Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G144800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A194YQU7
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
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Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G256601 - -
2 Sobic.004G052600 - -
3 Sobic.005G140900 OsFBX230 - F-box domain containing protein, expressed -
4 Sobic.008G138400 expressed protein -
5 Sobic.006G017700 expressed protein -
6 Sobic.002G097300 OsFBLD5 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
7 Sobic.005G000900 OsFBX103 - F-box domain containing protein, expressed -
8 Sobic.002G156400 "domain confirmed by Pfam database, expression supported by NCBI EST database, expressed in leaf, flower, stem and root, expression induced by IAA, BR and ABA treatments"(PubMedID : 20528920)@MDR-like ABC transporter, putative, expressed K05658: ABCB1, ATP-binding cassette, subfamily B (MDR/TAP), member 1
9 Sobic.001G143700 cupin domain containing protein, expressed -
10 Sobic.008G036100 expressed protein -
11 Sobic.005G189100 transcription factor Dp, putative, expressed -
12 Sobic.005G148000 - -
13 Sobic.002G006200 - -
14 Sobic.001G089300 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@periplasmic beta-glucosidase precursor, putative, expressed K05349: beta-glucosidase
15 Sobic.002G182701 - -
16 Sobic.001G117100 - -
17 Sobic.006G017900 DEFL55 - Defensin and Defensin-like DEFL family, expressed -
18 Sobic.001G211700 MBTB33 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
19 Sobic.009G234900 WRKY43, expressed -
20 Sobic.005G040100 expressed protein -


Gene co-expression network
sample Sobic004G144800 Sobic004G144800 Sobic009G256601 Sobic009G256601 Sobic004G144800--Sobic009G256601 Sobic004G052600 Sobic004G052600 Sobic004G144800--Sobic004G052600 Sobic005G140900 Sobic005G140900 Sobic004G144800--Sobic005G140900 Sobic008G138400 Sobic008G138400 Sobic004G144800--Sobic008G138400 Sobic006G017700 Sobic006G017700 Sobic004G144800--Sobic006G017700 Sobic002G097300 Sobic002G097300 Sobic004G144800--Sobic002G097300 Sobic005G000900 Sobic005G000900 Sobic004G144800--Sobic005G000900 Sobic002G156400 Sobic002G156400 Sobic004G144800--Sobic002G156400 Sobic001G143700 Sobic001G143700 Sobic004G144800--Sobic001G143700 Sobic007G035200 Sobic007G035200 Sobic009G256601--Sobic007G035200 Sobic005G006400 Sobic005G006400 Sobic009G256601--Sobic005G006400 Sobic003G351100 Sobic003G351100 Sobic009G256601--Sobic003G351100 Sobic003G007650 Sobic003G007650 Sobic009G256601--Sobic003G007650 Sobic008G086500 Sobic008G086500 Sobic009G256601--Sobic008G086500 Sobic007G014000 Sobic007G014000 Sobic009G256601--Sobic007G014000 Sobic010G240300 Sobic010G240300 Sobic009G256601--Sobic010G240300 Sobic002G194300 Sobic002G194300 Sobic009G256601--Sobic002G194300 Sobic010G090200 Sobic010G090200 Sobic009G256601--Sobic010G090200 Sobic004G052600--Sobic005G000900 Sobic002G182701 Sobic002G182701 Sobic004G052600--Sobic002G182701 Sobic004G052600--Sobic006G017700 Sobic004G100300 Sobic004G100300 Sobic004G052600--Sobic004G100300 Sobic006G017900 Sobic006G017900 Sobic004G052600--Sobic006G017900 Sobic001G211700 Sobic001G211700 Sobic004G052600--Sobic001G211700 Sobic004G052600--Sobic002G156400 Sobic009G182100 Sobic009G182100 Sobic004G052600--Sobic009G182100 Sobic002G384900 Sobic002G384900 Sobic004G052600--Sobic002G384900 Sobic005G140900--Sobic008G138400 Sobic005G140900--Sobic002G156400 Sobic005G140900--Sobic002G097300 Sobic008G036100 Sobic008G036100 Sobic005G140900--Sobic008G036100 Sobic005G189100 Sobic005G189100 Sobic005G140900--Sobic005G189100 Sobic002G006200 Sobic002G006200 Sobic005G140900--Sobic002G006200 Sobic001G089300 Sobic001G089300 Sobic005G140900--Sobic001G089300 Sobic005G140900--Sobic001G143700 Sobic009G234900 Sobic009G234900 Sobic005G140900--Sobic009G234900 Sobic008G138400--Sobic002G097300 Sobic008G138400--Sobic002G156400 Sobic008G138400--Sobic005G140900 Sobic008G138400--Sobic005G189100 Sobic008G138400--Sobic002G006200 Sobic008G138400--Sobic001G089300 Sobic008G138400--Sobic001G143700 Sobic008G138400--Sobic009G234900 Sobic005G148000 Sobic005G148000 Sobic008G138400--Sobic005G148000 Sobic006G017700--Sobic002G182701 Sobic006G017700--Sobic006G017900 Sobic006G017700--Sobic001G211700 Sobic006G017700--Sobic002G384900 Sobic006G017700--Sobic005G000900 Sobic006G017700--Sobic005G140900 Sobic006G017700--Sobic002G156400 Sobic006G017700--Sobic009G182100 Sobic006G017700--Sobic008G138400 Sobic002G097300--Sobic008G138400 Sobic002G097300--Sobic002G006200 Sobic002G097300--Sobic001G143700 Sobic002G097300--Sobic005G140900 Sobic002G097300--Sobic005G189100 Sobic002G097300--Sobic002G156400 Sobic002G097300--Sobic005G148000 Sobic002G097300--Sobic001G089300 Sobic002G097300--Sobic008G036100 Sobic005G000900--Sobic006G017700 Sobic005G000900--Sobic002G182701 Sobic005G000900--Sobic006G017900 Sobic005G000900--Sobic002G156400 Sobic005G000900--Sobic002G384900 Sobic005G000900--Sobic001G211700 Sobic005G000900--Sobic009G182100 Sobic005G000900--Sobic005G140900 Sobic005G000900--Sobic004G100300 Sobic002G156400--Sobic008G138400 Sobic002G156400--Sobic005G140900 Sobic002G156400--Sobic002G097300 Sobic002G156400--Sobic005G189100 Sobic002G156400--Sobic001G089300 Sobic002G156400--Sobic009G234900 Sobic002G156400--Sobic002G006200 Sobic010G121700 Sobic010G121700 Sobic002G156400--Sobic010G121700 Sobic002G156400--Sobic008G036100 Sobic001G143700--Sobic005G148000 Sobic001G143700--Sobic002G006200 Sobic001G143700--Sobic005G189100 Sobic001G143700--Sobic002G097300 Sobic005G040100 Sobic005G040100 Sobic001G143700--Sobic005G040100 Sobic001G143700--Sobic008G138400 Sobic001G143700--Sobic001G089300 Sobic001G143700--Sobic009G234900 Sobic007G122600 Sobic007G122600 Sobic001G143700--Sobic007G122600
Octagon: transcription factors


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