Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G156900.1
Synonym Sb02g019570
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1W0W4C4
Pfam -
Panther DB PTHR19316 PTHR19316:SF6
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G51980 : ARM repeat superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g33780.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047622
Brachypodium KQJ90979
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.006G036500 peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, chloroplast precursor, putative, expressed -
2 Sobic.008G092932 - -
3 Sobic.006G038800 purple acid phosphatase 27("PubMedID : 26759170,PubMedID : 24597475")@nucleotide pyrophosphatase/phosphodiesterase, putative, expressed -
4 Sobic.010G110266 - -
5 Sobic.008G121400 expressed protein -
6 Sobic.006G002100 phosphoglycerate mutase, putative, expressed -
7 Sobic.007G101900 - -
8 Sobic.002G183100 SAG (Senescence-associated gene): differentially expressed gene during developmental senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
9 Sobic.005G089500 kinase, putative, expressed -
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11 Sobic.002G184100 heat shock protein DnaJ, putative, expressed -
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13 Sobic.010G136400 - -
14 Sobic.002G182500 nucleic acid binding protein, putative, expressed -
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16 Sobic.008G122700 expressed protein -
17 Sobic.001G382266 - -
18 Sobic.001G382266 - -
19 Sobic.001G382266 - -
20 Sobic.001G382266 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G156900 Sobic002G156900 Sobic006G036500 Sobic006G036500 Sobic002G156900--Sobic006G036500 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic002G156900--Sobic008G092932 Sobic006G038800 Sobic006G038800 Sobic002G156900--Sobic006G038800 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic002G156900--Sobic010G110266 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic002G156900--Sobic008G121400 Sobic006G002100 Sobic006G002100 Sobic002G156900--Sobic006G002100 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic002G156900--Sobic007G101900 Sobic002G183100 Sobic002G183100 Sobic002G156900--Sobic002G183100 Sobic005G089500 Sobic005G089500 Sobic002G156900--Sobic005G089500 Sobic006G036500--Sobic006G038800 Sobic006G036500--Sobic002G156900 Sobic002G182500 Sobic002G182500 Sobic006G036500--Sobic002G182500 Sobic004G189301 Sobic004G189301 Sobic006G036500--Sobic004G189301 Sobic006G036500--Sobic002G183100 Sobic006G036500--Sobic006G002100 Sobic006G036500--Sobic010G110266 Sobic002G018500 Sobic002G018500 Sobic006G036500--Sobic002G018500 Sobic006G036500--Sobic005G089500 Sobic008G092932--Sobic008G121400 Sobic008G092932--Sobic002G156900 Sobic008G092932--Sobic007G101900 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic008G092932--Sobic010G136400 Sobic008G092932--Sobic010G110266 Sobic001G276700 Sobic001G276700 Sobic008G092932--Sobic001G276700 Sobic008G122700 Sobic008G122700 Sobic008G092932--Sobic008G122700 Sobic001G382266 Sobic001G382266 Sobic008G092932--Sobic001G382266 Sobic006G038800--Sobic006G036500 Sobic006G038800--Sobic005G089500 Sobic006G038800--Sobic002G183100 Sobic006G277550 Sobic006G277550 Sobic006G038800--Sobic006G277550 Sobic006G038800--Sobic002G018500 Sobic006G038800--Sobic002G156900 Sobic006G038800--Sobic002G182500 Sobic006G038800--Sobic006G002100 Sobic001G248500 Sobic001G248500 Sobic006G038800--Sobic001G248500 Sobic010G110266--Sobic008G121400 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic010G110266--Sobic006G063400 Sobic010G110266--Sobic006G036500 Sobic010G110266--Sobic010G136400 Sobic010G110266--Sobic002G156900 Sobic010G110266--Sobic007G101900 Sobic010G149700 Sobic010G149700 Sobic010G110266--Sobic010G149700 Sobic010G110266--Sobic008G092932 Sobic010G110266--Sobic006G038800 Sobic008G121400--Sobic007G101900 Sobic008G121400--Sobic008G092932 Sobic008G121400--Sobic010G136400 Sobic008G121400--Sobic006G063400 Sobic008G121400--Sobic010G110266 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic008G121400--Sobic001G197300 Sobic005G188200 Sobic005G188200 Sobic008G121400--Sobic005G188200 Sobic008G121400--Sobic002G156900 Sobic008G121400--Sobic008G122700 Sobic006G002100--Sobic002G183100 Sobic007G016100 Sobic007G016100 Sobic006G002100--Sobic007G016100 Sobic006G002100--Sobic006G036500 Sobic006G107200 Sobic006G107200 Sobic006G002100--Sobic006G107200 Sobic006G002100--Sobic006G038800 Sobic004G037000 Sobic004G037000 Sobic006G002100--Sobic004G037000 Sobic006G002100--Sobic001G248500 Sobic006G002100--Sobic002G156900 Sobic001G348700 Sobic001G348700 Sobic006G002100--Sobic001G348700 Sobic007G101900--Sobic010G136400 Sobic007G101900--Sobic008G121400 Sobic007G101900--Sobic006G063400 Sobic007G101900--Sobic001G197300 Sobic007G101900--Sobic008G092932 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic007G101900--Sobic007G100032 Sobic008G104100 Sobic008G104100 Sobic007G101900--Sobic008G104100 Sobic007G101900--Sobic010G110266 Sobic007G101900--Sobic002G156900 Sobic008G140300 Sobic008G140300 Sobic002G183100--Sobic008G140300 Sobic002G183100--Sobic001G348700 Sobic004G221500 Sobic004G221500 Sobic002G183100--Sobic004G221500 Sobic007G067400 Sobic007G067400 Sobic002G183100--Sobic007G067400 Sobic010G084700 Sobic010G084700 Sobic002G183100--Sobic010G084700 Sobic001G487300 Sobic001G487300 Sobic002G183100--Sobic001G487300 Sobic002G183100--Sobic004G037000 Sobic002G184200 Sobic002G184200 Sobic002G183100--Sobic002G184200 Sobic002G183100--Sobic002G182500 Sobic005G089500--Sobic006G038800 Sobic005G089500--Sobic006G036500 Sobic005G089500--Sobic002G156900 Sobic010G044001 Sobic010G044001 Sobic005G089500--Sobic010G044001 Sobic005G089500--Sobic006G277550 Sobic005G089500--Sobic002G183100 Sobic005G089500--Sobic006G002100 Sobic005G089500--Sobic002G018500 Sobic001G320400 Sobic001G320400 Sobic005G089500--Sobic001G320400
Octagon: transcription factors


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