Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G027350.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VVI6
Pfam PF00271
Panther DB PTHR10799 PTHR10799:SF705
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G61140 : SNF2 domain-containing protein / helicase domain-containing protein / zinc finger protein-related
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g57110.1 : SNF2 family N-terminal domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G144201 - -
2 Sobic.008G181250 - -
3 Sobic.003G415200 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
4 Sobic.005G083220 - -
5 Sobic.009G019700 - -
6 Sobic.005G148100 - -
7 Sobic.005G189000 - -
8 Sobic.005G189800 - -
9 Sobic.010G136100 "kafirin seed storage protein, delta-kafirin precursor"(PubMedID : 21853065)@- -
10 Sobic.009G086100 peroxidase precursor, putative, expressed K00430: peroxidase
11 Sobic.004G207500 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
12 Sobic.002G273000 OsFBL7 - F-box domain and LRR containing protein, expressed -
13 Sobic.005G186250 - -
14 Sobic.003G326300 LTPL29 - Protease inhibitor/seed storage/LTP family protein precursor, expressed -
15 Sobic.003G415300 DEF1 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
16 Sobic.007G196100 ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase family protein, expressed K11844: ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16/45
17 Sobic.005G146000 - -
18 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
19 Sobic.009G196600 expressed protein -
20 Sobic.002G066000 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G027350 Sobic003G027350 Sobic008G144201 Sobic008G144201 Sobic003G027350--Sobic008G144201 Sobic008G181250 Sobic008G181250 Sobic003G027350--Sobic008G181250 Sobic003G415200 Sobic003G415200 Sobic003G027350--Sobic003G415200 Sobic005G083220 Sobic005G083220 Sobic003G027350--Sobic005G083220 Sobic009G019700 Sobic009G019700 Sobic003G027350--Sobic009G019700 Sobic005G148100 Sobic005G148100 Sobic003G027350--Sobic005G148100 Sobic005G189000 Sobic005G189000 Sobic003G027350--Sobic005G189000 Sobic005G189800 Sobic005G189800 Sobic003G027350--Sobic005G189800 Sobic010G136100 Sobic010G136100 Sobic003G027350--Sobic010G136100 Sobic008G144201--Sobic003G415200 Sobic008G144201--Sobic009G019700 Sobic008G144201--Sobic005G083220 Sobic008G144201--Sobic005G148100 Sobic008G144201--Sobic005G189000 Sobic008G144201--Sobic005G189800 Sobic008G144201--Sobic008G181250 Sobic009G086100 Sobic009G086100 Sobic008G144201--Sobic009G086100 Sobic008G144201--Sobic010G136100 Sobic008G181250--Sobic009G019700 Sobic008G181250--Sobic005G148100 Sobic008G181250--Sobic003G415200 Sobic008G181250--Sobic005G189800 Sobic008G181250--Sobic010G136100 Sobic008G181250--Sobic008G144201 Sobic008G181250--Sobic009G086100 Sobic009G196600 Sobic009G196600 Sobic008G181250--Sobic009G196600 Sobic008G181250--Sobic005G083220 Sobic003G415200--Sobic009G019700 Sobic003G415200--Sobic008G144201 Sobic003G415200--Sobic005G148100 Sobic003G415200--Sobic005G189800 Sobic003G415200--Sobic008G181250 Sobic003G415200--Sobic009G086100 Sobic003G415200--Sobic005G083220 Sobic003G415200--Sobic010G136100 Sobic003G415200--Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic005G189000 Sobic005G083220--Sobic008G144201 Sobic005G083220--Sobic003G415200 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic004G207500 Sobic005G083220--Sobic009G086100 Sobic005G083220--Sobic009G019700 Sobic005G083220--Sobic005G148100 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G083220--Sobic005G186250 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic005G083220--Sobic009G007100 Sobic009G019700--Sobic005G189800 Sobic009G019700--Sobic003G415200 Sobic009G019700--Sobic005G148100 Sobic009G019700--Sobic008G144201 Sobic009G019700--Sobic008G181250 Sobic009G019700--Sobic009G086100 Sobic009G019700--Sobic010G136100 Sobic009G019700--Sobic005G083220 Sobic009G019700--Sobic005G189000 Sobic005G148100--Sobic009G019700 Sobic005G148100--Sobic003G415200 Sobic005G148100--Sobic005G189800 Sobic005G148100--Sobic008G144201 Sobic005G148100--Sobic008G181250 Sobic005G148100--Sobic010G136100 Sobic005G148100--Sobic009G086100 Sobic005G148100--Sobic005G083220 Sobic005G146000 Sobic005G146000 Sobic005G148100--Sobic005G146000 Sobic005G189000--Sobic005G083220 Sobic005G189000--Sobic008G144201 Sobic005G189000--Sobic004G207500 Sobic005G189000--Sobic005G186250 Sobic005G189000--Sobic009G007100 Sobic005G189000--Sobic003G415200 Sobic005G189000--Sobic009G086100 Sobic005G189000--Sobic009G019700 Sobic003G326300 Sobic003G326300 Sobic005G189000--Sobic003G326300 Sobic005G189800--Sobic009G019700 Sobic005G189800--Sobic005G148100 Sobic005G189800--Sobic003G415200 Sobic005G189800--Sobic008G181250 Sobic005G189800--Sobic010G136100 Sobic005G189800--Sobic009G086100 Sobic005G189800--Sobic008G144201 Sobic005G189800--Sobic009G196600 Sobic005G189800--Sobic005G083220 Sobic010G136100--Sobic009G196600 Sobic010G136100--Sobic005G189800 Sobic010G136100--Sobic009G019700 Sobic010G136100--Sobic008G181250 Sobic010G136100--Sobic005G148100 Sobic001G220132 Sobic001G220132 Sobic010G136100--Sobic001G220132
Octagon: transcription factors


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