Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G002900.1
Synonym YSL7, Sb03g000430
Functional annotation -
UniProt A0A1B6Q0K0
Pfam PF03169
Panther DB PTHR31645 PTHR31645:SF15
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G65730 : YELLOW STRIPE like 7
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g13710.1 : transposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036017 , Zm00025a056537
Brachypodium KQJ83669
Barley -
Wheat TraesCS2D02G373800 , TraesCS6A02G043100 , TraesCS2A02G377200 , TraesCS2B02G394400
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G510500 CCT motif family protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@CCT motif family protein, expressed -
2 Sobic.008G142301 - -
3 Sobic.003G233300 expressed protein -
4 Sobic.002G176900 proton pump interactor, putative, expressed -
5 Sobic.005G083866 - -
6 Sobic.001G311700 - -
7 Sobic.002G331200 - -
8 Sobic.009G031700 expressed protein -
9 Sobic.001G345366 - -
10 Sobic.006G201450 - -
11 Sobic.009G144050 - -
12 Sobic.004G188201 - -
13 Sobic.010G011001 - -
14 Sobic.003G043650 - -
15 Sobic.002G030001 - -
16 Sobic.008G019466 - -
17 Sobic.007G081400 - -
18 Sobic.002G331700 expressed protein -
19 Sobic.008G054400 expressed protein -
20 Sobic.006G045301 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G002900 Sobic003G002900 Sobic001G510500 Sobic001G510500 Sobic003G002900--Sobic001G510500 Sobic008G142301 Sobic008G142301 Sobic003G002900--Sobic008G142301 Sobic003G233300 Sobic003G233300 Sobic003G002900--Sobic003G233300 Sobic002G176900 Sobic002G176900 Sobic003G002900--Sobic002G176900 Sobic005G083866 Sobic005G083866 Sobic003G002900--Sobic005G083866 Sobic001G311700 Sobic001G311700 Sobic003G002900--Sobic001G311700 Sobic002G331200 Sobic002G331200 Sobic003G002900--Sobic002G331200 Sobic009G031700 Sobic009G031700 Sobic003G002900--Sobic009G031700 Sobic001G345366 Sobic001G345366 Sobic003G002900--Sobic001G345366 Sobic009G174800 Sobic009G174800 Sobic001G510500--Sobic009G174800 Sobic001G510500--Sobic003G002900 Sobic004G357600 Sobic004G357600 Sobic001G510500--Sobic004G357600 Sobic005G231000 Sobic005G231000 Sobic001G510500--Sobic005G231000 Sobic008G165500 Sobic008G165500 Sobic001G510500--Sobic008G165500 Sobic004G138100 Sobic004G138100 Sobic001G510500--Sobic004G138100 Sobic006G045301 Sobic006G045301 Sobic001G510500--Sobic006G045301 Sobic008G012200 Sobic008G012200 Sobic001G510500--Sobic008G012200 Sobic009G011000 Sobic009G011000 Sobic001G510500--Sobic009G011000 Sobic010G011001 Sobic010G011001 Sobic008G142301--Sobic010G011001 Sobic008G142301--Sobic003G233300 Sobic009G188750 Sobic009G188750 Sobic008G142301--Sobic009G188750 Sobic006G185700 Sobic006G185700 Sobic008G142301--Sobic006G185700 Sobic005G139000 Sobic005G139000 Sobic008G142301--Sobic005G139000 Sobic009G024133 Sobic009G024133 Sobic008G142301--Sobic009G024133 Sobic008G142301--Sobic005G083866 Sobic008G142301--Sobic003G002900 Sobic007G203850 Sobic007G203850 Sobic008G142301--Sobic007G203850 Sobic008G019466 Sobic008G019466 Sobic003G233300--Sobic008G019466 Sobic002G331700 Sobic002G331700 Sobic003G233300--Sobic002G331700 Sobic003G233300--Sobic005G139000 Sobic003G233300--Sobic001G345366 