Gene annotation
Transcriptome id Sobic.010G235400.1
Synonym Sb10g027720
Functional annotation OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed
UniProt C5Z893
Pfam PF00646
Panther DB PTHR32212 PTHR32212:SF121
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005515; protein binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G44060 : F-box/RNI-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g06520.1 : OsFBLD1 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a041850
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G070564 - K01193: INV, beta-fructofuranosidase
2 Sobic.004G020200 expressed protein -
3 Sobic.008G155000 ankyrin, putative, expressed -
4 Sobic.001G414650 - K08678: UXS1, UDP-glucuronate decarboxylase
5 Sobic.004G045632 - -
6 Sobic.004G279200 protein phosphatase 2C, putative, expressed K01102: pyruvate dehydrogenase phosphatase
7 Sobic.002G080450 - -
8 Sobic.003G211233 - -
9 Sobic.006G254400 expressed protein -
10 Sobic.004G002700 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
11 Sobic.002G316100 zinc finger DHHC domain-containing protein, putative, expressed K16675: palmitoyltransferase ZDHHC9/14/18
12 Sobic.002G243400 transporter, monovalent cation:proton antiporter-2 family, putative, expressed K14724: SLC9A8, solute carrier family 9 (sodium/hydrogen exchanger), member 8
13 Sobic.003G064100 expressed protein -
14 Sobic.003G018000 expressed protein -
15 Sobic.003G079532 - -
16 Sobic.004G210300 protease Do-like 14, putative, expressed -
17 Sobic.001G503600 expressed protein -
18 Sobic.002G000800 peptide transporter, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
19 Sobic.007G074300 MATE efflux family protein, putative, expressed -
20 Sobic.010G058300 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic010G235400 Sobic010G235400 Sobic006G070564 Sobic006G070564 Sobic010G235400--Sobic006G070564 Sobic004G020200 Sobic004G020200 Sobic010G235400--Sobic004G020200 Sobic008G155000 Sobic008G155000 Sobic010G235400--Sobic008G155000 Sobic001G414650 Sobic001G414650 Sobic010G235400--Sobic001G414650 Sobic004G045632 Sobic004G045632 Sobic010G235400--Sobic004G045632 Sobic004G279200 Sobic004G279200 Sobic010G235400--Sobic004G279200 Sobic002G080450 Sobic002G080450 Sobic010G235400--Sobic002G080450 Sobic003G211233 Sobic003G211233 Sobic010G235400--Sobic003G211233 Sobic006G254400 Sobic006G254400 Sobic010G235400--Sobic006G254400 Sobic001G039100 Sobic001G039100 Sobic006G070564--Sobic001G039100 Sobic006G070564--Sobic004G279200 Sobic006G189300 Sobic006G189300 Sobic006G070564--Sobic006G189300 Sobic002G404600 Sobic002G404600 Sobic006G070564--Sobic002G404600 Sobic001G503600 Sobic001G503600 Sobic006G070564--Sobic001G503600 Sobic006G070564--Sobic001G414650 Sobic010G038300 Sobic010G038300 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Octagon: transcription factors


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