Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G132800.1
Synonym
Functional annotation hypothetical protein
UniProt A0A194YPD3
Pfam PF03004
Panther DB PTHR33063
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g37230.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G158700 - -
2 Sobic.005G158801 - -
3 Sobic.008G105200 zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed -
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10 Sobic.008G104100 - -
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14 Sobic.008G122700 expressed protein -
15 Sobic.004G017600 expressed protein -
16 Sobic.004G135000 - -
17 Sobic.002G156900 expressed protein -
18 Sobic.008G118800 expressed protein -
19 Sobic.010G222400 MBTB10 - Bric-a-Brac, Tramtrack, Broad Complex BTB domain with Meprin and TRAF Homology MATH domain, expressed K10523: speckle-type POZ protein
20 Sobic.010G110266 - -


Gene co-expression network
sample Sobic004G132800 Sobic004G132800 Sobic005G158700 Sobic005G158700 Sobic004G132800--Sobic005G158700 Sobic005G158801 Sobic005G158801 Sobic004G132800--Sobic005G158801 Sobic008G105200 Sobic008G105200 Sobic004G132800--Sobic008G105200 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic004G132800--Sobic007G101900 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic004G132800--Sobic008G092932 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic004G132800--Sobic010G136400 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic004G132800--Sobic008G121400 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic004G132800--Sobic001G197300 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic004G132800--Sobic006G063400 Sobic005G158700--Sobic005G158801 Sobic005G158700--Sobic004G132800 Sobic005G158700--Sobic001G197300 Sobic003G244900 Sobic003G244900 Sobic005G158700--Sobic003G244900 Sobic005G158700--Sobic010G136400 Sobic005G158700--Sobic006G063400 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic005G158700--Sobic007G100032 Sobic005G158700--Sobic007G101900 Sobic006G206500 Sobic006G206500 Sobic005G158700--Sobic006G206500 Sobic005G158801--Sobic006G206500 Sobic005G158801--Sobic008G105200 Sobic005G158801--Sobic005G158700 Sobic005G158801--Sobic004G132800 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic005G158801--Sobic010G037200 Sobic002G308400 Sobic002G308400 Sobic005G158801--Sobic002G308400 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic005G158801--Sobic007G194100 Sobic005G064200 Sobic005G064200 Sobic005G158801--Sobic005G064200 Sobic004G017600 Sobic004G017600 Sobic005G158801--Sobic004G017600 Sobic008G105200--Sobic005G158801 Sobic002G161600 Sobic002G161600 Sobic008G105200--Sobic002G161600 Sobic009G256500 Sobic009G256500 Sobic008G105200--Sobic009G256500 Sobic008G105200--Sobic004G132800 Sobic005G098700 Sobic005G098700 Sobic008G105200--Sobic005G098700 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic008G105200--Sobic010G084800 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic008G105200--Sobic001G261700 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic008G105200--Sobic010G031400 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic008G105200--Sobic009G057100 Sobic007G101900--Sobic010G136400 Sobic007G101900--Sobic008G121400 Sobic007G101900--Sobic006G063400 Sobic007G101900--Sobic001G197300 Sobic007G101900--Sobic008G092932 Sobic007G101900--Sobic007G100032 Sobic008G104100 Sobic008G104100 Sobic007G101900--Sobic008G104100 Sobic010G110266 Sobic010G110266 Sobic007G101900--Sobic010G110266 Sobic002G156900 Sobic002G156900 Sobic007G101900--Sobic002G156900 Sobic008G092932--Sobic008G121400 Sobic008G092932--Sobic002G156900 Sobic008G092932--Sobic007G101900 Sobic008G092932--Sobic010G136400 Sobic008G092932--Sobic010G110266 Sobic001G276700 Sobic001G276700 Sobic008G092932--Sobic001G276700 Sobic008G122700 Sobic008G122700 Sobic008G092932--Sobic008G122700 Sobic001G382266 Sobic001G382266 Sobic008G092932--Sobic001G382266 Sobic010G136400--Sobic007G101900 Sobic010G136400--Sobic001G197300 Sobic010G136400--Sobic006G063400 Sobic010G136400--Sobic008G121400 Sobic010G136400--Sobic007G100032 Sobic010G136400--Sobic008G104100 Sobic010G136400--Sobic010G110266 Sobic010G136400--Sobic008G092932 Sobic004G135000 Sobic004G135000 Sobic010G136400--Sobic004G135000 Sobic008G121400--Sobic007G101900 Sobic008G121400--Sobic008G092932 Sobic008G121400--Sobic010G136400 Sobic008G121400--Sobic006G063400 Sobic008G121400--Sobic010G110266 Sobic008G121400--Sobic001G197300 Sobic005G188200 Sobic005G188200 Sobic008G121400--Sobic005G188200 Sobic008G121400--Sobic002G156900 Sobic008G121400--Sobic008G122700 Sobic001G197300--Sobic010G136400 Sobic001G197300--Sobic007G100032 Sobic001G197300--Sobic006G063400 Sobic001G197300--Sobic007G101900 Sobic004G094900 Sobic004G094900 Sobic001G197300--Sobic004G094900 Sobic001G197300--Sobic008G104100 Sobic001G065900 Sobic001G065900 Sobic001G197300--Sobic001G065900 Sobic001G197300--Sobic004G135000 Sobic001G381400 Sobic001G381400 Sobic001G197300--Sobic001G381400 Sobic006G063400--Sobic010G136400 Sobic006G063400--Sobic001G197300 Sobic006G063400--Sobic007G101900 Sobic006G063400--Sobic007G100032 Sobic006G063400--Sobic008G121400 Sobic006G063400--Sobic010G110266 Sobic006G063400--Sobic008G104100 Sobic008G112900 Sobic008G112900 Sobic006G063400--Sobic008G112900 Sobic006G063400--Sobic001G065900
Octagon: transcription factors


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