Gene annotation
Transcriptome id Sobic.009G256500.1
Synonym Sb09g030660, ftsh4
Functional annotation OsFtsH5 FtsH protease, homologue of AtFtsH4, expressed
UniProt C5YX11
Pfam PF07728 PF01434
Panther DB PTHR23076 PTHR23076:SF73
NCBI CDD -
KEGG Orthology K08955; ATP-dependent metalloprotease
Gene Ontology GO:0016887; ATPase activity GO:0005524ATP binding GO:0006508proteolysis GO:0004222metalloendopeptidase activity


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT2G26140 : FTSH protease 4
RAP-DB (Rice) LOC_Os01g39260.1 : OsFtsH5 FtsH protease, homologue of AtFtsH4, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a036804
Brachypodium PNT73825 , KQK12219 , KQK04566
Barley HORVU3Hr1G049910.8 , HORVU3Hr1G049910.9 , HORVU3Hr1G049910.4 , HORVU3Hr1G049910.5 , HORVU3Hr1G049910.6 , HORVU3Hr1G049910.7 , HORVU3Hr1G049910.1 , HORVU3Hr1G049910.2 , HORVU3Hr1G049910.3 , HORVU1Hr1G094900.9 , HORVU1Hr1G094900.8 , HORVU1Hr1G094900.3 , HORVU1Hr1G094900.2 , HORVU1Hr1G094900.1 , HORVU1Hr1G094900.7 , HORVU1Hr1G094900.6 , HORVU1Hr1G094900.5 , HORVU1Hr1G094900.4 , HORVU1Hr1G094900.11 , HORVU1Hr1G094900.10 , HORVU1Hr1G094900.12
Wheat TraesCS1D02G450300 , TraesCS5D02G521200 , TraesCS5D02G521200 , TraesCS3A02G205300 , TraesCS3A02G205300 , TraesCS1B02G476600 , TraesCS3D02G210100 , TraesCS3D02G210100 , TraesCS3B02G237400 , TraesCS3B02G237400 , TraesCS4A02G348700 , TraesCS5B02G524400 , TraesCS4A02G424500 , TraesCS1A02G442500
Populus PNT19346 , PNT19345 , PNT19344 , PNT19343


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G031400 early nodulin 93 ENOD93 protein, putative, expressed -
2 Sobic.005G184500 - -
3 Sobic.005G185400 - -
4 Sobic.005G184600 - -
5 Sobic.005G184400 - -
6 Sobic.007G049000 OsFBX382 - F-box domain containing protein, expressed -
7 Sobic.006G105300 expressed protein -
8 Sobic.006G142850 - -
9 Sobic.009G057100 - -
10 Sobic.010G035000 - -
11 Sobic.001G297700 expressed protein -
12 Sobic.005G033400 heavy-metal-associated domain-containing protein, putative, expressed -
13 Sobic.006G081400 - -
14 Sobic.005G186250 - -
15 Sobic.004G029800 expressed protein -
16 Sobic.009G007100 glutelin, putative, expressed -
17 Sobic.004G071100 - -
18 Sobic.003G319050 - -
19 Sobic.005G188800 - -
20 Sobic.005G205800 ATXR, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic009G256500 Sobic009G256500 Sobic010G031400 Sobic010G031400 Sobic009G256500--Sobic010G031400 Sobic005G184500 Sobic005G184500 Sobic009G256500--Sobic005G184500 Sobic005G185400 Sobic005G185400 Sobic009G256500--Sobic005G185400 Sobic005G184600 Sobic005G184600 Sobic009G256500--Sobic005G184600 Sobic005G184400 Sobic005G184400 Sobic009G256500--Sobic005G184400 Sobic007G049000 Sobic007G049000 Sobic009G256500--Sobic007G049000 Sobic006G105300 Sobic006G105300 Sobic009G256500--Sobic006G105300 Sobic006G142850 Sobic006G142850 Sobic009G256500--Sobic006G142850 Sobic009G057100 Sobic009G057100 Sobic009G256500--Sobic009G057100 Sobic010G031400--Sobic005G185400 Sobic010G031400--Sobic005G184500 Sobic001G297700 Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic001G297700 Sobic010G031400--Sobic009G057100 Sobic006G081400 Sobic006G081400 