Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G098700.1
Synonym CHIA, Sb05g008530, ATCHIA
Functional annotation glycosyl hydrolase, putative, expressed
UniProt A0A1Z5RHM3
Pfam PF00704
Panther DB PTHR11177 PTHR11177:SF209
NCBI CDD -
KEGG Orthology K01183; chitinase
Gene Ontology GO:0005975; carbohydrate metabolic process GO:0004553hydrolase activity, hydrolyzing O-glycosyl compounds


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G24090 : chitinase A
RAP-DB (Rice) LOC_Os11g47580.1 : glycosyl hydrolase, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a045186 , Zm00025a043065 , Zm00025a043061 , Zm00025a029435
Brachypodium KQJ91845 , KQK09026 , KQJ91843
Barley HORVU2Hr1G043900.1 , HORVU2Hr1G043900.2 , HORVU2Hr1G043900.3 , HORVU5Hr1G081460.2 , HORVU5Hr1G081460.3 , HORVU5Hr1G081460.1 , HORVU5Hr1G081460.4 , HORVU2Hr1G043890.2 , HORVU2Hr1G043890.3 , HORVU2Hr1G043890.6 , HORVU2Hr1G043890.7 , HORVU2Hr1G043890.5 , HORVU2Hr1G006130.1
Wheat TraesCS4B02G143500 , TraesCS6B02G103900 , TraesCS4D02G142000 , TraesCS1B02G064600
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.005G098700


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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20 Sobic.001G274025 - -


Gene co-expression network
sample Sobic005G098700 Sobic005G098700 Sobic002G161600 Sobic002G161600 Sobic005G098700--Sobic002G161600 Sobic006G264800 Sobic006G264800 Sobic005G098700--Sobic006G264800 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic005G098700--Sobic010G031400 Sobic002G172100 Sobic002G172100 Sobic005G098700--Sobic002G172100 Sobic001G261700 Sobic001G261700 Sobic005G098700--Sobic001G261700 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic005G098700--Sobic009G057100 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic005G098700--Sobic005G147500 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic005G098700--Sobic003G294800 Sobic009G058300 Sobic009G058300 Sobic005G098700--Sobic009G058300 Sobic002G161600--Sobic009G058300 Sobic010G047300 Sobic010G047300 Sobic002G161600--Sobic010G047300 Sobic002G015400 Sobic002G015400 Sobic002G161600--Sobic002G015400 Sobic007G032500 Sobic007G032500 Sobic002G161600--Sobic007G032500 Sobic002G108300 Sobic002G108300 Sobic002G161600--Sobic002G108300 Sobic001G511400 Sobic001G511400 Sobic002G161600--Sobic001G511400 Sobic002G161600--Sobic002G172100 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic002G161600--Sobic002G015500 Sobic005G174200 Sobic005G174200 Sobic002G161600--Sobic005G174200 Sobic001G274025 Sobic001G274025 Sobic006G264800--Sobic001G274025 Sobic006G264800--Sobic002G172100 Sobic009G021400 Sobic009G021400 Sobic006G264800--Sobic009G021400 Sobic001G489075 Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic001G489075 Sobic006G264800--Sobic003G294800 Sobic009G112200 Sobic009G112200 Sobic006G264800--Sobic009G112200 Sobic003G106400 Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic003G106400 Sobic006G264800--Sobic009G058300 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic006G264800--Sobic001G284700 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic010G031400--Sobic005G185400 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic010G031400--Sobic005G184500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic010G031400--Sobic006G081400 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic005G033400 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic010G031400--Sobic006G105300 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic004G071100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic010G031400--Sobic010G035000 Sobic002G172100--Sobic003G294800 Sobic002G172100--Sobic006G264800 Sobic002G172200 Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic002G172200 Sobic002G172100--Sobic005G147500 Sobic005G082300 Sobic005G082300 Sobic002G172100--Sobic005G082300 Sobic003G266100 Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic003G266100 Sobic002G172100--Sobic009G058300 Sobic002G172100--Sobic001G284700 Sobic002G172100--Sobic001G274025 Sobic001G261700--Sobic001G284700 Sobic001G261700--Sobic005G147500 Sobic001G261700--Sobic006G264800 Sobic001G261700--Sobic009G057100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic001G261700--Sobic005G188800 Sobic001G261700--Sobic002G172100 Sobic001G261700--Sobic009G112200 Sobic001G261700--Sobic001G511400 Sobic001G261700--Sobic002G172200 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G057100 Sobic005G147500--Sobic005G188800 Sobic005G147500--Sobic001G284700 Sobic005G147500--Sobic006G081400 Sobic005G147500--Sobic002G172100 Sobic005G147500--Sobic003G294800 Sobic005G147500--Sobic009G058300 Sobic005G147500--Sobic002G172200 Sobic005G147500--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G188800 Sobic003G294800--Sobic002G172100 Sobic003G294800--Sobic005G082300 Sobic003G294800--Sobic005G147500 Sobic003G294800--Sobic006G264800 Sobic003G294800--Sobic003G266100 Sobic003G294800--Sobic002G172200 Sobic003G294800--Sobic001G274025 Sobic008G109600 Sobic008G109600 Sobic003G294800--Sobic008G109600 Sobic009G058300--Sobic002G108300 Sobic009G058300--Sobic001G284700 Sobic009G058300--Sobic002G172100 Sobic009G058300--Sobic005G147500 Sobic009G058300--Sobic007G032500 Sobic009G058300--Sobic006G264800 Sobic008G088900 Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic008G088900 Sobic009G058300--Sobic001G511400 Sobic009G058300--Sobic002G015400
Octagon: transcription factors


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