Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G031700.1
Synonym Sb09g002670
Functional annotation expressed protein
UniProt C5YZH7
Pfam PF05664
Panther DB PTHR31280 PTHR31280:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G33420 : Protein of unknown function (DUF810)
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g04560.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a038152
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS1A02G150700 , TraesCS1B02G168300 , TraesCS1B02G168300 , TraesCS1D02G147700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G188201 - -
2 Sobic.004G013500 UDP-glucose Pyrophosphorylase(PubMedID : 26616172)@UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase, putative, expressed K00963: UGP2, galU, UTP--glucose-1-phosphate uridylyltransferase
3 Sobic.010G114500 tetraspanin family protein, putative, expressed -
4 Sobic.006G178700 expressed protein -
5 Sobic.003G056400 expressed protein -
6 Sobic.010G040000 expressed protein -
7 Sobic.009G191800 single-stranded DNA-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.010G200800 protein kinase domain containing protein, expressed -
9 Sobic.009G031100 cycloeucalenol cycloisomerase, putative, expressed K08246: cycloeucalenol cycloisomerase
10 Sobic.003G008850 - -
11 Sobic.009G152901 - -
12 Sobic.001G120100 DUF1295 domain containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.002G254600 expressed protein -
14 Sobic.004G197300 - -
15 Sobic.008G088863 - -
16 Sobic.002G396900 csAtPR5, putative, expressed -
17 Sobic.007G001300 "cell wall modification, deposition of casparian strips, endodermis, transmembrane"(PubMedID : 24920445)@membrane associated DUF588 domain containing protein, putative, expressed -
18 Sobic.008G164525 - -
19 Sobic.006G162700 - -
20 Sobic.001G537900 AGAP010609-PA, putative, expressed K17867: DPH4, diphthamide biosynthesis protein 4


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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