Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G161600.1,Sobic.002G161600.2
Synonym SIS10, ABI3
Functional annotation B3 DNA binding domain containing protein, expressed
UniProt A0A1B6QBR4
Pfam PF02362
Panther DB PTHR31140 PTHR31140:SF1
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology GO:0003677; DNA binding


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT3G24650 : AP2/B3-like transcriptional factor family protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g68370.3 : B3 DNA binding domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a026327
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3A02G417300 , TraesCS3A02G417300 , TraesCS3D02G412800 , TraesCS3D02G412800
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.002G161600


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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20 Sobic.001G489075 - -


Gene co-expression network
sample Sobic002G161600 Sobic002G161600 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G161600--Sobic009G058300 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic002G161600--Sobic010G047300 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G161600--Sobic002G015400 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G161600--Sobic007G032500 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic002G161600--Sobic002G108300 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G161600--Sobic001G511400 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic002G161600--Sobic002G172100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic002G161600--Sobic002G015500 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic002G161600--Sobic005G174200 Sobic009G058300--Sobic002G108300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G058300--Sobic001G284700 Sobic009G058300--Sobic002G172100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic009G058300--Sobic005G147500 Sobic009G058300--Sobic007G032500 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic009G058300--Sobic006G264800 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic001G511400 Sobic009G058300--Sobic002G015400 Sobic010G047300--Sobic009G058300 Sobic010G047300--Sobic006G264800 Sobic010G047300--Sobic002G172100 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic010G047300--Sobic001G489075 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic010G047300--Sobic008G109600 Sobic010G047300--Sobic002G108300 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic010G047300--Sobic002G172200 Sobic010G047300--Sobic001G284700 Sobic010G047300--Sobic002G015400 Sobic008G159300 Sobic008G159300 Sobic002G015400--Sobic008G159300 Sobic002G015400--Sobic001G511400 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G015400--Sobic003G266100 Sobic002G015400--Sobic002G172200 Sobic002G015400--Sobic002G172100 Sobic002G058900 Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic002G058900 Sobic002G015400--Sobic009G058300 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic002G015400--Sobic001G495700 Sobic002G059500 Sobic002G059500 Sobic002G015400--Sobic002G059500 Sobic007G032500--Sobic005G174200 Sobic007G032500--Sobic009G058300 Sobic007G032500--Sobic002G108300 Sobic007G032500--Sobic001G495700 Sobic007G032500--Sobic002G015500 Sobic007G032500--Sobic008G088900 Sobic007G032500--Sobic002G015400 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic007G032500--Sobic010G133150 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic007G032500--Sobic001G374600 Sobic002G108300--Sobic008G088900 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic002G108300--Sobic003G091500 Sobic008G184100 Sobic008G184100 Sobic002G108300--Sobic008G184100 Sobic002G108300--Sobic009G058300 Sobic002G108300--Sobic001G489075 Sobic002G108300--Sobic007G032500 Sobic004G171600 Sobic004G171600 Sobic002G108300--Sobic004G171600 Sobic005G146966 Sobic005G146966 Sobic002G108300--Sobic005G146966 Sobic005G174000 Sobic005G174000 Sobic002G108300--Sobic005G174000 Sobic001G511400--Sobic002G015400 Sobic001G511400--Sobic002G172200 Sobic001G511400--Sobic008G159300 Sobic001G511400--Sobic002G172100 Sobic001G511400--Sobic003G266100 Sobic001G511400--Sobic005G147500 Sobic001G511400--Sobic001G284700 Sobic001G511400--Sobic009G058300 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic001G511400--Sobic005G082300 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic001G495700 Sobic002G015500--Sobic010G133150 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G015500--Sobic009G057100 Sobic002G015500--Sobic007G032500 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic002G015500--Sobic004G071100 Sobic002G015500--Sobic001G511400 Sobic002G015500--Sobic005G147500 Sobic002G015500--Sobic009G058300 Sobic005G174200--Sobic007G032500 Sobic005G174200--Sobic001G374600 Sobic005G174200--Sobic002G108300 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic005G174200--Sobic003G211600 Sobic005G174200--Sobic001G495700 Sobic005G174200--Sobic009G058300 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic005G174200--Sobic005G033600 Sobic005G174200--Sobic008G184100 Sobic005G174200--Sobic003G091500
Octagon: transcription factors


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