Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G211900.1
Synonym Sb03g027160
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XQA6
Pfam PF12937
Panther DB PTHR31264 PTHR31264:SF4
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G07610 : F-box family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g41950.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQJ97644
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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8 Sobic.002G174100 - -
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15 Sobic.010G202800 - -
16 Sobic.003G211233 - -
17 Sobic.002G193200 - -
18 Sobic.002G280950 - -
19 Sobic.009G250600 OsFBX35 - F-box domain containing protein, expressed -
20 Sobic.007G090439 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G211900 Sobic003G211900 Sobic002G382900 Sobic002G382900 Sobic003G211900--Sobic002G382900 Sobic007G060400 Sobic007G060400 Sobic003G211900--Sobic007G060400 Sobic004G276800 Sobic004G276800 Sobic003G211900--Sobic004G276800 Sobic004G210300 Sobic004G210300 Sobic003G211900--Sobic004G210300 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic003G211900--Sobic003G079532 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic003G211900--Sobic004G186400 Sobic002G350100 Sobic002G350100 Sobic003G211900--Sobic002G350100 Sobic002G174100 Sobic002G174100 Sobic003G211900--Sobic002G174100 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic003G211900--Sobic008G095766 Sobic002G382900--Sobic003G211900 Sobic002G382900--Sobic007G060400 Sobic002G382900--Sobic004G276800 Sobic002G382900--Sobic004G186400 Sobic002G382900--Sobic008G095766 Sobic002G382900--Sobic002G350100 Sobic002G382900--Sobic003G079532 Sobic009G250600 Sobic009G250600 Sobic002G382900--Sobic009G250600 Sobic002G382900--Sobic002G174100 Sobic007G060400--Sobic002G382900 Sobic007G060400--Sobic004G186400 Sobic007G060400--Sobic003G211900 Sobic004G041300 Sobic004G041300 Sobic007G060400--Sobic004G041300 Sobic007G060400--Sobic003G079532 Sobic010G027400 Sobic010G027400 Sobic007G060400--Sobic010G027400 Sobic007G060400--Sobic004G210300 Sobic010G235400 Sobic010G235400 Sobic007G060400--Sobic010G235400 Sobic007G060400--Sobic008G095766 Sobic004G276800--Sobic002G382900 Sobic004G276800--Sobic003G211900 Sobic004G276800--Sobic007G060400 Sobic004G276800--Sobic002G174100 Sobic004G276800--Sobic008G095766 Sobic004G276800--Sobic003G079532 Sobic004G276800--Sobic010G027400 Sobic004G276800--Sobic004G186400 Sobic006G172400 Sobic006G172400 Sobic004G276800--Sobic006G172400 Sobic004G210300--Sobic003G079532 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic004G210300--Sobic003G211233 Sobic010G058300 Sobic010G058300 Sobic004G210300--Sobic010G058300 Sobic008G008000 Sobic008G008000 Sobic004G210300--Sobic008G008000 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic004G210300--Sobic004G045632 Sobic004G303000 Sobic004G303000 Sobic004G210300--Sobic004G303000 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic004G210300--Sobic008G019200 Sobic009G002100 Sobic009G002100 Sobic004G210300--Sobic009G002100 Sobic009G121200 Sobic009G121200 Sobic004G210300--Sobic009G121200 Sobic003G079532--Sobic003G211233 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic003G079532--Sobic002G359100 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic003G079532--Sobic002G193200 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic003G079532--Sobic007G220150 Sobic003G079532--Sobic008G019200 Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic003G079532--Sobic010G140100 Sobic002G316100 Sobic002G316100 Sobic003G079532--Sobic002G316100 Sobic003G079532--Sobic004G210300 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic003G079532--Sobic008G191900 Sobic004G186400--Sobic008G095766 Sobic004G186400--Sobic003G079532 Sobic004G186400--Sobic002G316100 Sobic004G186400--Sobic002G193200 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic004G186400--Sobic001G305200 Sobic004G186400--Sobic003G211233 Sobic004G186400--Sobic004G041300 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic004G186400--Sobic008G154600 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic004G186400--Sobic002G243400 Sobic002G350100--Sobic002G382900 Sobic002G350100--Sobic004G186400 Sobic002G350100--Sobic008G095766 Sobic002G350100--Sobic003G211900 Sobic002G350100--Sobic007G060400 Sobic005G038600 Sobic005G038600 Sobic002G350100--Sobic005G038600 Sobic002G350100--Sobic004G041300 Sobic002G350100--Sobic004G276800 Sobic001G337200 Sobic001G337200 Sobic002G350100--Sobic001G337200 Sobic002G174100--Sobic008G095766 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic002G174100--Sobic007G090439 Sobic003G374400 Sobic003G374400 Sobic002G174100--Sobic003G374400 Sobic002G174100--Sobic003G079532 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic002G174100--Sobic001G003400 Sobic002G174100--Sobic002G193200 Sobic002G174100--Sobic010G027400 Sobic002G174100--Sobic008G191900 Sobic001G332400 Sobic001G332400 Sobic002G174100--Sobic001G332400 Sobic008G095766--Sobic002G193200 Sobic008G095766--Sobic004G186400 Sobic008G095766--Sobic003G079532 Sobic008G095766--Sobic008G191900 Sobic008G095766--Sobic002G359100 Sobic008G095766--Sobic003G211233 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic008G095766--Sobic004G031900 Sobic004G345001 Sobic004G345001 Sobic008G095766--Sobic004G345001 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic008G095766--Sobic004G288000
Octagon: transcription factors


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