Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G185750.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJ88
Pfam -
Panther DB PTHR35166
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g40740.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G168932 - -
2 Sobic.004G289900 expressed protein K15193: SPTY2D1, protein SPT2
3 Sobic.006G044800 drought-induced protein 1, putative, expressed -
4 Sobic.001G513400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
5 Sobic.005G068500 expressed protein -
6 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
7 Sobic.008G181900 OsFBLD9 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
8 Sobic.008G099000 protein of unknown function domain containing protein, expressed -
9 Sobic.004G024800 microtubule associated protein, putative, expressed K16732: protein regulator of cytokinesis 1
10 Sobic.008G097800 CAMK_CAMK_like.47 - CAMK includes calcium/calmodulin depedent protein kinases, expressed K13412: calcium-dependent protein kinase
11 Sobic.001G202900 expressed protein -
12 Sobic.001G539880 - -
13 Sobic.007G221932 - -
14 Sobic.002G323000 TBC domain containing protein, expressed -
15 Sobic.002G128700 expressed protein -
16 Sobic.009G252000 Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@Sugar transporter(PubMedID : 27330561)@nodulin MtN3 family protein, putative, expressed K15382: SLC50A, solute carrier family 50 (sugar transporter)
17 Sobic.001G036200 - -
18 Sobic.009G091000 TKL_IRAK_CrRLK1L-1.11 - The CrRLK1L-1 subfamily has homology to the CrRLK1L homolog, expressed -
19 Sobic.010G034300 pectate lyase precursor, putative, expressed K01728: pectate lyase
20 Sobic.010G254100 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic008G168932--Sobic004G289900 Sobic008G168932--Sobic005G185750 Sobic008G168932--Sobic005G068500 Sobic008G168932--Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G181900 Sobic008G168932--Sobic004G024800 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic006G044800 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic008G168932--Sobic004G222400 Sobic004G289900--Sobic008G168932 Sobic004G289900--Sobic001G513400 Sobic004G289900--Sobic005G185750 Sobic004G289900--Sobic005G068500 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic008G099000 Sobic004G289900--Sobic004G024800 Sobic004G289900--Sobic006G044800 Sobic004G289900--Sobic010G257800 Sobic004G041800 Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic005G185750 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic006G044800--Sobic005G209300 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic006G044800--Sobic001G202900 Sobic006G044800--Sobic004G289900 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic006G044800--Sobic005G181500 Sobic006G044800--Sobic001G513400 Sobic006G044800--Sobic008G168932 Sobic001G466100 Sobic001G466100 Sobic006G044800--Sobic001G466100 Sobic001G513400--Sobic004G289900 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic001G513400--Sobic002G405300 Sobic001G513400--Sobic006G044800 Sobic001G513400--Sobic005G185750 Sobic001G513400--Sobic008G168932 Sobic001G513400--Sobic001G036200 Sobic001G513400--Sobic010G257800 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic001G513400--Sobic001G380000 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic001G513400--Sobic004G334900 Sobic005G068500--Sobic008G168932 Sobic005G068500--Sobic008G099000 Sobic001G539600 Sobic001G539600 Sobic005G068500--Sobic001G539600 Sobic005G068500--Sobic004G222400 Sobic010G141001 Sobic010G141001 Sobic005G068500--Sobic010G141001 Sobic003G255400 Sobic003G255400 Sobic005G068500--Sobic003G255400 Sobic003G329600 Sobic003G329600 Sobic005G068500--Sobic003G329600 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic005G068500--Sobic010G176400 Sobic005G068500--Sobic004G289900 Sobic010G271600 Sobic010G271600 Sobic010G257800--Sobic010G271600 Sobic006G173400 Sobic006G173400 Sobic010G257800--Sobic006G173400 Sobic002G128700 Sobic002G128700 Sobic010G257800--Sobic002G128700 Sobic004G187400 Sobic004G187400 Sobic010G257800--Sobic004G187400 Sobic009G098400 Sobic009G098400 Sobic010G257800--Sobic009G098400 Sobic008G102850 Sobic008G102850 Sobic010G257800--Sobic008G102850 Sobic010G190500 Sobic010G190500 Sobic010G257800--Sobic010G190500 Sobic009G253700 Sobic009G253700 Sobic010G257800--Sobic009G253700 Sobic005G214700 Sobic005G214700 Sobic010G257800--Sobic005G214700 Sobic008G181900--Sobic008G168932 Sobic008G181900--Sobic005G068500 Sobic008G181900--Sobic008G099000 Sobic008G181900--Sobic004G289900 Sobic008G181900--Sobic010G141001 Sobic008G181900--Sobic004G222400 Sobic008G181900--Sobic003G329600 Sobic008G181900--Sobic003G255400 Sobic008G181900--Sobic010G176400 Sobic008G099000--Sobic004G222400 Sobic008G099000--Sobic010G141001 Sobic008G099000--Sobic003G329600 Sobic008G099000--Sobic010G176400 Sobic008G099000--Sobic003G255400 Sobic008G099000--Sobic001G539600 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic008G099000--Sobic009G091000 Sobic007G221932 Sobic007G221932 Sobic008G099000--Sobic007G221932 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic008G099000--Sobic009G252000 Sobic001G539880 Sobic001G539880 Sobic004G024800--Sobic001G539880 Sobic005G035200 Sobic005G035200 Sobic004G024800--Sobic005G035200 Sobic007G080100 Sobic007G080100 Sobic004G024800--Sobic007G080100 Sobic003G195400 Sobic003G195400 Sobic004G024800--Sobic003G195400 Sobic007G148233 Sobic007G148233 Sobic004G024800--Sobic007G148233 Sobic008G011901 Sobic008G011901 Sobic004G024800--Sobic008G011901 Sobic002G145400 Sobic002G145400 Sobic004G024800--Sobic002G145400 Sobic004G024800--Sobic007G221932 Sobic005G035250 Sobic005G035250 Sobic004G024800--Sobic005G035250
Octagon: transcription factors


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