Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G382900.1
Synonym Sb02g039930
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6QFQ5
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g53440.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.003G211900 expressed protein -
2 Sobic.007G060400 - -
3 Sobic.004G276800 expressed protein -
4 Sobic.004G186400 - -
5 Sobic.008G095766 - -
6 Sobic.002G350100 expressed protein K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
7 Sobic.003G079532 - -
8 Sobic.009G250600 OsFBX35 - F-box domain containing protein, expressed -
9 Sobic.002G174100 - -
10 Sobic.004G041300 OsFBX248 - F-box domain containing protein, expressed -
11 Sobic.001G357000 ZOS9-12 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
12 Sobic.006G172400 expressed protein -
13 Sobic.004G210300 protease Do-like 14, putative, expressed -
14 Sobic.001G252600 AAA-type ATPase family protein, putative, expressed -
15 Sobic.010G027400 expressed protein -
16 Sobic.009G119100 hexokinase, putative, expressed K00844: hexokinase
17 Sobic.002G316100 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
18 Sobic.010G235400 OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
19 Sobic.003G211233 - -
20 Sobic.002G193200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G382900 Sobic002G382900 Sobic003G211900 Sobic003G211900 Sobic002G382900--Sobic003G211900 Sobic007G060400 Sobic007G060400 Sobic002G382900--Sobic007G060400 Sobic004G276800 Sobic004G276800 Sobic002G382900--Sobic004G276800 Sobic004G186400 Sobic004G186400 Sobic002G382900--Sobic004G186400 Sobic008G095766 Sobic008G095766 Sobic002G382900--Sobic008G095766 Sobic002G350100 Sobic002G350100 Sobic002G382900--Sobic002G350100 Sobic003G079532 Sobic003G079532 Sobic002G382900--Sobic003G079532 Sobic009G250600 Sobic009G250600 Sobic002G382900--Sobic009G250600 Sobic002G174100 Sobic002G174100 Sobic002G382900--Sobic002G174100 Sobic003G211900--Sobic002G382900 Sobic003G211900--Sobic007G060400 Sobic003G211900--Sobic004G276800 Sobic004G210300 Sobic004G210300 Sobic003G211900--Sobic004G210300 Sobic003G211900--Sobic003G079532 Sobic003G211900--Sobic004G186400 Sobic003G211900--Sobic002G350100 Sobic003G211900--Sobic002G174100 Sobic003G211900--Sobic008G095766 Sobic007G060400--Sobic002G382900 Sobic007G060400--Sobic004G186400 Sobic007G060400--Sobic003G211900 Sobic004G041300 Sobic004G041300 Sobic007G060400--Sobic004G041300 Sobic007G060400--Sobic003G079532 Sobic010G027400 Sobic010G027400 Sobic007G060400--Sobic010G027400 Sobic007G060400--Sobic004G210300 Sobic010G235400 Sobic010G235400 Sobic007G060400--Sobic010G235400 Sobic007G060400--Sobic008G095766 Sobic004G276800--Sobic002G382900 Sobic004G276800--Sobic003G211900 Sobic004G276800--Sobic007G060400 Sobic004G276800--Sobic002G174100 Sobic004G276800--Sobic008G095766 Sobic004G276800--Sobic003G079532 Sobic004G276800--Sobic010G027400 Sobic004G276800--Sobic004G186400 Sobic006G172400 Sobic006G172400 Sobic004G276800--Sobic006G172400 Sobic004G186400--Sobic008G095766 Sobic004G186400--Sobic003G079532 Sobic002G316100 Sobic002G316100 Sobic004G186400--Sobic002G316100 Sobic002G193200 Sobic002G193200 Sobic004G186400--Sobic002G193200 Sobic001G305200 Sobic001G305200 Sobic004G186400--Sobic001G305200 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic004G186400--Sobic003G211233 Sobic004G186400--Sobic004G041300 Sobic008G154600 Sobic008G154600 Sobic004G186400--Sobic008G154600 Sobic002G243400 Sobic002G243400 Sobic004G186400--Sobic002G243400 Sobic008G095766--Sobic002G193200 Sobic008G095766--Sobic004G186400 Sobic008G095766--Sobic003G079532 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic008G095766--Sobic008G191900 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic008G095766--Sobic002G359100 Sobic008G095766--Sobic003G211233 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic008G095766--Sobic004G031900 Sobic004G345001 Sobic004G345001 Sobic008G095766--Sobic004G345001 Sobic004G288000 Sobic004G288000 Sobic008G095766--Sobic004G288000 Sobic002G350100--Sobic002G382900 Sobic002G350100--Sobic004G186400 Sobic002G350100--Sobic008G095766 Sobic002G350100--Sobic003G211900 Sobic002G350100--Sobic007G060400 Sobic005G038600 Sobic005G038600 Sobic002G350100--Sobic005G038600 Sobic002G350100--Sobic004G041300 Sobic002G350100--Sobic004G276800 Sobic001G337200 Sobic001G337200 Sobic002G350100--Sobic001G337200 Sobic003G079532--Sobic003G211233 Sobic003G079532--Sobic002G359100 Sobic003G079532--Sobic002G193200 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic003G079532--Sobic007G220150 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic003G079532--Sobic008G019200 Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic003G079532--Sobic010G140100 Sobic003G079532--Sobic002G316100 Sobic003G079532--Sobic004G210300 Sobic003G079532--Sobic008G191900 Sobic001G180700 Sobic001G180700 Sobic009G250600--Sobic001G180700 Sobic003G175050 Sobic003G175050 Sobic009G250600--Sobic003G175050 Sobic001G252600 Sobic001G252600 Sobic009G250600--Sobic001G252600 Sobic004G178550 Sobic004G178550 Sobic009G250600--Sobic004G178550 Sobic002G069300 Sobic002G069300 Sobic009G250600--Sobic002G069300 Sobic002G014100 Sobic002G014100 Sobic009G250600--Sobic002G014100 Sobic010G143666 Sobic010G143666 Sobic009G250600--Sobic010G143666 Sobic006G142925 Sobic006G142925 Sobic009G250600--Sobic006G142925 Sobic005G046600 Sobic005G046600 Sobic009G250600--Sobic005G046600 Sobic002G174100--Sobic008G095766 Sobic007G090439 Sobic007G090439 Sobic002G174100--Sobic007G090439 Sobic003G374400 Sobic003G374400 Sobic002G174100--Sobic003G374400 Sobic002G174100--Sobic003G079532 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic002G174100--Sobic001G003400 Sobic002G174100--Sobic002G193200 Sobic002G174100--Sobic010G027400 Sobic002G174100--Sobic008G191900 Sobic001G332400 Sobic001G332400 Sobic002G174100--Sobic001G332400
Octagon: transcription factors


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