Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G017600.1
Synonym Sb04g001660
Functional annotation expressed protein
UniProt C5XSZ8
Pfam -
Panther DB PTHR33527 PTHR33527:SF3
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G13620 : -
RAP-DB (Rice) LOC_Os10g10320.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS3D02G487900 , TraesCS3B02G541900 , TraesCS3D02G487700
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.005G158801 - -
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11 Sobic.003G067700 expressed protein -
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14 Sobic.007G018000 expansin precursor, putative, expressed -
15 Sobic.009G131400 basic 7S globulin precursor, putative, expressed -
16 Sobic.010G212000 haemolysin-III, putative, expressed K07297: adiponectin receptor
17 Sobic.006G044301 - -
18 Sobic.004G132800 hypothetical protein -
19 Sobic.003G247800 cold acclimation protein WCOR413, putative, expressed -
20 Sobic.002G328550 - K14411: RNA-binding protein Musashi


Gene co-expression network
sample Sobic004G017600 Sobic004G017600 Sobic005G158801 Sobic005G158801 Sobic004G017600--Sobic005G158801 Sobic005G064200 Sobic005G064200 Sobic004G017600--Sobic005G064200 Sobic006G206500 Sobic006G206500 Sobic004G017600--Sobic006G206500 Sobic003G244900 Sobic003G244900 Sobic004G017600--Sobic003G244900 Sobic005G158700 Sobic005G158700 Sobic004G017600--Sobic005G158700 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic004G017600--Sobic010G037200 Sobic002G308400 Sobic002G308400 Sobic004G017600--Sobic002G308400 Sobic010G198800 Sobic010G198800 Sobic004G017600--Sobic010G198800 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic004G017600--Sobic007G194100 Sobic005G158801--Sobic006G206500 Sobic008G105200 Sobic008G105200 Sobic005G158801--Sobic008G105200 Sobic005G158801--Sobic005G158700 Sobic004G132800 Sobic004G132800 Sobic005G158801--Sobic004G132800 Sobic005G158801--Sobic010G037200 Sobic005G158801--Sobic002G308400 Sobic005G158801--Sobic007G194100 Sobic005G158801--Sobic005G064200 Sobic005G158801--Sobic004G017600 Sobic007G018000 Sobic007G018000 Sobic005G064200--Sobic007G018000 Sobic003G324300 Sobic003G324300 Sobic005G064200--Sobic003G324300 Sobic004G318400 Sobic004G318400 Sobic005G064200--Sobic004G318400 Sobic007G208200 Sobic007G208200 Sobic005G064200--Sobic007G208200 Sobic005G098700 Sobic005G098700 Sobic005G064200--Sobic005G098700 Sobic001G050900 Sobic001G050900 Sobic005G064200--Sobic001G050900 Sobic009G199300 Sobic009G199300 Sobic005G064200--Sobic009G199300 Sobic005G064200--Sobic007G194100 Sobic010G196800 Sobic010G196800 Sobic005G064200--Sobic010G196800 Sobic005G158901 Sobic005G158901 Sobic006G206500--Sobic005G158901 Sobic006G206500--Sobic005G158801 Sobic006G244500 Sobic006G244500 Sobic006G206500--Sobic006G244500 Sobic006G206500--Sobic010G037200 Sobic009G009800 Sobic009G009800 Sobic006G206500--Sobic009G009800 Sobic001G488200 Sobic001G488200 Sobic006G206500--Sobic001G488200 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic006G206500--Sobic009G025100 Sobic006G206500--Sobic007G194100 Sobic007G062700 Sobic007G062700 Sobic006G206500--Sobic007G062700 Sobic002G328550 Sobic002G328550 Sobic003G244900--Sobic002G328550 Sobic004G149466 Sobic004G149466 Sobic003G244900--Sobic004G149466 Sobic003G067700 Sobic003G067700 Sobic003G244900--Sobic003G067700 Sobic003G244900--Sobic005G158700 Sobic006G221700 Sobic006G221700 Sobic003G244900--Sobic006G221700 Sobic003G244900--Sobic004G017600 Sobic001G102150 Sobic001G102150 Sobic003G244900--Sobic001G102150 Sobic002G090100 Sobic002G090100 Sobic003G244900--Sobic002G090100 Sobic005G158700--Sobic005G158801 Sobic005G158700--Sobic004G132800 Sobic001G197300 Sobic001G197300 Sobic005G158700--Sobic001G197300 Sobic005G158700--Sobic003G244900 Sobic010G136400 Sobic010G136400 Sobic005G158700--Sobic010G136400 Sobic006G063400 Sobic006G063400 Sobic005G158700--Sobic006G063400 Sobic007G100032 Sobic007G100032 Sobic005G158700--Sobic007G100032 Sobic007G101900 Sobic007G101900 Sobic005G158700--Sobic007G101900 Sobic005G158700--Sobic006G206500 Sobic010G037200--Sobic009G025100 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic010G037200--Sobic008G039700 Sobic010G227400 Sobic010G227400 Sobic010G037200--Sobic010G227400 Sobic010G085700 Sobic010G085700 Sobic010G037200--Sobic010G085700 Sobic009G040000 Sobic009G040000 Sobic010G037200--Sobic009G040000 Sobic001G068200 Sobic001G068200 Sobic010G037200--Sobic001G068200 Sobic001G253400 Sobic001G253400 Sobic010G037200--Sobic001G253400 Sobic001G158600 Sobic001G158600 Sobic010G037200--Sobic001G158600 Sobic006G051750 Sobic006G051750 Sobic010G037200--Sobic006G051750 Sobic004G067900 Sobic004G067900 Sobic002G308400--Sobic004G067900 Sobic002G308400--Sobic007G194100 Sobic002G308400--Sobic006G244500 Sobic001G106400 Sobic001G106400 Sobic002G308400--Sobic001G106400 Sobic003G295000 Sobic003G295000 Sobic002G308400--Sobic003G295000 Sobic002G240700 Sobic002G240700 Sobic002G308400--Sobic002G240700 Sobic002G308400--Sobic010G037200 Sobic001G442200 Sobic001G442200 Sobic002G308400--Sobic001G442200 Sobic006G066600 Sobic006G066600 Sobic002G308400--Sobic006G066600 Sobic010G198800--Sobic007G194100 Sobic010G198800--Sobic004G067900 Sobic010G198800--Sobic002G308400 Sobic010G198800--Sobic002G240700 Sobic009G170800 Sobic009G170800 Sobic010G198800--Sobic009G170800 Sobic010G198800--Sobic007G208200 Sobic010G198800--Sobic009G199300 Sobic010G198800--Sobic003G295000 Sobic006G096300 Sobic006G096300 Sobic010G198800--Sobic006G096300 Sobic007G194100--Sobic002G240700 Sobic007G194100--Sobic010G037200 Sobic007G194100--Sobic009G199300 Sobic007G194100--Sobic002G308400 Sobic007G194100--Sobic005G098700 Sobic007G194100--Sobic009G025100 Sobic007G194100--Sobic004G067900 Sobic007G194100--Sobic007G208200 Sobic007G194100--Sobic001G442200
Octagon: transcription factors


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