Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G122700.2
Synonym Sb08g017520
Functional annotation expressed protein
UniProt A0A1Z5R6C7
Pfam -
Panther DB PTHR33913 PTHR33913:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT1G05950 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g33940.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) Zm00025a047651
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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17 Sobic.001G382266 - -
18 Sobic.001G382266 - -
19 Sobic.001G382266 - -
20 Sobic.001G276700 peptide transporter PTR2, putative, expressed K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4


Gene co-expression network
sample Sobic008G122700 Sobic008G122700 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic008G122700--Sobic008G121400 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic008G122700--Sobic008G092932 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic008G122700--Sobic007G101900 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic008G122700--Sobic010G110266 Sobic002G156900 Sobic002G156900 Sobic008G122700--Sobic002G156900 Sobic005G188200 Sobic005G188200 Sobic008G122700--Sobic005G188200 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic008G122700--Sobic010G136400 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic008G122700--Sobic006G063400 Sobic003G104800 Sobic003G104800 Sobic008G122700--Sobic003G104800 Sobic008G121400--Sobic007G101900 Sobic008G121400--Sobic008G092932 Sobic008G121400--Sobic010G136400 Sobic008G121400--Sobic006G063400 Sobic008G121400--Sobic010G110266 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic008G121400--Sobic001G197300 Sobic008G121400--Sobic005G188200 Sobic008G121400--Sobic002G156900 Sobic008G121400--Sobic008G122700 Sobic008G092932--Sobic008G121400 Sobic008G092932--Sobic002G156900 Sobic008G092932--Sobic007G101900 Sobic008G092932--Sobic010G136400 Sobic008G092932--Sobic010G110266 Sobic001G276700 Sobic001G276700 Sobic008G092932--Sobic001G276700 Sobic008G092932--Sobic008G122700 Sobic001G382266 Sobic001G382266 Sobic008G092932--Sobic001G382266 Sobic007G101900--Sobic010G136400 Sobic007G101900--Sobic008G121400 Sobic007G101900--Sobic006G063400 Sobic007G101900--Sobic001G197300 Sobic007G101900--Sobic008G092932 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic007G101900--Sobic007G100032 Sobic008G104100 Sobic008G104100 Sobic007G101900--Sobic008G104100 Sobic007G101900--Sobic010G110266 Sobic007G101900--Sobic002G156900 Sobic010G110266--Sobic008G121400 Sobic010G110266--Sobic006G063400 Sobic006G036500 Sobic006G036500 Sobic010G110266--Sobic006G036500 Sobic010G110266--Sobic010G136400 Sobic010G110266--Sobic002G156900 Sobic010G110266--Sobic007G101900 Sobic010G149700 Sobic010G149700 Sobic010G110266--Sobic010G149700 Sobic010G110266--Sobic008G092932 Sobic006G038800 Sobic006G038800 Sobic010G110266--Sobic006G038800 Sobic002G156900--Sobic006G036500 Sobic002G156900--Sobic008G092932 Sobic002G156900--Sobic006G038800 Sobic002G156900--Sobic010G110266 Sobic002G156900--Sobic008G121400 Sobic006G002100 Sobic006G002100 Sobic002G156900--Sobic006G002100 Sobic002G156900--Sobic007G101900 Sobic002G183100 Sobic002G183100 Sobic002G156900--Sobic002G183100 Sobic005G089500 Sobic005G089500 Sobic002G156900--Sobic005G089500 Sobic005G188200--Sobic008G121400 Sobic005G188200--Sobic008G104100 Sobic005G188200--Sobic008G092932 Sobic005G188200--Sobic007G101900 Sobic005G188200--Sobic010G110266 Sobic005G188200--Sobic010G136400 Sobic005G188200--Sobic008G122700 Sobic010G272600 Sobic010G272600 Sobic005G188200--Sobic010G272600 Sobic005G188200--Sobic006G063400 Sobic010G136400--Sobic007G101900 Sobic010G136400--Sobic001G197300 Sobic010G136400--Sobic006G063400 Sobic010G136400--Sobic008G121400 Sobic010G136400--Sobic007G100032 Sobic010G136400--Sobic008G104100 Sobic010G136400--Sobic010G110266 Sobic010G136400--Sobic008G092932 Sobic004G135000 Sobic004G135000 Sobic010G136400--Sobic004G135000 Sobic006G063400--Sobic010G136400 Sobic006G063400--Sobic001G197300 Sobic006G063400--Sobic007G101900 Sobic006G063400--Sobic007G100032 Sobic006G063400--Sobic008G121400 Sobic006G063400--Sobic010G110266 Sobic006G063400--Sobic008G104100 Sobic008G112900 Sobic008G112900 Sobic006G063400--Sobic008G112900 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic006G063400--Sobic001G065900 Sobic008G074800 Sobic008G074800 Sobic003G104800--Sobic008G074800 Sobic004G022700 Sobic004G022700 Sobic003G104800--Sobic004G022700 Sobic003G377400 Sobic003G377400 Sobic003G104800--Sobic003G377400 Sobic003G104800--Sobic008G092932 Sobic003G104800--Sobic002G156900 Sobic003G104800--Sobic005G089500 Sobic003G104800--Sobic007G101900 Sobic003G104800--Sobic008G121400 Sobic003G104800--Sobic010G110266
Octagon: transcription factors


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