Gene annotation
Transcriptome id Sobic.008G105200.1
Synonym Sb08g015850
Functional annotation zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed
UniProt C5YNY9
Pfam -
Panther DB PTHR36886
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G18640 : Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os08g04170.1 : zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type family protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G158801 - -
2 Sobic.002G161600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.009G256500 OsFtsH5 FtsH protease, homologue of AtFtsH4, expressed K08955: ATP-dependent metalloprotease
4 Sobic.004G132800 hypothetical protein -
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6 Sobic.010G084800 - -
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9 Sobic.009G057100 - -
10 Sobic.003G232332 - -
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13 Sobic.005G188800 - -
14 Sobic.006G081400 - -
15 Sobic.003G294800 plastocyanin-like domain containing protein, putative, expressed -
16 Sobic.005G185400 - -
17 Sobic.005G147500 - -
18 Sobic.004G029800 expressed protein -
19 Sobic.005G184500 - -
20 Sobic.006G264800 GASR6 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic008G105200 Sobic008G105200 Sobic005G158801 Sobic005G158801 Sobic008G105200--Sobic005G158801 Sobic002G161600 Sobic002G161600 Sobic008G105200--Sobic002G161600 Sobic009G256500 Sobic009G256500 Sobic008G105200--Sobic009G256500 Sobic004G132800 Sobic004G132800 Sobic008G105200--Sobic004G132800 Sobic005G098700 Sobic005G098700 Sobic008G105200--Sobic005G098700 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic008G105200--Sobic010G084800 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic008G105200--Sobic001G261700 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic008G105200--Sobic010G031400 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic008G105200--Sobic009G057100 Sobic006G206500 Sobic006G206500 Sobic005G158801--Sobic006G206500 Sobic005G158801--Sobic008G105200 Sobic005G158700 Sobic005G158700 Sobic005G158801--Sobic005G158700 Sobic005G158801--Sobic004G132800 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic005G158801--Sobic010G037200 Sobic002G308400 Sobic002G308400 Sobic005G158801--Sobic002G308400 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic005G158801--Sobic007G194100 Sobic005G064200 Sobic005G064200 Sobic005G158801--Sobic005G064200 Sobic004G017600 Sobic004G017600 Sobic005G158801--Sobic004G017600 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G161600--Sobic009G058300 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic002G161600--Sobic010G047300 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G161600--Sobic002G015400 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G161600--Sobic007G032500 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic002G161600--Sobic002G108300 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G161600--Sobic001G511400 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic002G161600--Sobic002G172100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic002G161600--Sobic002G015500 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic002G161600--Sobic005G174200 Sobic009G256500--Sobic010G031400 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic009G256500--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic009G256500--Sobic005G185400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic009G256500--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic009G256500--Sobic005G184400 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic009G256500--Sobic007G049000 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic009G256500--Sobic006G105300 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic009G256500--Sobic006G142850 Sobic009G256500--Sobic009G057100 Sobic004G132800--Sobic005G158700 Sobic004G132800--Sobic005G158801 Sobic004G132800--Sobic008G105200 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic004G132800--Sobic007G101900 Sobic008G092932 Sobic008G092932 Sobic004G132800--Sobic008G092932 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic004G132800--Sobic010G136400 Sobic008G121400 Sobic008G121400 Sobic004G132800--Sobic008G121400 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic004G132800--Sobic001G197300 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic004G132800--Sobic006G063400 Sobic005G098700--Sobic002G161600 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic005G098700--Sobic006G264800 Sobic005G098700--Sobic010G031400 Sobic005G098700--Sobic002G172100 Sobic005G098700--Sobic001G261700 Sobic005G098700--Sobic009G057100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic005G098700--Sobic005G147500 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic005G098700--Sobic003G294800 Sobic005G098700--Sobic009G058300 Sobic010G084800--Sobic010G047300 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic010G084800--Sobic008G109600 Sobic010G084800--Sobic002G161600 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic010G084800--Sobic001G274025 Sobic010G084800--Sobic006G264800 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic010G084800--Sobic009G021400 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic010G084800--Sobic007G205400 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic010G084800--Sobic010G060100 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic010G084800--Sobic002G409300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic001G261700--Sobic001G284700 Sobic001G261700--Sobic005G147500 Sobic001G261700--Sobic006G264800 Sobic001G261700--Sobic009G057100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G261700--Sobic005G188800 Sobic001G261700--Sobic002G172100 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic001G261700--Sobic009G112200 Sobic001G261700--Sobic001G511400 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic001G261700--Sobic002G172200 Sobic010G031400--Sobic005G185400 Sobic010G031400--Sobic005G184500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic010G031400--Sobic006G081400 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic006G105300 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic004G071100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic010G031400--Sobic010G035000 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic003G294800
Octagon: transcription factors


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