Sobic007G094000 Sobic007G094000 Sobic003G233300--Sobic007G094000 Sobic003G233300--Sobic005G083866 Sobic008G112400 Sobic008G112400 Sobic003G233300--Sobic008G112400 Sobic003G233300--Sobic010G011001 Sobic003G233300--Sobic008G142301 Sobic010G266100 Sobic010G266100 Sobic002G176900--Sobic010G266100 Sobic001G251500 Sobic001G251500 Sobic002G176900--Sobic001G251500 Sobic005G023100 Sobic005G023100 Sobic002G176900--Sobic005G023100 Sobic003G374400 Sobic003G374400 Sobic002G176900--Sobic003G374400 Sobic006G218100 Sobic006G218100 Sobic002G176900--Sobic006G218100 Sobic007G213200 Sobic007G213200 Sobic002G176900--Sobic007G213200 Sobic002G176900--Sobic003G002900 Sobic005G138900 Sobic005G138900 Sobic002G176900--Sobic005G138900 Sobic001G536200 Sobic001G536200 Sobic002G176900--Sobic001G536200 Sobic003G043650 Sobic003G043650 Sobic005G083866--Sobic003G043650 Sobic004G200000 Sobic004G200000 Sobic005G083866--Sobic004G200000 Sobic007G016300 Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic007G016300 Sobic005G083866--Sobic002G331200 Sobic005G083866--Sobic001G311700 Sobic002G030001 Sobic002G030001 Sobic005G083866--Sobic002G030001 Sobic002G018133 Sobic002G018133 Sobic005G083866--Sobic002G018133 Sobic007G081400 Sobic007G081400 Sobic005G083866--Sobic007G081400 Sobic010G041500 Sobic010G041500 Sobic005G083866--Sobic010G041500 Sobic001G311700--Sobic005G083866 Sobic006G201450 Sobic006G201450 Sobic001G311700--Sobic006G201450 Sobic001G311700--Sobic007G203850 Sobic001G311700--Sobic006G045301 Sobic001G311700--Sobic007G081400 Sobic002G231400 Sobic002G231400 Sobic001G311700--Sobic002G231400 Sobic003G305250 Sobic003G305250 Sobic001G311700--Sobic003G305250 Sobic001G311700--Sobic004G200000 Sobic001G311700--Sobic002G030001 Sobic002G331200--Sobic007G016300 Sobic002G331200--Sobic005G083866 Sobic002G284300 Sobic002G284300 Sobic002G331200--Sobic002G284300 Sobic001G214400 Sobic001G214400 Sobic002G331200--Sobic001G214400 Sobic002G331200--Sobic004G200000 Sobic002G331200--Sobic008G112400 Sobic009G094000 Sobic009G094000 Sobic002G331200--Sobic009G094000 Sobic009G151500 Sobic009G151500 Sobic002G331200--Sobic009G151500 Sobic002G331200--Sobic003G043650 Sobic004G188201 Sobic004G188201 Sobic009G031700--Sobic004G188201 Sobic004G013500 Sobic004G013500 Sobic009G031700--Sobic004G013500 Sobic010G114500 Sobic010G114500 Sobic009G031700--Sobic010G114500 Sobic006G178700 Sobic006G178700 Sobic009G031700--Sobic006G178700 Sobic003G056400 Sobic003G056400 Sobic009G031700--Sobic003G056400 Sobic010G040000 Sobic010G040000 Sobic009G031700--Sobic010G040000 Sobic009G191800 Sobic009G191800 Sobic009G031700--Sobic009G191800 Sobic010G200800 Sobic010G200800 Sobic009G031700--Sobic010G200800 Sobic009G031100 Sobic009G031100 Sobic009G031700--Sobic009G031100 Sobic001G345366--Sobic004G200000 Sobic001G345366--Sobic007G016300 Sobic006G152900 Sobic006G152900 Sobic001G345366--Sobic006G152900 Sobic009G082500 Sobic009G082500 Sobic001G345366--Sobic009G082500 Sobic001G345366--Sobic003G043650 Sobic001G345366--Sobic002G331200 Sobic001G345366--Sobic005G083866 Sobic001G345366--Sobic006G201450 Sobic001G345366--Sobic002G030001
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.