G088300 Sobic003G088300 Sobic002G292400--Sobic003G088300 Sobic006G223700--Sobic003G126700 Sobic006G223700--Sobic002G269800 Sobic006G223700--Sobic008G154200 Sobic006G223700--Sobic009G156700 Sobic006G223700--Sobic009G197350 Sobic006G223700--Sobic003G064000 Sobic006G223700--Sobic007G145300 Sobic006G223700--Sobic007G193000 Sobic006G223700--Sobic002G124766 Sobic003G146450--Sobic006G223700 Sobic003G146450--Sobic003G126700 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic003G146450--Sobic002G342901 Sobic007G154001 Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic007G154001 Sobic003G146450--Sobic002G269800 Sobic003G146450--Sobic008G154200 Sobic003G146450--Sobic009G156700 Sobic003G146450--Sobic009G197350 Sobic003G146450--Sobic003G064000
Octagon: transcription factors


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