Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G380100.2
Synonym Sb03g041980
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during salt-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
Up-reguralion under heat (PubMedID : 24916767)
Up-reguralion under combine stress of drought and heat (PubMedID : 24916767)
pentatricopeptide, putative, expressed
UniProt A0A1W0W0T8
Pfam PF14432 PF01535 PF13041
Panther DB PTHR24015 PTHR24015:SF595
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G33170 : Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g66160.1 : pentatricopeptide, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026536 , Zm00025a034203
Brachypodium KQK10935
Barley HORVU3Hr1G090860.4 , HORVU3Hr1G090860.5 , HORVU3Hr1G090860.2 , HORVU3Hr1G090860.3 , HORVU3Hr1G090860.1
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G124850 - -
2 Sobic.010G064300 - -
3 Sobic.001G516400 - -
4 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
5 Sobic.009G247200 - -
6 Sobic.009G134700 - -
7 Sobic.003G142500 glycerol-3-phosphate acyltransferase, putative, expressed K13508: glycerol-3-phosphate acyltransferase
8 Sobic.008G193000 - -
9 Sobic.005G168900 expressed protein -
10 Sobic.009G158150 - -
11 Sobic.010G252800 glutathione S-transferase, putative, expressed K00799: GST, glutathione S-transferase
12 Sobic.006G009200 expressed protein -
13 Sobic.009G025750 - -
14 Sobic.002G000350 - -
15 Sobic.007G020400 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
16 Sobic.010G166201 - -
17 Sobic.007G179266 - -
18 Sobic.004G249950 - -
19 Sobic.003G270650 - -
20 Sobic.007G045750 - -


Gene co-expression network
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Sobic007G226900 Sobic005G168900--Sobic007G226900
Octagon: transcription factors


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