Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G074800.1
Synonym CXE13, ATCXE13
Functional annotation gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
UniProt A0A1B6PBY0
Pfam PF07859
Panther DB PTHR23024 PTHR23024:SF180
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016787; hydrolase activity GO:0008152metabolic process


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G48700 : carboxyesterase 13
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g35940.1 : gibberellin receptor GID1L2, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a031688 , Zm00025a020760
Brachypodium KQJ99979
Barley HORVU3Hr1G022640.3 , HORVU3Hr1G022640.2 , HORVU3Hr1G022640.1
Wheat TraesCS3A02G122000
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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8 Sobic.001G321300 - -
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13 Sobic.003G358500 - -
14 Sobic.010G101350 - -
15 Sobic.010G197632 - -
16 Sobic.001G383600 - -
17 Sobic.001G374301 - -
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19 Sobic.001G154800 ubiquitin, putative, expressed -
20 Sobic.004G123801 - -


Gene co-expression network
sample Sobic008G074800 Sobic008G074800 Sobic003G377400 Sobic003G377400 Sobic008G074800--Sobic003G377400 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic008G074800--Sobic004G022700 Sobic003G104800 Sobic003G104800 Sobic008G074800--Sobic003G104800 Sobic002G064450 Sobic002G064450 Sobic008G074800--Sobic002G064450 Sobic004G098650 Sobic004G098650 Sobic008G074800--Sobic004G098650 Sobic003G053001 Sobic003G053001 Sobic008G074800--Sobic003G053001 Sobic007G195201 Sobic007G195201 Sobic008G074800--Sobic007G195201 Sobic001G321300 Sobic001G321300 Sobic008G074800--Sobic001G321300 Sobic004G171350 Sobic004G171350 Sobic008G074800--Sobic004G171350 Sobic003G377400--Sobic008G074800 Sobic003G377400--Sobic002G064450 Sobic003G377400--Sobic003G053001 Sobic003G377400--Sobic004G098650 Sobic003G377400--Sobic004G171350 Sobic007G086400 Sobic007G086400 Sobic003G377400--Sobic007G086400 Sobic006G113100 Sobic006G113100 Sobic003G377400--Sobic006G113100 Sobic001G002900 Sobic001G002900 Sobic003G377400--Sobic001G002900 Sobic004G123801 Sobic004G123801 Sobic003G377400--Sobic004G123801 Sobic004G022700--Sobic007G086400 Sobic004G093300 Sobic004G093300 Sobic004G022700--Sobic004G093300 Sobic004G022700--Sobic001G321300 Sobic004G022700--Sobic003G053001 Sobic004G022700--Sobic006G113100 Sobic002G069700 Sobic002G069700 Sobic004G022700--Sobic002G069700 Sobic004G022700--Sobic002G064450 Sobic009G185601 Sobic009G185601 Sobic004G022700--Sobic009G185601 Sobic004G022700--Sobic004G098650 Sobic003G104800--Sobic008G074800 Sobic003G104800--Sobic004G022700 Sobic003G104800--Sobic003G377400 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic003G104800--Sobic008G092932 Sobic002G156900 Sobic002G156900 Sobic003G104800--Sobic002G156900 Sobic005G089500 Sobic005G089500 Sobic003G104800--Sobic005G089500 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic003G104800--Sobic007G101900 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic003G104800--Sobic008G121400 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic003G104800--Sobic010G110266 Sobic002G064450--Sobic004G098650 Sobic009G072066 Sobic009G072066 Sobic002G064450--Sobic009G072066 Sobic002G064450--Sobic004G123801 Sobic002G064450--Sobic003G053001 Sobic001G018700 Sobic001G018700 Sobic002G064450--Sobic001G018700 Sobic004G098650--Sobic002G064450 Sobic004G098650--Sobic009G072066 Sobic004G098650--Sobic003G053001 Sobic006G204850 Sobic006G204850 Sobic004G098650--Sobic006G204850 Sobic004G098650--Sobic004G123801 Sobic008G153801 Sobic008G153801 Sobic004G098650--Sobic008G153801 Sobic004G098650--Sobic001G018700 Sobic003G053001--Sobic002G064450 Sobic003G053001--Sobic004G123801 Sobic003G053001--Sobic004G171350 Sobic003G053001--Sobic004G098650 Sobic003G178101 Sobic003G178101 Sobic003G053001--Sobic003G178101 Sobic001G030800 Sobic001G030800 Sobic003G053001--Sobic001G030800 Sobic003G053001--Sobic009G072066 Sobic003G384650 Sobic003G384650 Sobic003G053001--Sobic003G384650 Sobic003G053001--Sobic001G018700 Sobic003G358500 Sobic003G358500 Sobic007G195201--Sobic003G358500 Sobic007G195201--Sobic002G069700 Sobic010G101350 Sobic010G101350 Sobic007G195201--Sobic010G101350 Sobic007G023650 Sobic007G023650 Sobic007G195201--Sobic007G023650 Sobic001G218300 Sobic001G218300 Sobic007G195201--Sobic001G218300 Sobic010G197632 Sobic010G197632 Sobic007G195201--Sobic010G197632 Sobic009G110300 Sobic009G110300 Sobic007G195201--Sobic009G110300 Sobic003G389601 Sobic003G389601 Sobic007G195201--Sobic003G389601 Sobic001G154800 Sobic001G154800 Sobic007G195201--Sobic001G154800 Sobic004G177050 Sobic004G177050 Sobic001G321300--Sobic004G177050 Sobic001G321300--Sobic002G069700 Sobic009G196500 Sobic009G196500 Sobic001G321300--Sobic009G196500 Sobic001G321300--Sobic007G023650 Sobic001G321300--Sobic003G358500 Sobic001G110150 Sobic001G110150 Sobic001G321300--Sobic001G110150 Sobic001G321300--Sobic009G110300 Sobic003G095301 Sobic003G095301 Sobic001G321300--Sobic003G095301 Sobic001G321300--Sobic001G218300 Sobic004G171350--Sobic004G123801 Sobic004G171350--Sobic001G030800 Sobic004G171350--Sobic003G178101 Sobic006G089200 Sobic006G089200 Sobic004G171350--Sobic006G089200 Sobic004G171350--Sobic002G064450 Sobic004G171350--Sobic001G018700
Octagon: transcription factors


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