Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G377400.1
Synonym Sb03g041725
Functional annotation ANTH domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6Q7A9
Pfam PF07651
Panther DB PTHR22951 PTHR22951:SF30
NCBI CDD KOG0251; Clathrin assembly protein AP180 and related proteins, contain ENTH domain
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0005543; phospholipid binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G03050 : ENTH/ANTH/VHS superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g35160.1 : clathrin assembly protein, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a039502 , Zm00025a037358
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.008G074800 gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed -
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19 Sobic.001G383600 - -
20 Sobic.010G017600 pectinesterase, putative, expressed K01051: pectinesterase


Gene co-expression network
sample Sobic003G377400 Sobic003G377400 Sobic008G074800 Sobic008G074800 Sobic003G377400--Sobic008G074800 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic003G377400--Sobic002G064450 Sobic003G053001 Sobic003G053001 Sobic003G377400--Sobic003G053001 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic003G377400--Sobic004G098650 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic003G377400--Sobic004G171350 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic003G377400--Sobic007G086400 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic003G377400--Sobic006G113100 Sobic001G002900 Sobic001G002900 Sobic003G377400--Sobic001G002900 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic003G377400--Sobic004G123801 Sobic008G074800--Sobic003G377400 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic008G074800--Sobic004G022700 Sobic003G104800 Sobic003G104800 Sobic008G074800--Sobic003G104800 Sobic008G074800--Sobic002G064450 Sobic008G074800--Sobic004G098650 Sobic008G074800--Sobic003G053001 Sobic007G195201 Sobic007G195201 Sobic008G074800--Sobic007G195201 Sobic001G321300 Sobic001G321300 Sobic008G074800--Sobic001G321300 Sobic008G074800--Sobic004G171350 Sobic002G064450--Sobic004G098650 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic002G064450--Sobic009G072066 Sobic002G064450--Sobic004G123801 Sobic002G064450--Sobic003G053001 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic002G064450--Sobic001G018700 Sobic003G053001--Sobic002G064450 Sobic003G053001--Sobic004G123801 Sobic003G053001--Sobic004G171350 Sobic003G053001--Sobic004G098650 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic003G053001--Sobic003G178101 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G053001--Sobic001G030800 Sobic003G053001--Sobic009G072066 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G053001--Sobic003G384650 Sobic003G053001--Sobic001G018700 Sobic004G098650--Sobic002G064450 Sobic004G098650--Sobic009G072066 Sobic004G098650--Sobic003G053001 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic004G098650--Sobic006G204850 Sobic004G098650--Sobic004G123801 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic004G098650--Sobic008G153801 Sobic004G098650--Sobic001G018700 Sobic004G171350--Sobic004G123801 Sobic004G171350--Sobic001G030800 Sobic004G171350--Sobic003G178101 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic004G171350--Sobic006G089200 Sobic004G171350--Sobic002G064450 Sobic004G171350--Sobic001G018700 Sobic007G086400--Sobic006G113100 Sobic007G086400--Sobic002G064450 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic007G086400--Sobic009G185601 Sobic001G374301 Sobic001G374301 Sobic007G086400--Sobic001G374301 Sobic005G120466 Sobic005G120466 Sobic007G086400--Sobic005G120466 Sobic006G075650 Sobic006G075650 Sobic007G086400--Sobic006G075650 Sobic007G086400--Sobic003G053001 Sobic007G086400--Sobic004G098650 Sobic003G405400 Sobic003G405400 Sobic007G086400--Sobic003G405400 Sobic006G113100--Sobic007G086400 Sobic006G113100--Sobic001G374301 Sobic001G236950 Sobic001G236950 Sobic006G113100--Sobic001G236950 Sobic006G113100--Sobic002G064450 Sobic001G436850 Sobic001G436850 Sobic006G113100--Sobic001G436850 Sobic001G097300 Sobic001G097300 Sobic006G113100--Sobic001G097300 Sobic006G113100--Sobic004G123801 Sobic006G113100--Sobic003G405400 Sobic006G113100--Sobic004G098650 Sobic003G123800 Sobic003G123800 Sobic001G002900--Sobic003G123800 Sobic001G183800 Sobic001G183800 Sobic001G002900--Sobic001G183800 Sobic001G185700 Sobic001G185700 Sobic001G002900--Sobic001G185700 Sobic007G034650 Sobic007G034650 Sobic001G002900--Sobic007G034650 Sobic006G155150 Sobic006G155150 Sobic001G002900--Sobic006G155150 Sobic008G031800 Sobic008G031800 Sobic001G002900--Sobic008G031800 Sobic001G328850 Sobic001G328850 Sobic001G002900--Sobic001G328850 Sobic001G002900--Sobic004G171350 Sobic001G002900--Sobic005G120466 Sobic004G123801--Sobic003G178101 Sobic004G123801--Sobic001G030800 Sobic004G123801--Sobic003G384650 Sobic004G123801--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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