Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G383200.1
Synonym Sb03g042270
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1B6Q7G7
Pfam PF12776
Panther DB PTHR31704 PTHR31704:SF25
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT4G02550 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g33260.1 : retrotransposon protein, putative, unclassified, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G057201 - -
2 Sobic.001G059150 - -
3 Sobic.003G200400 histone deacetylase 19, putative, expressed K06067: histone deacetylase 1/2
4 Sobic.003G159300 - -
5 Sobic.006G145650 - -
6 Sobic.004G013900 vacuolar ATP synthase 98 kDa subunit, putative, expressed -
7 Sobic.001G234733 - -
8 Sobic.005G008400 pentatricopeptide, putative, expressed -
9 Sobic.010G214950 - -
10 Sobic.004G198701 - -
11 Sobic.001G448900 OsFBX210 - F-box domain containing protein, expressed -
12 Sobic.001G150901 - -
13 Sobic.002G423901 - -
14 Sobic.001G011100 - -
15 Sobic.007G223250 - -
16 Sobic.007G011100 - -
17 Sobic.003G168350 - -
18 Sobic.003G354050 - -
19 Sobic.001G060732 - -
20 Sobic.009G206150 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G383200 Sobic003G383200 Sobic005G057201 Sobic005G057201 Sobic003G383200--Sobic005G057201 Sobic001G059150 Sobic001G059150 Sobic003G383200--Sobic001G059150 Sobic003G200400 Sobic003G200400 Sobic003G383200--Sobic003G200400 Sobic003G159300 Sobic003G159300 Sobic003G383200--Sobic003G159300 Sobic006G145650 Sobic006G145650 Sobic003G383200--Sobic006G145650 Sobic004G013900 Sobic004G013900 Sobic003G383200--Sobic004G013900 Sobic001G234733 Sobic001G234733 Sobic003G383200--Sobic001G234733 Sobic005G008400 Sobic005G008400 Sobic003G383200--Sobic005G008400 Sobic010G214950 Sobic010G214950 Sobic003G383200--Sobic010G214950 Sobic001G448900 Sobic001G448900 Sobic005G057201--Sobic001G448900 Sobic002G277000 Sobic002G277000 Sobic005G057201--Sobic002G277000 Sobic003G277550 Sobic003G277550 Sobic005G057201--Sobic003G277550 Sobic005G083932 Sobic005G083932 Sobic005G057201--Sobic005G083932 Sobic008G174400 Sobic008G174400 Sobic005G057201--Sobic008G174400 Sobic002G191200 Sobic002G191200 Sobic005G057201--Sobic002G191200 Sobic001G317900 Sobic001G317900 Sobic005G057201--Sobic001G317900 Sobic001G059150--Sobic010G214950 Sobic001G195400 Sobic001G195400 Sobic001G059150--Sobic001G195400 Sobic001G059150--Sobic001G234733 Sobic001G150901 Sobic001G150901 Sobic001G059150--Sobic001G150901 Sobic005G146900 Sobic005G146900 Sobic001G059150--Sobic005G146900 Sobic007G223250 Sobic007G223250 Sobic001G059150--Sobic007G223250 Sobic004G198701 Sobic004G198701 Sobic001G059150--Sobic004G198701 Sobic002G288700 Sobic002G288700 Sobic001G059150--Sobic002G288700 Sobic001G059150--Sobic003G200400 Sobic003G200400--Sobic004G198701 Sobic003G168350 Sobic003G168350 Sobic003G200400--Sobic003G168350 Sobic001G365332 Sobic001G365332 Sobic003G200400--Sobic001G365332 Sobic002G174000 Sobic002G174000 Sobic003G200400--Sobic002G174000 Sobic003G200400--Sobic005G008400 Sobic001G260900 Sobic001G260900 Sobic003G200400--Sobic001G260900 Sobic008G157700 Sobic008G157700 Sobic003G200400--Sobic008G157700 Sobic006G005550 Sobic006G005550 Sobic003G200400--Sobic006G005550 Sobic004G346700 Sobic004G346700 Sobic003G200400--Sobic004G346700 Sobic003G159300--Sobic003G277550 Sobic002G427600 Sobic002G427600 Sobic003G159300--Sobic002G427600 Sobic003G159300--Sobic001G234733 Sobic007G212250 Sobic007G212250 Sobic003G159300--Sobic007G212250 Sobic003G354050 Sobic003G354050 Sobic003G159300--Sobic003G354050 Sobic001G382332 Sobic001G382332 Sobic003G159300--Sobic001G382332 Sobic002G406000 Sobic002G406000 Sobic003G159300--Sobic002G406000 Sobic007G220033 Sobic007G220033 Sobic003G159300--Sobic007G220033 Sobic003G125751 Sobic003G125751 Sobic003G159300--Sobic003G125751 Sobic007G011100 Sobic007G011100 Sobic006G145650--Sobic007G011100 Sobic006G145650--Sobic003G159300 Sobic001G222150 Sobic001G222150 Sobic006G145650--Sobic001G222150 Sobic002G220400 Sobic002G220400 Sobic006G145650--Sobic002G220400 Sobic006G145650--Sobic008G157700 Sobic006G145650--Sobic001G150901 Sobic006G145650--Sobic010G214950 Sobic006G192600 Sobic006G192600 Sobic006G145650--Sobic006G192600 Sobic006G145650--Sobic004G013900 Sobic004G013900--Sobic010G214950 Sobic004G013900--Sobic001G059150 Sobic004G013900--Sobic001G150901 Sobic004G013900--Sobic007G011100 Sobic004G013900--Sobic001G222150 Sobic004G013900--Sobic006G145650 Sobic002G423901 Sobic002G423901 Sobic004G013900--Sobic002G423901 Sobic004G013900--Sobic007G223250 Sobic004G013900--Sobic002G288700 Sobic001G234733--Sobic004G198701 Sobic001G234733--Sobic003G354050 Sobic001G234733--Sobic002G277000 Sobic001G234733--Sobic001G059150 Sobic001G234733--Sobic002G423901 Sobic001G234733--Sobic003G200400 Sobic001G234733--Sobic003G159300 Sobic001G234733--Sobic003G277550 Sobic001G234733--Sobic003G168350 Sobic005G008400--Sobic004G346700 Sobic005G008400--Sobic003G168350 Sobic005G008400--Sobic001G365332 Sobic008G139100 Sobic008G139100 Sobic005G008400--Sobic008G139100 Sobic005G008400--Sobic004G198701 Sobic005G008400--Sobic002G174000 Sobic001G195550 Sobic001G195550 Sobic005G008400--Sobic001G195550 Sobic001G045500 Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic001G045500 Sobic005G008400--Sobic006G005550 Sobic010G214950--Sobic001G059150 Sobic010G214950--Sobic001G150901 Sobic010G214950--Sobic007G011100 Sobic010G214950--Sobic001G234733 Sobic010G214950--Sobic005G146900 Sobic010G214950--Sobic004G013900 Sobic010G214950--Sobic002G288700 Sobic010G214950--Sobic007G223250 Sobic010G214950--Sobic003G200400
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.