Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G166600.1
Synonym Sb04g021800
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XTG1
Pfam PF11250
Panther DB PTHR33155 PTHR33155:SF9
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G22390 : Protein of unknown function (DUF3049)
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g33090.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a020544
Brachypodium KQJ82519
Barley HORVU5Hr1G006600.2 , HORVU5Hr1G006720.1 , HORVU5Hr1G006720.3
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G210400 OsFBDUF22 - F-box and DUF domain containing protein, expressed -
2 Sobic.007G059150 - -
3 Sobic.002G152100 alpha-galactosidase precursor, putative, expressed -
4 Sobic.001G516400 - -
5 Sobic.001G330775 - -
6 Sobic.007G134300 - -
7 Sobic.005G076700 - -
8 Sobic.007G226900 ELF protein, expressed -
9 Sobic.009G258800 - -
10 Sobic.004G223700 - -
11 Sobic.001G050650 - -
12 Sobic.006G252800 - -
13 Sobic.002G112200 - -
14 Sobic.010G098800 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed K03884: NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6
15 Sobic.002G073000 - -
16 Sobic.K031300 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 6, putative, expressed -
17 Sobic.009G148400 - -
18 Sobic.002G094100 kinesin motor domain containing protein, putative, expressed -
19 Sobic.004G272950 - -
20 Sobic.003G173200 NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 4, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G166600 Sobic004G166600 Sobic005G210400 Sobic005G210400 Sobic004G166600--Sobic005G210400 Sobic007G059150 Sobic007G059150 Sobic004G166600--Sobic007G059150 Sobic002G152100 Sobic002G152100 Sobic004G166600--Sobic002G152100 Sobic001G516400 Sobic001G516400 Sobic004G166600--Sobic001G516400 Sobic001G330775 Sobic001G330775 Sobic004G166600--Sobic001G330775 Sobic007G134300 Sobic007G134300 Sobic004G166600--Sobic007G134300 Sobic005G076700 Sobic005G076700 Sobic004G166600--Sobic005G076700 Sobic007G226900 Sobic007G226900 Sobic004G166600--Sobic007G226900 Sobic009G258800 Sobic009G258800 Sobic004G166600--Sobic009G258800 Sobic005G210400--Sobic004G166600 Sobic005G210400--Sobic001G330775 Sobic005G210400--Sobic007G059150 Sobic005G210400--Sobic009G258800 Sobic005G210400--Sobic001G516400 Sobic009G195100 Sobic009G195100 Sobic005G210400--Sobic009G195100 Sobic007G168700 Sobic007G168700 Sobic005G210400--Sobic007G168700 Sobic003G244850 Sobic003G244850 Sobic005G210400--Sobic003G244850 Sobic005G210400--Sobic005G076700 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic007G059150--Sobic007G079901 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic007G059150--Sobic002G018200 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic007G059150--Sobic004G334501 SobicK032500 SobicK032500 Sobic007G059150--SobicK032500 Sobic001G527550 Sobic001G527550 Sobic007G059150--Sobic001G527550 Sobic007G059150--Sobic005G076700 Sobic007G059150--Sobic004G166600 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic007G059150--Sobic003G263450 Sobic002G022500 Sobic002G022500 Sobic007G059150--Sobic002G022500 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic002G152100--Sobic004G272950 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic002G152100--Sobic003G172000 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic002G152100--Sobic002G121050 Sobic003G173200 Sobic003G173200 Sobic002G152100--Sobic003G173200 