Gene annotation
Transcriptome id Sobic.006G194800.1
Synonym Sb06g026750
Functional annotation invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed
UniProt C5YEN5
Pfam PF04043
Panther DB PTHR31080 PTHR31080:SF14
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0004857; enzyme inhibitor activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G46950 : Plant invertase/pectin methylesterase inhibitor superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os04g49730.1 : invertase/pectin methylesterase inhibitor family protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G191450 - -
2 Sobic.002G349600 ubiquitin-like protein SMT3, putative, expressed K12160: SUMO, small ubiquitin-related modifier
3 Sobic.002G332600 - -
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5 Sobic.005G141700 - -
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9 Sobic.004G315900 DEFL74 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
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11 Sobic.002G058000 thioredoxin, putative, expressed K03671: thioredoxin 1
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15 Sobic.010G120100 expansin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.007G040400 - -
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18 Sobic.005G147400 - -
19 Sobic.005G027200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
20 Sobic.008G120200 - -


Gene co-expression network
sample Sobic006G194800 Sobic006G194800 Sobic010G191450 Sobic010G191450 Sobic006G194800--Sobic010G191450 Sobic002G349600 Sobic002G349600 Sobic006G194800--Sobic002G349600 Sobic002G332600 Sobic002G332600 Sobic006G194800--Sobic002G332600 Sobic007G041000 Sobic007G041000 Sobic006G194800--Sobic007G041000 Sobic005G141700 Sobic005G141700 Sobic006G194800--Sobic005G141700 Sobic004G221600 Sobic004G221600 Sobic006G194800--Sobic004G221600 Sobic002G352401 Sobic002G352401 Sobic006G194800--Sobic002G352401 Sobic005G223300 Sobic005G223300 Sobic006G194800--Sobic005G223300 Sobic004G315900 Sobic004G315900 Sobic006G194800--Sobic004G315900 Sobic006G020700 Sobic006G020700 Sobic010G191450--Sobic006G020700 Sobic010G191450--Sobic004G221600 Sobic010G191450--Sobic005G223300 Sobic007G040400 Sobic007G040400 Sobic010G191450--Sobic007G040400 Sobic005G147400 Sobic005G147400 Sobic010G191450--Sobic005G147400 Sobic005G196400 Sobic005G196400 Sobic010G191450--Sobic005G196400 Sobic008G120200 Sobic008G120200 Sobic010G191450--Sobic008G120200 Sobic010G191500 Sobic010G191500 Sobic010G191450--Sobic010G191500 Sobic001G505400 Sobic001G505400 Sobic010G191450--Sobic001G505400 Sobic002G349600--Sobic005G141700 Sobic002G349600--Sobic006G194800 Sobic001G345800 Sobic001G345800 Sobic002G349600--Sobic001G345800 Sobic003G415700 Sobic003G415700 Sobic002G349600--Sobic003G415700 Sobic002G349600--Sobic007G041000 Sobic002G349600--Sobic002G352401 Sobic002G349600--Sobic002G332600 Sobic005G147100 Sobic005G147100 Sobic002G349600--Sobic005G147100 Sobic010G010500 Sobic010G010500 Sobic002G349600--Sobic010G010500 Sobic001G209701 Sobic001G209701 Sobic002G332600--Sobic001G209701 Sobic005G080800 Sobic005G080800 Sobic007G041000--Sobic005G080800 Sobic005G130900 Sobic005G130900 Sobic007G041000--Sobic005G130900 Sobic002G399700 Sobic002G399700 Sobic007G041000--Sobic002G399700 Sobic001G349600 Sobic001G349600 Sobic007G041000--Sobic001G349600 Sobic002G058000 Sobic002G058000 Sobic007G041000--Sobic002G058000 Sobic005G154000 Sobic005G154000 Sobic007G041000--Sobic005G154000 Sobic007G041000--Sobic004G315900 Sobic005G027200 Sobic005G027200 Sobic007G041000--Sobic005G027200 Sobic010G191400 Sobic010G191400 Sobic007G041000--Sobic010G191400 Sobic005G141700--Sobic002G349600 Sobic005G147200 Sobic005G147200 Sobic005G141700--Sobic005G147200 Sobic005G221100 Sobic005G221100 Sobic005G141700--Sobic005G221100 Sobic005G223000 Sobic005G223000 Sobic005G141700--Sobic005G223000 Sobic008G045650 Sobic008G045650 Sobic005G141700--Sobic008G045650 Sobic005G141700--Sobic010G191500 Sobic005G141700--Sobic002G332600 Sobic005G145900 Sobic005G145900 Sobic005G141700--Sobic005G145900 Sobic005G141700--Sobic005G147100 Sobic004G221600--Sobic001G209701 Sobic005G064400 Sobic005G064400 Sobic002G352401--Sobic005G064400 Sobic006G007001 Sobic006G007001 Sobic002G352401--Sobic006G007001 Sobic010G129300 Sobic010G129300 Sobic002G352401--Sobic010G129300 Sobic005G081800 Sobic005G081800 Sobic002G352401--Sobic005G081800 Sobic006G006100 Sobic006G006100 Sobic002G352401--Sobic006G006100 Sobic002G095000 Sobic002G095000 Sobic002G352401--Sobic002G095000 Sobic004G029500 Sobic004G029500 Sobic002G352401--Sobic004G029500 Sobic004G316400 Sobic004G316400 Sobic002G352401--Sobic004G316400 Sobic002G058100 Sobic002G058100 Sobic002G352401--Sobic002G058100 Sobic010G120100 Sobic010G120100 Sobic005G223300--Sobic010G120100 Sobic002G031200 Sobic002G031200 Sobic005G223300--Sobic002G031200 Sobic005G080700 Sobic005G080700 Sobic005G223300--Sobic005G080700 Sobic005G189700 Sobic005G189700 Sobic005G223300--Sobic005G189700 Sobic004G048500 Sobic004G048500 Sobic005G223300--Sobic004G048500 Sobic005G223300--Sobic001G505400 Sobic005G223300--Sobic002G058000 Sobic005G223300--Sobic004G315900 Sobic005G223300--Sobic005G147400 Sobic004G315900--Sobic002G058000 Sobic004G315900--Sobic002G031200 Sobic004G315900--Sobic010G120100 Sobic004G315900--Sobic002G399700 Sobic004G315900--Sobic005G080800 Sobic004G315900--Sobic005G223300 Sobic004G315900--Sobic005G130900 Sobic004G315900--Sobic005G189700 Sobic004G315900--Sobic005G154000
Octagon: transcription factors


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