Gene annotation
Transcriptome id Sobic.003G232332.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt A0A1W0VYK7
Pfam -
Panther DB PTHR22639 PTHR22639:SF44
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os05g40490.1 : zinc knuckle domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G176875 - -
2 Sobic.007G066200 - -
3 Sobic.001G269650 - -
4 Sobic.002G161600 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
5 Sobic.005G033600 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
6 Sobic.005G226800 pumilio-family RNA binding protein, putative, expressed K17943: pumilio RNA-binding family
7 Sobic.003G211600 - -
8 Sobic.002G015500 OsFBD13 - F-box and FBD domain containing protein, expressed -
9 Sobic.010G084800 - -
10 Sobic.001G495700 Core histone H2A/H2B/H3/H4 domain containing protein, putative, expressed K11251: histone H2A
11 Sobic.008G184500 aspartic proteinase, putative, expressed -
12 Sobic.010G047300 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
13 Sobic.009G062300 BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 1 precursor, putative, expressed -
14 Sobic.010G133150 - -
15 Sobic.007G032500 WD domain, G-beta repeat domain containing protein, expressed K11462: polycomb protein EED
16 Sobic.002G097100 OsFBLD6 - F-box, LRR and FBD domain containing protein, expressed -
17 Sobic.005G124400 - -
18 Sobic.008G164101 - -
19 Sobic.005G174200 - -
20 Sobic.003G103100 - -


Gene co-expression network
sample Sobic003G232332 Sobic003G232332 Sobic005G176875 Sobic005G176875 Sobic003G232332--Sobic005G176875 Sobic007G066200 Sobic007G066200 Sobic003G232332--Sobic007G066200 Sobic001G269650 Sobic001G269650 Sobic003G232332--Sobic001G269650 Sobic002G161600 Sobic002G161600 Sobic003G232332--Sobic002G161600 Sobic005G033600 Sobic005G033600 Sobic003G232332--Sobic005G033600 Sobic005G226800 Sobic005G226800 Sobic003G232332--Sobic005G226800 Sobic003G211600 Sobic003G211600 Sobic003G232332--Sobic003G211600 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic003G232332--Sobic002G015500 Sobic010G084800 Sobic010G084800 Sobic003G232332--Sobic010G084800 Sobic008G184500 Sobic008G184500 Sobic005G176875--Sobic008G184500 Sobic005G176875--Sobic001G269650 Sobic005G176875--Sobic002G015500 Sobic002G097100 Sobic002G097100 Sobic005G176875--Sobic002G097100 Sobic001G495700 Sobic001G495700 Sobic005G176875--Sobic001G495700 Sobic003G319050 Sobic003G319050 Sobic005G176875--Sobic003G319050 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic005G176875--Sobic004G071100 Sobic010G133150 Sobic010G133150 Sobic005G176875--Sobic010G133150 Sobic007G199500 Sobic007G199500 Sobic005G176875--Sobic007G199500 Sobic007G066200--Sobic005G226800 Sobic007G066200--Sobic003G211600 Sobic009G062300 Sobic009G062300 Sobic007G066200--Sobic009G062300 Sobic007G066200--Sobic001G269650 Sobic005G124400 Sobic005G124400 Sobic007G066200--Sobic005G124400 Sobic001G374600 Sobic001G374600 Sobic007G066200--Sobic001G374600 Sobic007G066200--Sobic005G033600 Sobic007G066200--Sobic001G495700 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic007G066200--Sobic005G174200 Sobic001G269650--Sobic007G066200 Sobic001G269650--Sobic009G062300 Sobic001G269650--Sobic005G176875 Sobic001G269650--Sobic005G226800 Sobic001G269650--Sobic001G495700 Sobic001G269650--Sobic008G184500 Sobic001G269650--Sobic003G211600 Sobic001G269650--Sobic002G015500 Sobic001G269650--Sobic005G124400 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic002G161600--Sobic009G058300 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic002G161600--Sobic010G047300 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G161600--Sobic002G015400 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G161600--Sobic007G032500 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic002G161600--Sobic002G108300 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G161600--Sobic001G511400 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic002G161600--Sobic002G172100 Sobic002G161600--Sobic002G015500 Sobic002G161600--Sobic005G174200 Sobic005G033600--Sobic005G174200 Sobic002G267700 Sobic002G267700 Sobic005G033600--Sobic002G267700 Sobic005G033600--Sobic007G032500 Sobic009G139500 Sobic009G139500 Sobic005G033600--Sobic009G139500 Sobic005G033600--Sobic003G211600 Sobic006G070830 Sobic006G070830 Sobic005G033600--Sobic006G070830 Sobic005G033600--Sobic001G374600 Sobic005G033600--Sobic002G015400 Sobic003G091500 Sobic003G091500 Sobic005G033600--Sobic003G091500 Sobic005G226800--Sobic009G062300 Sobic005G226800--Sobic007G066200 Sobic005G226800--Sobic003G211600 Sobic005G226800--Sobic005G124400 Sobic005G226800--Sobic001G269650 Sobic005G226800--Sobic001G374600 Sobic005G042400 Sobic005G042400 Sobic005G226800--Sobic005G042400 Sobic005G226800--Sobic001G495700 Sobic005G226800--Sobic005G174200 Sobic003G211600--Sobic005G226800 Sobic003G211600--Sobic007G066200 Sobic003G211600--Sobic001G374600 Sobic003G211600--Sobic005G174200 Sobic003G211600--Sobic009G062300 Sobic003G211600--Sobic007G032500 Sobic005G173900 Sobic005G173900 Sobic003G211600--Sobic005G173900 Sobic003G211600--Sobic001G495700 Sobic003G211600--Sobic005G033600 Sobic002G015500--Sobic002G097100 Sobic002G015500--Sobic001G495700 Sobic002G015500--Sobic010G133150 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic002G015500--Sobic009G057100 Sobic002G015500--Sobic007G032500 Sobic002G015500--Sobic004G071100 Sobic002G015500--Sobic001G511400 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic002G015500--Sobic005G147500 Sobic002G015500--Sobic009G058300 Sobic010G084800--Sobic010G047300 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic010G084800--Sobic008G109600 Sobic010G084800--Sobic002G161600 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic010G084800--Sobic001G274025 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic010G084800--Sobic006G264800 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic010G084800--Sobic009G021400 Sobic007G205400 Sobic007G205400 Sobic010G084800--Sobic007G205400 Sobic010G060100 Sobic010G060100 Sobic010G084800--Sobic010G060100 Sobic002G409300 Sobic002G409300 Sobic010G084800--Sobic002G409300
Octagon: transcription factors


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