Sobic010G031400--Sobic006G081400 Sobic005G033400 Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic005G033400 Sobic010G031400--Sobic006G105300 Sobic004G071100 Sobic004G071100 Sobic010G031400--Sobic004G071100 Sobic010G035000 Sobic010G035000 Sobic010G031400--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic005G185400 Sobic005G184500--Sobic006G105300 Sobic005G184500--Sobic005G184600 Sobic005G184500--Sobic005G184400 Sobic005G184500--Sobic007G049000 Sobic005G184500--Sobic010G035000 Sobic005G184500--Sobic001G297700 Sobic005G184500--Sobic006G142850 Sobic005G184500--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic005G184500 Sobic005G185400--Sobic006G105300 Sobic005G185400--Sobic006G081400 Sobic005G185400--Sobic001G297700 Sobic005G185400--Sobic005G184600 Sobic005G185400--Sobic005G033400 Sobic005G185400--Sobic005G184400 Sobic005G185400--Sobic010G031400 Sobic005G185400--Sobic010G035000 Sobic005G184600--Sobic005G184400 Sobic005G184600--Sobic007G049000 Sobic005G184600--Sobic006G142850 Sobic005G184600--Sobic006G105300 Sobic005G184600--Sobic005G184500 Sobic005G186250 Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic005G186250 Sobic005G184600--Sobic010G035000 Sobic009G007100 Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic009G007100 Sobic005G184600--Sobic005G185400 Sobic005G184400--Sobic005G184600 Sobic005G184400--Sobic007G049000 Sobic005G184400--Sobic006G142850 Sobic005G184400--Sobic006G105300 Sobic005G184400--Sobic005G184500 Sobic005G184400--Sobic010G035000 Sobic005G184400--Sobic005G186250 Sobic005G184400--Sobic009G007100 Sobic005G184400--Sobic005G185400 Sobic007G049000--Sobic005G184600 Sobic007G049000--Sobic005G184400 Sobic007G049000--Sobic006G142850 Sobic007G049000--Sobic005G186250 Sobic007G049000--Sobic006G105300 Sobic007G049000--Sobic009G007100 Sobic007G049000--Sobic005G184500 Sobic007G049000--Sobic010G035000 Sobic007G049000--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic010G035000 Sobic006G105300--Sobic005G184400 Sobic006G105300--Sobic005G184600 Sobic006G105300--Sobic005G184500 Sobic006G105300--Sobic007G049000 Sobic006G105300--Sobic006G142850 Sobic006G105300--Sobic001G297700 Sobic006G105300--Sobic005G185400 Sobic006G105300--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic007G049000 Sobic006G142850--Sobic005G184600 Sobic006G142850--Sobic005G184400 Sobic006G142850--Sobic005G186250 Sobic006G142850--Sobic006G105300 Sobic006G142850--Sobic009G007100 Sobic006G142850--Sobic010G035000 Sobic004G207500 Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic004G207500 Sobic006G142850--Sobic005G184500 Sobic005G147500 Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic005G147500 Sobic009G057100--Sobic006G081400 Sobic009G057100--Sobic004G071100 Sobic005G188800 Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G188800 Sobic009G057100--Sobic005G033400 Sobic001G284700 Sobic001G284700 Sobic009G057100--Sobic001G284700 Sobic002G015500 Sobic002G015500 Sobic009G057100--Sobic002G015500 Sobic004G029800 Sobic004G029800 Sobic009G057100--Sobic004G029800 Sobic003G294800 Sobic003G294800 Sobic009G057100--Sobic003G294800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.