Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G095500.1
Synonym Sb04g007880, CYP711A1, SbCYP711A19;MORE AXILLARY GROWTH1c, SbMAX1c/CYP711A19, MAX1
Functional annotation "CYP711A family, the cytochrome P450 homepage. Its recombinant protein did not converted CLA to 5DS or 5DS to hydroxylated 5DS." (PubMedID : 33793911)
Synthesized carlactonoic acid (CLA) from carlactone (CL). (PubMedID : 34970291)
cytochrome P450, putative, expressed
UniProt C5XYF4
Pfam PF00067
Panther DB PTHR24301 PTHR24301:SF6
NCBI CDD KOG0158; Cytochrome P450 CYP3/CYP5/CYP6/CYP9 subfamilies
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0016705; oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen GO:0005506iron ion binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26170 : cytochrome P450, family 711, subfamily A, polypeptide 1
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g12890.1 : cytochrome P450, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a034554 , Zm00025a023285
Brachypodium PNT66194
Barley HORVU6Hr1G040170.1 , HORVU6Hr1G040170.2
Wheat TraesCS6B02G217300 , TraesCS6A02G187200 , TraesCS6D02G174100
Populus -


JBrowse

Open New Page


cDNA sequences
Sobic.004G095500


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G093700 tetraspanin family protein, putative, expressed -
2 Sobic.010G100700 HEAT repeat family protein, putative, expressed -
3 Sobic.003G312800 - -
4 Sobic.001G460900 expressed protein -
5 Sobic.008G072800 OsMADS33 - MADS-box family gene with MIKCc type-box, expressed -
6 Sobic.009G074800 - -
7 Sobic.010G183350 - -
8 Sobic.003G023450 - -
9 Sobic.008G132500 pleiotropic drug resistance protein 15, putative, expressed -
10 Sobic.008G142200 serine/threonine-protein kinase BRI1-like 2 precursor, putative, expressed -
11 Sobic.001G250750 - -
12 Sobic.008G083100 expressed protein -
13 Sobic.008G190600 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@oxidoreductase, putative, expressed K07007: 3-dehydro-bile acid Delta4,6-reductase
14 Sobic.007G141900 resistance protein SlVe1 precursor, putative, expressed -
15 Sobic.002G324801 - -
16 Sobic.003G401700 - -
17 Sobic.009G026700 expressed protein -
18 Sobic.009G064300 cytokinin-O-glucosyltransferase 1, putative, expressed -
19 Sobic.005G027350 - -
20 Sobic.004G033650 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G095500 Sobic004G095500 Sobic004G093700 Sobic004G093700 Sobic004G095500--Sobic004G093700 Sobic010G100700 Sobic010G100700 Sobic004G095500--Sobic010G100700 Sobic003G312800 Sobic003G312800 Sobic004G095500--Sobic003G312800 Sobic001G460900 Sobic001G460900 Sobic004G095500--Sobic001G460900 Sobic008G072800 Sobic008G072800 Sobic004G095500--Sobic008G072800 Sobic009G074800 Sobic009G074800 Sobic004G095500--Sobic009G074800 Sobic010G183350 Sobic010G183350 Sobic004G095500--Sobic010G183350 Sobic003G023450 Sobic003G023450 Sobic004G095500--Sobic003G023450 Sobic008G132500 Sobic008G132500 Sobic004G095500--Sobic008G132500 Sobic004G093700--Sobic010G100700 Sobic003G063400 Sobic003G063400 Sobic004G093700--Sobic003G063400 Sobic009G026600 Sobic009G026600 Sobic004G093700--Sobic009G026600 Sobic004G093700--Sobic008G072800 Sobic007G183600 Sobic007G183600 Sobic004G093700--Sobic007G183600 Sobic004G250400 Sobic004G250400 Sobic004G093700--Sobic004G250400 Sobic008G142200 Sobic008G142200 Sobic004G093700--Sobic008G142200 Sobic007G141900 Sobic007G141900 Sobic004G093700--Sobic007G141900 Sobic002G324801 Sobic002G324801 Sobic004G093700--Sobic002G324801 Sobic010G100700--Sobic004G093700 Sobic010G100700--Sobic008G072800 