Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G189301.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RN83
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g36530.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G036500 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
2 Sobic.006G038800 purple acid phosphatase 27("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
3 Sobic.008G044500 zinc finger superfamily protein("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@expressed protein -
4 Sobic.002G156900 expressed protein -
5 Sobic.002G018500 - -
6 Sobic.001G382266 - -
7 Sobic.001G382266 - -
8 Sobic.001G382266 - -
9 Sobic.001G382266 - -
10 Sobic.001G382266 - -
11 Sobic.001G382266 - -
12 Sobic.001G382266 - -
13 Sobic.005G089500 kinase, putative, expressed -
14 Sobic.009G158700 - -
15 Sobic.001G133532 - -
16 Sobic.001G276700 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
17 Sobic.001G478200 - -
18 Sobic.009G003500 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
19 Sobic.006G277550 - K00430: peroxidase
20 Sobic.008G059300 AP2 domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G189301 Sobic004G189301 Sobic006G036500 Sobic006G036500 Sobic004G189301--Sobic006G036500 Sobic006G038800 Sobic006G038800 Sobic004G189301--Sobic006G038800 Sobic008G044500 Sobic008G044500 Sobic004G189301--Sobic008G044500 Sobic002G156900 Sobic002G156900 Sobic004G189301--Sobic002G156900 Sobic002G018500 Sobic002G018500 Sobic004G189301--Sobic002G018500 Sobic001G382266 Sobic001G382266 Sobic004G189301--Sobic001G382266 Sobic006G036500--Sobic006G038800 Sobic006G036500--Sobic002G156900 Sobic002G182500 Sobic002G182500 Sobic006G036500--Sobic002G182500 Sobic006G036500--Sobic004G189301 Sobic002G183100 Sobic002G183100 Sobic006G036500--Sobic002G183100 Sobic006G002100 Sobic006G002100 Sobic006G036500--Sobic006G002100 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic006G036500--Sobic010G110266 Sobic006G036500--Sobic002G018500 Sobic005G089500 Sobic005G089500 Sobic006G036500--Sobic005G089500 Sobic006G038800--Sobic006G036500 Sobic006G038800--Sobic005G089500 Sobic006G038800--Sobic002G183100 Sobic006G277550 Sobic006G277550 Sobic006G038800--Sobic006G277550 Sobic006G038800--Sobic002G018500 Sobic006G038800--Sobic002G156900 Sobic006G038800--Sobic002G182500 Sobic006G038800--Sobic006G002100 Sobic001G248500 Sobic001G248500 Sobic006G038800--Sobic001G248500 Sobic008G044500--Sobic006G277550 Sobic009G158700 Sobic009G158700 Sobic008G044500--Sobic009G158700 Sobic008G044500--Sobic004G189301 Sobic008G044500--Sobic006G038800 Sobic001G243600 Sobic001G243600 Sobic008G044500--Sobic001G243600 Sobic002G196100 Sobic002G196100 Sobic008G044500--Sobic002G196100 Sobic005G213200 Sobic005G213200 Sobic008G044500--Sobic005G213200 Sobic008G044500--Sobic006G036500 Sobic001G243500 Sobic001G243500 Sobic008G044500--Sobic001G243500 Sobic002G156900--Sobic006G036500 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic002G156900--Sobic008G092932 Sobic002G156900--Sobic006G038800 Sobic002G156900--Sobic010G110266 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic002G156900--Sobic008G121400 Sobic002G156900--Sobic006G002100 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic002G156900--Sobic007G101900 Sobic002G156900--Sobic002G183100 Sobic002G156900--Sobic005G089500 Sobic007G135201 Sobic007G135201 Sobic002G018500--Sobic007G135201 Sobic004G128400 Sobic004G128400 Sobic002G018500--Sobic004G128400 Sobic001G453100 Sobic001G453100 Sobic002G018500--Sobic001G453100 Sobic002G018500--Sobic006G038800 Sobic002G018500--Sobic002G182500 Sobic007G067600 Sobic007G067600 Sobic002G018500--Sobic007G067600 Sobic003G426100 Sobic003G426100 Sobic002G018500--Sobic003G426100 Sobic004G111800 Sobic004G111800 Sobic002G018500--Sobic004G111800 Sobic007G066932 Sobic007G066932 Sobic002G018500--Sobic007G066932 Sobic001G382266--Sobic001G382266 Sobic001G276700 Sobic001G276700 Sobic001G382266--Sobic001G276700 Sobic008G059300 Sobic008G059300 Sobic001G382266--Sobic008G059300 Sobic002G144150 Sobic002G144150 Sobic001G382266--Sobic002G144150
Octagon: transcription factors


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