Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G303200.1
Synonym Sb02g033360
Functional annotation -
UniProt C5X8K7
Pfam PF10157
Panther DB PTHR39708
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G23330 : -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) Zm00025a014629
Brachypodium PNT75109
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G303200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G084701 - -
2 Sobic.007G223100 adenylate kinase, putative, expressed K13800: CMPK1, UMP-CMP kinase
3 Sobic.004G251701 - -
4 Sobic.001G088450 - -
5 Sobic.001G313150 - -
6 Sobic.010G276500 - -
7 Sobic.003G214850 - -
8 Sobic.005G151000 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G155700 LSM domain containing protein, expressed -
10 Sobic.005G067966 - -
11 Sobic.003G431200 expressed protein -
12 Sobic.005G063200 expressed protein -
13 Sobic.007G218600 phosphoribosyl transferase, putative, expressed K00761: upp, uracil phosphoribosyltransferase
14 Sobic.004G252850 - -
15 Sobic.004G353300 growth regulator related protein, putative, expressed -
16 Sobic.002G147200 esterase/lipase/thioesterase, putative, expressed -
17 Sobic.001G424800 myosin heavy chain-related, putative, expressed -
18 Sobic.001G305200 expressed protein -
19 Sobic.005G034900 - -
20 Sobic.007G216800 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic002G303200 Sobic002G303200 Sobic006G084701 Sobic006G084701 Sobic002G303200--Sobic006G084701 Sobic007G223100 Sobic007G223100 Sobic002G303200--Sobic007G223100 Sobic004G251701 Sobic004G251701 Sobic002G303200--Sobic004G251701 Sobic001G088450 Sobic001G088450 Sobic002G303200--Sobic001G088450 Sobic001G313150 Sobic001G313150 Sobic002G303200--Sobic001G313150 Sobic010G276500 Sobic010G276500 Sobic002G303200--Sobic010G276500 Sobic003G214850 Sobic003G214850 Sobic002G303200--Sobic003G214850 Sobic005G151000 Sobic005G151000 Sobic002G303200--Sobic005G151000 Sobic004G155700 Sobic004G155700 Sobic002G303200--Sobic004G155700 Sobic003G089900 Sobic003G089900 Sobic006G084701--Sobic003G089900 Sobic007G172900 Sobic007G172900 Sobic006G084701--Sobic007G172900 Sobic006G084701--Sobic005G151000 Sobic009G096566 Sobic009G096566 Sobic006G084701--Sobic009G096566 Sobic003G120200 Sobic003G120200 Sobic006G084701--Sobic003G120200 Sobic002G105501 Sobic002G105501 Sobic006G084701--Sobic002G105501 Sobic007G220066 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Octagon: transcription factors


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