Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G027400.2,Sobic.010G027400.1
Synonym Sb10g002500
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A194YGZ2 , A0A1W0VR82
Pfam PF12274
Panther DB PTHR33326 PTHR33326:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g35210.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G270600 generative cell specific-1, putative, expressed -
2 Sobic.007G133100 - -
3 Sobic.001G003400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
4 Sobic.009G095640 - -
5 Sobic.005G185750 - -
6 Sobic.008G181900 OsFBLD9 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.008G168932 - -
8 Sobic.002G359100 expressed protein -
9 Sobic.005G068500 expressed protein -
10 Sobic.004G289900 expressed protein K15193: SPTY2D1, protein SPT2
11 Sobic.008G191900 CHX28, putative, expressed -
12 Sobic.002G273200 kinesin motor domain containing protein, expressed K11498: centromeric protein E
13 Sobic.003G079532 - -
14 Sobic.004G080800 EF hand family protein, putative, expressed K13448: calcium-binding protein CML
15 Sobic.006G044800 drought-induced protein 1, putative, expressed -
16 Sobic.004G334900 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed K08515: vesicle-associated membrane protein 7
17 Sobic.010G140100 - -
18 Sobic.003G017900 expressed protein -
19 Sobic.001G103500 gp176, putative, expressed -
20 Sobic.010G257700 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic010G027400 Sobic010G027400 Sobic002G270600 Sobic002G270600 Sobic010G027400--Sobic002G270600 Sobic007G133100 Sobic007G133100 Sobic010G027400--Sobic007G133100 Sobic001G003400 Sobic001G003400 Sobic010G027400--Sobic001G003400 Sobic009G095640 Sobic009G095640 Sobic010G027400--Sobic009G095640 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic010G027400--Sobic005G185750 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic010G027400--Sobic008G181900 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic010G027400--Sobic008G168932 Sobic002G359100 Sobic002G359100 Sobic010G027400--Sobic002G359100 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic010G027400--Sobic005G068500 Sobic002G270600--Sobic010G027400 Sobic001G135900 Sobic001G135900 Sobic002G270600--Sobic001G135900 Sobic003G193600 Sobic003G193600 Sobic002G270600--Sobic003G193600 Sobic002G213100 Sobic002G213100 Sobic002G270600--Sobic002G213100 Sobic004G079600 Sobic004G079600 Sobic002G270600--Sobic004G079600 Sobic005G054501 Sobic005G054501 Sobic002G270600--Sobic005G054501 Sobic002G270600--Sobic009G095640 Sobic007G051200 Sobic007G051200 Sobic002G270600--Sobic007G051200 Sobic004G080600 Sobic004G080600 Sobic002G270600--Sobic004G080600 Sobic007G133100--Sobic009G095640 Sobic007G133100--Sobic005G185750 Sobic007G133100--Sobic008G168932 Sobic007G133100--Sobic005G068500 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic007G133100--Sobic004G289900 Sobic001G103500 Sobic001G103500 Sobic007G133100--Sobic001G103500 Sobic007G133100--Sobic008G181900 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic007G133100--Sobic001G513400 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic007G133100--Sobic006G044800 Sobic004G255100 Sobic004G255100 Sobic001G003400--Sobic004G255100 Sobic004G014900 Sobic004G014900 Sobic001G003400--Sobic004G014900 Sobic010G261900 Sobic010G261900 Sobic001G003400--Sobic010G261900 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic001G003400--Sobic004G334900 Sobic004G123100 Sobic004G123100 Sobic001G003400--Sobic004G123100 Sobic010G063700 Sobic010G063700 Sobic001G003400--Sobic010G063700 Sobic001G003400--Sobic001G513400 Sobic004G031900 Sobic004G031900 Sobic001G003400--Sobic004G031900 Sobic010G187800 Sobic010G187800 Sobic001G003400--Sobic010G187800 Sobic009G095640--Sobic005G054501 Sobic010G257700 Sobic010G257700 Sobic009G095640--Sobic010G257700 Sobic002G165900 Sobic002G165900 Sobic009G095640--Sobic002G165900 Sobic009G095640--Sobic007G133100 Sobic010G246132 Sobic010G246132 Sobic009G095640--Sobic010G246132 Sobic009G089800 Sobic009G089800 Sobic009G095640--Sobic009G089800 Sobic006G244100 Sobic006G244100 Sobic009G095640--Sobic006G244100 Sobic003G379100 Sobic003G379100 Sobic009G095640--Sobic003G379100 Sobic009G095640--Sobic003G193600 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic008G181900--Sobic008G168932 Sobic008G181900--Sobic005G068500 Sobic008G181900--Sobic008G099000 Sobic008G181900--Sobic004G289900 Sobic010G141001 Sobic010G141001 Sobic008G181900--Sobic010G141001 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic008G181900--Sobic004G222400 Sobic003G329600 Sobic003G329600 Sobic008G181900--Sobic003G329600 Sobic003G255400 Sobic003G255400 Sobic008G181900--Sobic003G255400 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic008G181900--Sobic010G176400 Sobic008G168932--Sobic004G289900 Sobic008G168932--Sobic005G185750 Sobic008G168932--Sobic005G068500 Sobic008G168932--Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G181900 Sobic008G168932--Sobic004G024800 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic006G044800 Sobic008G168932--Sobic004G222400 Sobic008G191900 Sobic008G191900 Sobic002G359100--Sobic008G191900 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic002G359100--Sobic001G380000 Sobic010G140100 Sobic010G140100 Sobic002G359100--Sobic010G140100 Sobic003G233800 Sobic003G233800 Sobic002G359100--Sobic003G233800 Sobic008G019200 Sobic008G019200 Sobic002G359100--Sobic008G019200 Sobic007G220150 Sobic007G220150 Sobic002G359100--Sobic007G220150 Sobic004G080800 Sobic004G080800 Sobic002G359100--Sobic004G080800 Sobic002G359100--Sobic004G031900 Sobic003G054800 Sobic003G054800 Sobic002G359100--Sobic003G054800 Sobic005G068500--Sobic008G168932 Sobic005G068500--Sobic008G099000 Sobic001G539600 Sobic001G539600 Sobic005G068500--Sobic001G539600 Sobic005G068500--Sobic004G222400 Sobic005G068500--Sobic010G141001 Sobic005G068500--Sobic003G255400 Sobic005G068500--Sobic003G329600 Sobic005G068500--Sobic010G176400 Sobic005G068500--Sobic004G289900
Octagon: transcription factors


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