Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G352900.1
Synonym
Functional annotation DEFL49 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
UniProt A0A1B6QF59 , A0A109NDJ1
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g31250.1 : DEFL49 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G352900


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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14 Sobic.001G138500 expressed protein -
15 Sobic.001G190600 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
16 Sobic.006G137900 heavy metal-associated domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G207550 - -
18 Sobic.004G181100 expressed protein -
19 Sobic.003G021401 - -
20 Sobic.002G188800 anthocyanin 3-O-beta-glucosyltransferase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic002G352900 Sobic002G352900 Sobic003G407400 Sobic003G407400 Sobic002G352900--Sobic003G407400 Sobic001G060001 Sobic001G060001 Sobic002G352900--Sobic001G060001 Sobic010G146350 Sobic010G146350 Sobic002G352900--Sobic010G146350 Sobic003G120050 Sobic003G120050 Sobic002G352900--Sobic003G120050 Sobic007G120600 Sobic007G120600 Sobic002G352900--Sobic007G120600 Sobic005G207600 Sobic005G207600 Sobic002G352900--Sobic005G207600 Sobic008G024000 Sobic008G024000 Sobic002G352900--Sobic008G024000 Sobic004G052700 Sobic004G052700 Sobic002G352900--Sobic004G052700 Sobic008G096401 Sobic008G096401 Sobic002G352900--Sobic008G096401 Sobic004G325150 Sobic004G325150 Sobic003G407400--Sobic004G325150 Sobic006G137900 Sobic006G137900 Sobic003G407400--Sobic006G137900 Sobic005G207550 Sobic005G207550 Sobic003G407400--Sobic005G207550 Sobic001G138500 Sobic001G138500 Sobic003G407400--Sobic001G138500 Sobic005G013700 Sobic005G013700 Sobic003G407400--Sobic005G013700 Sobic001G190600 Sobic001G190600 Sobic003G407400--Sobic001G190600 Sobic003G407400--Sobic005G207600 Sobic003G407400--Sobic010G146350 Sobic004G122700 Sobic004G122700 Sobic003G407400--Sobic004G122700 Sobic001G060001--Sobic007G120600 Sobic001G060001--Sobic004G052700 Sobic001G060001--Sobic008G096401 Sobic001G060001--Sobic010G146350 Sobic001G060001--Sobic005G207600 Sobic010G228200 Sobic010G228200 Sobic001G060001--Sobic010G228200 Sobic004G181100 Sobic004G181100 Sobic001G060001--Sobic004G181100 Sobic010G267651 Sobic010G267651 Sobic001G060001--Sobic010G267651 Sobic006G042800 Sobic006G042800 Sobic001G060001--Sobic006G042800 Sobic010G146350--Sobic005G207600 Sobic010G146350--Sobic010G228200 Sobic010G146350--Sobic007G120600 Sobic010G146350--Sobic001G060001 Sobic010G146350--Sobic001G190600 Sobic010G146350--Sobic005G207550 Sobic010G146350--Sobic004G052700 Sobic010G146350--Sobic008G096401 Sobic010G146350--Sobic006G137900 Sobic003G021401 Sobic003G021401 Sobic003G120050--Sobic003G021401 Sobic003G023100 Sobic003G023100 Sobic003G120050--Sobic003G023100 Sobic008G008601 Sobic008G008601 Sobic003G120050--Sobic008G008601 Sobic001G452300 Sobic001G452300 Sobic003G120050--Sobic001G452300 Sobic004G013400 Sobic004G013400 Sobic003G120050--Sobic004G013400 Sobic003G120050--Sobic006G137900 Sobic003G120050--Sobic001G138500 Sobic003G120050--Sobic005G207600 Sobic003G120050--Sobic001G190600 Sobic007G120600--Sobic004G052700 Sobic007G120600--Sobic008G096401 Sobic007G120600--Sobic001G060001 Sobic007G120600--Sobic010G146350 Sobic007G120600--Sobic005G207600 Sobic007G120600--Sobic010G267651 Sobic007G120600--Sobic004G181100 Sobic007G120600--Sobic010G228200 Sobic002G188800 Sobic002G188800 Sobic007G120600--Sobic002G188800 Sobic005G207600--Sobic010G146350 Sobic005G207600--Sobic010G228200 Sobic005G207600--Sobic001G190600 Sobic005G207600--Sobic005G207550 Sobic005G207600--Sobic001G060001 Sobic005G207600--Sobic007G120600 Sobic005G207600--Sobic006G137900 Sobic005G207600--Sobic001G138500 Sobic005G207600--Sobic004G052700 Sobic007G100900 Sobic007G100900 Sobic008G024000--Sobic007G100900 Sobic008G024000--Sobic003G120050 Sobic008G024000--Sobic006G137900 Sobic008G024000--Sobic004G013400 Sobic008G024000--Sobic001G138500 Sobic008G024000--Sobic008G008601 Sobic008G024000--Sobic004G122700 Sobic008G024000--Sobic001G452300 Sobic008G024000--Sobic001G190600 Sobic004G052700--Sobic008G096401 Sobic004G052700--Sobic007G120600 Sobic004G052700--Sobic001G060001 Sobic004G052700--Sobic004G181100 Sobic004G052700--Sobic006G042800 Sobic004G052700--Sobic010G267651 Sobic004G052700--Sobic002G188800 Sobic004G052700--Sobic010G146350 Sobic002G159400 Sobic002G159400 Sobic004G052700--Sobic002G159400 Sobic008G096401--Sobic004G052700 Sobic008G096401--Sobic007G120600 Sobic008G096401--Sobic001G060001 Sobic008G096401--Sobic004G181100 Sobic008G096401--Sobic006G042800 Sobic008G096401--Sobic010G267651 Sobic008G096401--Sobic002G188800 Sobic008G096401--Sobic010G146350 Sobic008G096401--Sobic002G159400
Octagon: transcription factors


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