Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G285200.1
Synonym
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q5W7
Pfam PF00161
Panther DB PTHR33453 PTHR33453:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0017148; negative regulation of translation


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os07g09070.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.003G285200


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G020700 homeobox and START domains containing protein, putative, expressed K09338: homeobox-leucine zipper protein
2 Sobic.010G191450 - -
3 Sobic.006G022900 cytochrome P450, putative, expressed -
4 Sobic.008G181600 thaumatin, putative, expressed -
5 Sobic.004G221600 - -
6 Sobic.009G019900 - -
7 Sobic.001G345600 zinc-binding protein, putative, expressed -
8 Sobic.006G194800 invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed -
9 Sobic.001G312200 DEF3 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
10 Sobic.001G345700 zinc-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.005G064300 eukaryotic aspartyl protease domain containing protein, expressed -
12 Sobic.008G122300 OsSub63 - Putative Subtilisin homologue, expressed -
13 Sobic.005G131100 expressed protein -
14 Sobic.005G153100 - -
15 Sobic.002G332000 CRP8 - Cysteine-rich family protein precursor, expressed -
16 Sobic.002G096400 expressed protein -
17 Sobic.005G152400 - -
18 Sobic.005G223300 DEFL16 - Defensin and Defensin-like DEFL family -
19 Sobic.005G080700 - -
20 Sobic.001G505400 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic003G285200 Sobic003G285200 Sobic006G020700 Sobic006G020700 Sobic003G285200--Sobic006G020700 Sobic010G191450 Sobic010G191450 Sobic003G285200--Sobic010G191450 Sobic006G022900 Sobic006G022900 Sobic003G285200--Sobic006G022900 Sobic008G181600 Sobic008G181600 Sobic003G285200--Sobic008G181600 Sobic004G221600 Sobic004G221600 Sobic003G285200--Sobic004G221600 Sobic009G019900 Sobic009G019900 Sobic003G285200--Sobic009G019900 Sobic001G345600 Sobic001G345600 Sobic003G285200--Sobic001G345600 Sobic006G194800 Sobic006G194800 Sobic003G285200--Sobic006G194800 Sobic001G312200 Sobic001G312200 Sobic003G285200--Sobic001G312200 Sobic006G020700--Sobic010G191450 Sobic006G020700--Sobic004G221600 Sobic006G020700--Sobic006G194800 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic006G020700--Sobic005G223300 Sobic006G020700--Sobic003G285200 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic006G020700--Sobic001G209701 Sobic010G191450--Sobic006G020700 Sobic010G191450--Sobic004G221600 Sobic010G191450--Sobic005G223300 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic010G191450--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic010G191450--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic010G191450--Sobic005G196400 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic010G191450--Sobic008G120200 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic010G191450--Sobic010G191500 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic010G191450--Sobic001G505400 Sobic006G022900--Sobic008G181600 Sobic009G039200 Sobic009G039200 Sobic006G022900--Sobic009G039200 Sobic005G064300 Sobic005G064300 Sobic006G022900--Sobic005G064300 Sobic001G345700 Sobic001G345700 Sobic006G022900--Sobic001G345700 Sobic006G022900--Sobic009G019900 Sobic006G022900--Sobic001G345600 Sobic010G039600 Sobic010G039600 Sobic006G022900--Sobic010G039600 Sobic006G227100 Sobic006G227100 Sobic006G022900--Sobic006G227100 Sobic002G096400 Sobic002G096400 Sobic006G022900--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic005G064300 Sobic008G181600--Sobic001G345700 Sobic008G181600--Sobic001G345600 Sobic008G181600--Sobic002G096400 Sobic008G181600--Sobic001G312200 Sobic005G152400 Sobic005G152400 Sobic008G181600--Sobic005G152400 Sobic008G122300 Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic008G122300 Sobic008G181600--Sobic010G039600 Sobic005G131100 Sobic005G131100 Sobic008G181600--Sobic005G131100 Sobic004G221600--Sobic001G209701 Sobic009G019900--Sobic008G181600 Sobic001G324500 Sobic001G324500 Sobic009G019900--Sobic001G324500 Sobic009G019900--Sobic001G345600 Sobic009G019900--Sobic001G345700 Sobic009G019900--Sobic005G064300 Sobic010G023600 Sobic010G023600 Sobic009G019900--Sobic010G023600 Sobic009G019900--Sobic001G312200 Sobic009G019900--Sobic002G096400 Sobic009G019900--Sobic005G152400 Sobic001G345600--Sobic001G312200 Sobic001G345600--Sobic008G122300 Sobic001G345600--Sobic005G131100 Sobic001G345600--Sobic008G181600 Sobic002G332000 Sobic002G332000 Sobic001G345600--Sobic002G332000 Sobic001G345600--Sobic001G345700 Sobic005G153100 Sobic005G153100 Sobic001G345600--Sobic005G153100 Sobic001G345600--Sobic001G505400 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic001G345600--Sobic005G080700 Sobic006G194800--Sobic010G191450 Sobic002G349600 Sobic002G349600 Sobic006G194800--Sobic002G349600 Sobic002G332600 Sobic002G332600 Sobic006G194800--Sobic002G332600 Sobic007G041000 Sobic007G041000 Sobic006G194800--Sobic007G041000 Sobic005G141700 Sobic005G141700 Sobic006G194800--Sobic005G141700 Sobic006G194800--Sobic004G221600 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic006G194800--Sobic002G352401 Sobic006G194800--Sobic005G223300 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic006G194800--Sobic004G315900 Sobic001G312200--Sobic005G153100 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic001G312200--Sobic002G399700 Sobic001G312200--Sobic001G345600 Sobic001G312200--Sobic005G131100 Sobic001G312200--Sobic008G122300 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic002G058000 Sobic001G312200--Sobic001G505400 Sobic001G312200--Sobic005G080700 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic001G312200--Sobic002G031200
Octagon: transcription factors


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