Sobic010G100700--Sobic003G023450 Sobic010G100700--Sobic007G141900 Sobic010G100700--Sobic008G142200 Sobic010G100700--Sobic003G063400 Sobic010G100700--Sobic002G324801 Sobic002G012100 Sobic002G012100 Sobic010G100700--Sobic002G012100 Sobic010G100700--Sobic008G132500 Sobic003G312900 Sobic003G312900 Sobic003G312800--Sobic003G312900 Sobic002G398300 Sobic002G398300 Sobic003G312800--Sobic002G398300 Sobic005G068000 Sobic005G068000 Sobic003G312800--Sobic005G068000 Sobic001G190900 Sobic001G190900 Sobic003G312800--Sobic001G190900 Sobic003G312600 Sobic003G312600 Sobic003G312800--Sobic003G312600 Sobic004G209100 Sobic004G209100 Sobic003G312800--Sobic004G209100 Sobic001G239000 Sobic001G239000 Sobic003G312800--Sobic001G239000 Sobic005G180850 Sobic005G180850 Sobic003G312800--Sobic005G180850 Sobic005G027350 Sobic005G027350 Sobic003G312800--Sobic005G027350 Sobic001G460900--Sobic009G026600 Sobic001G460900--Sobic009G074800 Sobic008G190600 Sobic008G190600 Sobic001G460900--Sobic008G190600 Sobic008G170800 Sobic008G170800 Sobic001G460900--Sobic008G170800 Sobic001G460900--Sobic005G027350 Sobic001G090700 Sobic001G090700 Sobic001G460900--Sobic001G090700 Sobic002G309300 Sobic002G309300 Sobic001G460900--Sobic002G309300 Sobic001G038700 Sobic001G038700 Sobic001G460900--Sobic001G038700 Sobic009G186300 Sobic009G186300 Sobic001G460900--Sobic009G186300 Sobic008G072800--Sobic007G141900 Sobic008G072800--Sobic010G100700 Sobic008G072800--Sobic008G142200 Sobic006G072701 Sobic006G072701 Sobic008G072800--Sobic006G072701 Sobic008G072800--Sobic002G012100 Sobic008G072800--Sobic003G023450 Sobic008G072800--Sobic002G324801 Sobic008G072800--Sobic008G132500 Sobic001G191500 Sobic001G191500 Sobic008G072800--Sobic001G191500 Sobic009G074800--Sobic008G190600 Sobic009G026700 Sobic009G026700 Sobic009G074800--Sobic009G026700 Sobic004G033650 Sobic004G033650 Sobic009G074800--Sobic004G033650 Sobic008G083100 Sobic008G083100 Sobic009G074800--Sobic008G083100 Sobic003G272000 Sobic003G272000 Sobic009G074800--Sobic003G272000 Sobic009G074800--Sobic006G072701 Sobic001G250750 Sobic001G250750 Sobic009G074800--Sobic001G250750 Sobic001G001800 Sobic001G001800 Sobic009G074800--Sobic001G001800 Sobic003G375500 Sobic003G375500 Sobic009G074800--Sobic003G375500 Sobic010G183350--Sobic003G375500 Sobic003G401700 Sobic003G401700 Sobic010G183350--Sobic003G401700 Sobic010G183350--Sobic009G026700 Sobic010G183350--Sobic003G312800 Sobic005G137500 Sobic005G137500 Sobic010G183350--Sobic005G137500 Sobic010G183350--Sobic009G074800 Sobic003G124400 Sobic003G124400 Sobic010G183350--Sobic003G124400 Sobic010G183350--Sobic001G250750 Sobic002G009000 Sobic002G009000 Sobic010G183350--Sobic002G009000 Sobic003G023450--Sobic010G100700 Sobic003G023450--Sobic008G072800 Sobic003G023450--Sobic008G132500 Sobic003G023450--Sobic007G141900 Sobic003G023450--Sobic002G012100 Sobic003G219300 Sobic003G219300 Sobic003G023450--Sobic003G219300 Sobic004G150300 Sobic004G150300 Sobic003G023450--Sobic004G150300 Sobic009G064300 Sobic009G064300 Sobic003G023450--Sobic009G064300 Sobic007G078700 Sobic007G078700 Sobic003G023450--Sobic007G078700 Sobic008G132500--Sobic002G009000 Sobic008G132500--Sobic001G250750 Sobic008G132500--Sobic004G209100 Sobic010G235100 Sobic010G235100 Sobic008G132500--Sobic010G235100 Sobic005G118800 Sobic005G118800 Sobic008G132500--Sobic005G118800 Sobic008G132500--Sobic003G312900 Sobic008G132500--Sobic003G219300 Sobic003G109150 Sobic003G109150 Sobic008G132500--Sobic003G109150 Sobic003G232600 Sobic003G232600 Sobic008G132500--Sobic003G232600
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.