Sobic004G223700 Sobic004G223700 Sobic002G152100--Sobic004G223700 Sobic007G116150 Sobic007G116150 Sobic002G152100--Sobic007G116150 Sobic003G268100 Sobic003G268100 Sobic002G152100--Sobic003G268100 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G152100--Sobic009G094100 Sobic010G143700 Sobic010G143700 Sobic002G152100--Sobic010G143700 Sobic009G158150 Sobic009G158150 Sobic001G516400--Sobic009G158150 Sobic010G166201 Sobic010G166201 Sobic001G516400--Sobic010G166201 Sobic002G178900 Sobic002G178900 Sobic001G516400--Sobic002G178900 Sobic005G168900 Sobic005G168900 Sobic001G516400--Sobic005G168900 Sobic007G045750 Sobic007G045750 Sobic001G516400--Sobic007G045750 Sobic006G053601 Sobic006G053601 Sobic001G516400--Sobic006G053601 Sobic010G098800 Sobic010G098800 Sobic001G516400--Sobic010G098800 Sobic003G129700 Sobic003G129700 Sobic001G516400--Sobic003G129700 Sobic006G174050 Sobic006G174050 Sobic001G516400--Sobic006G174050 Sobic001G330775--Sobic005G210400 Sobic001G437050 Sobic001G437050 Sobic001G330775--Sobic001G437050 Sobic001G330775--Sobic004G166600 Sobic007G195900 Sobic007G195900 Sobic001G330775--Sobic007G195900 Sobic003G370800 Sobic003G370800 Sobic001G330775--Sobic003G370800 Sobic009G020300 Sobic009G020300 Sobic001G330775--Sobic009G020300 Sobic010G037701 Sobic010G037701 Sobic001G330775--Sobic010G037701 Sobic010G003800 Sobic010G003800 Sobic001G330775--Sobic010G003800 Sobic001G330775--Sobic007G168700 SobicK032600 SobicK032600 Sobic007G134300--SobicK032600 SobicK032400 SobicK032400 Sobic007G134300--SobicK032400 Sobic004G206000 Sobic004G206000 Sobic007G134300--Sobic004G206000 Sobic007G134300--Sobic007G116150 Sobic009G209650 Sobic009G209650 Sobic007G134300--Sobic009G209650 SobicK032350 SobicK032350 Sobic007G134300--SobicK032350 Sobic002G126700 Sobic002G126700 Sobic007G134300--Sobic002G126700 SobicK031300 SobicK031300 Sobic007G134300--SobicK031300 Sobic001G081450 Sobic001G081450 Sobic007G134300--Sobic001G081450 Sobic005G076700--Sobic003G263450 Sobic001G145550 Sobic001G145550 Sobic005G076700--Sobic001G145550 Sobic005G076700--Sobic007G079901 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic005G076700--Sobic002G163400 Sobic002G094000 Sobic002G094000 Sobic005G076700--Sobic002G094000 Sobic005G076700--Sobic002G018200 Sobic005G076700--Sobic004G334501 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic005G076700--Sobic006G094900 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic005G076700--Sobic002G149600 Sobic009G145200 Sobic009G145200 Sobic007G226900--Sobic009G145200 Sobic007G098050 Sobic007G098050 Sobic007G226900--Sobic007G098050 Sobic002G112500 Sobic002G112500 Sobic007G226900--Sobic002G112500 Sobic001G471050 Sobic001G471050 Sobic007G226900--Sobic001G471050 Sobic007G226900--Sobic004G206000 Sobic007G226900--Sobic004G223700 Sobic007G226900--SobicK032600 Sobic006G264400 Sobic006G264400 Sobic007G226900--Sobic006G264400 Sobic007G226900--SobicK032400 Sobic009G258800--Sobic002G022500 Sobic005G192350 Sobic005G192350 Sobic009G258800--Sobic005G192350 Sobic010G166850 Sobic010G166850 Sobic009G258800--Sobic010G166850 Sobic009G258800--Sobic010G166201 Sobic009G258800--SobicK032500 Sobic008G081100 Sobic008G081100 Sobic009G258800--Sobic008G081100 Sobic010G259800 Sobic010G259800 Sobic009G258800--Sobic010G259800 Sobic009G258800--Sobic009G158150 Sobic007G179100 Sobic007G179100 Sobic009G258800--Sobic007G179100
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.