Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G017900.1
Synonym Sb03g002000
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q0V2
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g32470.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G044800 drought-induced protein 1, putative, expressed -
2 Sobic.005G185750 - -
3 Sobic.001G513400 inorganic phosphate transporter, putative, expressed K08176: MFS transporter, PHS family, inorganic phosphate transporter
4 Sobic.008G168932 - -
5 Sobic.004G289900 expressed protein K15193: SPTY2D1, protein SPT2
6 Sobic.002G405300 START domain containing protein, expressed -
7 Sobic.004G287200 OsSub26 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
8 Sobic.005G181500 expressed protein -
9 Sobic.004G041800 expressed protein -
10 Sobic.010G257800 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, putative, expressed -
11 Sobic.005G209300 GRAS family transcription factor domain containing protein, expressed -
12 Sobic.004G331500 similar to Cation-transporting ATPase(PubMedID : 29862293)@ATPase 8, plasma membrane-type, putative, expressed K01535: PMA1, H+-transporting ATPase
13 Sobic.001G202900 expressed protein -
14 Sobic.008G121600 - -
15 Sobic.009G166000 IQ calmodulin-binding motif domain containing protein, expressed -
16 Sobic.007G146300 pectinesterase, putative, expressed -
17 Sobic.004G334900 vesicle-associated membrane protein, putative, expressed K08515: vesicle-associated membrane protein 7
18 Sobic.009G253700 phosphatidylinositol 3- and 4-kinase family protein, putative, expressed -
19 Sobic.009G165900 protein kinase APK1B, chloroplast precursor, putative, expressed -
20 Sobic.001G466100 glycosyl hydrolase family 10 protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic003G017900 Sobic003G017900 Sobic006G044800 Sobic006G044800 Sobic003G017900--Sobic006G044800 Sobic005G185750 Sobic005G185750 Sobic003G017900--Sobic005G185750 Sobic001G513400 Sobic001G513400 Sobic003G017900--Sobic001G513400 Sobic008G168932 Sobic008G168932 Sobic003G017900--Sobic008G168932 Sobic004G289900 Sobic004G289900 Sobic003G017900--Sobic004G289900 Sobic002G405300 Sobic002G405300 Sobic003G017900--Sobic002G405300 Sobic004G287200 Sobic004G287200 Sobic003G017900--Sobic004G287200 Sobic005G181500 Sobic005G181500 Sobic003G017900--Sobic005G181500 Sobic004G041800 Sobic004G041800 Sobic003G017900--Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic004G041800 Sobic006G044800--Sobic005G185750 Sobic005G209300 Sobic005G209300 Sobic006G044800--Sobic005G209300 Sobic001G202900 Sobic001G202900 Sobic006G044800--Sobic001G202900 Sobic006G044800--Sobic004G289900 Sobic006G044800--Sobic005G181500 Sobic006G044800--Sobic001G513400 Sobic006G044800--Sobic008G168932 Sobic001G466100 Sobic001G466100 Sobic006G044800--Sobic001G466100 Sobic005G185750--Sobic008G168932 Sobic005G185750--Sobic004G289900 Sobic005G185750--Sobic006G044800 Sobic005G185750--Sobic001G513400 Sobic005G068500 Sobic005G068500 Sobic005G185750--Sobic005G068500 Sobic010G257800 Sobic010G257800 Sobic005G185750--Sobic010G257800 Sobic008G181900 Sobic008G181900 Sobic005G185750--Sobic008G181900 Sobic008G099000 Sobic008G099000 Sobic005G185750--Sobic008G099000 Sobic004G024800 Sobic004G024800 Sobic005G185750--Sobic004G024800 Sobic001G513400--Sobic004G289900 Sobic001G513400--Sobic002G405300 Sobic001G513400--Sobic006G044800 Sobic001G513400--Sobic005G185750 Sobic001G513400--Sobic008G168932 Sobic001G036200 Sobic001G036200 Sobic001G513400--Sobic001G036200 Sobic001G513400--Sobic010G257800 Sobic001G380000 Sobic001G380000 Sobic001G513400--Sobic001G380000 Sobic004G334900 Sobic004G334900 Sobic001G513400--Sobic004G334900 Sobic008G168932--Sobic004G289900 Sobic008G168932--Sobic005G185750 Sobic008G168932--Sobic005G068500 Sobic008G168932--Sobic008G099000 Sobic008G168932--Sobic008G181900 Sobic008G168932--Sobic004G024800 Sobic002G323000 Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic002G323000 Sobic008G168932--Sobic006G044800 Sobic004G222400 Sobic004G222400 Sobic008G168932--Sobic004G222400 Sobic004G289900--Sobic008G168932 Sobic004G289900--Sobic001G513400 Sobic004G289900--Sobic005G185750 Sobic004G289900--Sobic005G068500 Sobic004G289900--Sobic001G036200 Sobic004G289900--Sobic008G099000 Sobic004G289900--Sobic004G024800 Sobic004G289900--Sobic006G044800 Sobic004G289900--Sobic010G257800 Sobic004G331500 Sobic004G331500 Sobic002G405300--Sobic004G331500 Sobic002G405300--Sobic004G287200 Sobic002G405300--Sobic001G036200 Sobic010G254100 Sobic010G254100 Sobic002G405300--Sobic010G254100 Sobic004G336401 Sobic004G336401 Sobic002G405300--Sobic004G336401 Sobic009G166000 Sobic009G166000 Sobic002G405300--Sobic009G166000 Sobic009G165900 Sobic009G165900 Sobic002G405300--Sobic009G165900 Sobic008G075800 Sobic008G075800 Sobic002G405300--Sobic008G075800 Sobic010G034300 Sobic010G034300 Sobic002G405300--Sobic010G034300 Sobic001G222800 Sobic001G222800 Sobic004G287200--Sobic001G222800 Sobic004G287200--Sobic004G331500 Sobic004G287200--Sobic008G075800 Sobic004G287200--Sobic009G166000 Sobic007G061800 Sobic007G061800 Sobic004G287200--Sobic007G061800 Sobic010G177600 Sobic010G177600 Sobic004G287200--Sobic010G177600 Sobic004G287200--Sobic009G165900 Sobic010G118800 Sobic010G118800 Sobic004G287200--Sobic010G118800 Sobic009G227500 Sobic009G227500 Sobic004G287200--Sobic009G227500 Sobic009G167201 Sobic009G167201 Sobic005G181500--Sobic009G167201 Sobic005G181500--Sobic009G166000 Sobic005G181500--Sobic004G331500 Sobic005G181500--Sobic006G044800 Sobic005G181500--Sobic001G202900 Sobic005G181500--Sobic005G209300 Sobic010G034200 Sobic010G034200 Sobic005G181500--Sobic010G034200 Sobic005G192000 Sobic005G192000 Sobic005G181500--Sobic005G192000 Sobic005G181500--Sobic004G287200 Sobic004G080000 Sobic004G080000 Sobic004G041800--Sobic004G080000 Sobic004G041800--Sobic001G466100 Sobic007G146300 Sobic007G146300 Sobic004G041800--Sobic007G146300 Sobic010G276200 Sobic010G276200 Sobic004G041800--Sobic010G276200 Sobic004G041800--Sobic005G209300 Sobic004G041800--Sobic010G034300 Sobic010G176400 Sobic010G176400 Sobic004G041800--Sobic010G176400 Sobic009G252000 Sobic009G252000 Sobic004G041800--Sobic009G252000 Sobic009G091000 Sobic009G091000 Sobic004G041800--Sobic009G091000
Octagon: transcription factors


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