Gene annotation
Transcriptome id Sobic.007G018000.1
Synonym EXP25, EXPA25, Sb07g001540, ATEXP25, ATHEXPALPHA1.18, ATEXPA25
Functional annotation expansin precursor, putative, expressed
UniProt C5YM21
Pfam PF03330 PF01357
Panther DB PTHR31867 PTHR31867:SF10
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G39300 : expansin A25
RAP-DB (Rice) LOC_Os03g21820.1 : expansin precursor, putative, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a052244
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS7D02G314100
Populus -


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cDNA sequences
Sobic.007G018000


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
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13 Sobic.006G064700 expressed protein -
14 Sobic.005G153400 - -
15 Sobic.009G039100 myb-like DNA-binding domain, SHAQKYF class family protein, expressed -
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Gene co-expression network
sample Sobic007G018000 Sobic007G018000 Sobic005G064200 Sobic005G064200 Sobic007G018000--Sobic005G064200 Sobic007G182500 Sobic007G182500 Sobic007G018000--Sobic007G182500 Sobic004G274500 Sobic004G274500 Sobic007G018000--Sobic004G274500 Sobic003G438300 Sobic003G438300 Sobic007G018000--Sobic003G438300 Sobic007G109400 Sobic007G109400 Sobic007G018000--Sobic007G109400 Sobic002G061200 Sobic002G061200 Sobic007G018000--Sobic002G061200 Sobic010G195600 Sobic010G195600 Sobic007G018000--Sobic010G195600 Sobic009G039500 Sobic009G039500 Sobic007G018000--Sobic009G039500 Sobic005G109800 Sobic005G109800 Sobic007G018000--Sobic005G109800 Sobic005G064200--Sobic007G018000 Sobic003G324300 Sobic003G324300 Sobic005G064200--Sobic003G324300 Sobic004G318400 Sobic004G318400 Sobic005G064200--Sobic004G318400 Sobic007G208200 Sobic007G208200 Sobic005G064200--Sobic007G208200 Sobic005G098700 Sobic005G098700 Sobic005G064200--Sobic005G098700 Sobic001G050900 Sobic001G050900 Sobic005G064200--Sobic001G050900 Sobic009G199300 Sobic009G199300 Sobic005G064200--Sobic009G199300 Sobic007G194100 Sobic007G194100 Sobic005G064200--Sobic007G194100 Sobic010G196800 Sobic010G196800 Sobic005G064200--Sobic010G196800 Sobic001G170500 Sobic001G170500 Sobic007G182500--Sobic001G170500 Sobic007G182500--Sobic007G018000 Sobic009G025100 Sobic009G025100 Sobic007G182500--Sobic009G025100 Sobic007G182500--Sobic004G274500 Sobic004G250600 Sobic004G250600 Sobic007G182500--Sobic004G250600 Sobic003G304500 Sobic003G304500 Sobic007G182500--Sobic003G304500 Sobic007G182500--Sobic007G208200 Sobic004G254400 Sobic004G254400 Sobic007G182500--Sobic004G254400 Sobic001G368900 Sobic001G368900 Sobic007G182500--Sobic001G368900 Sobic010G037200 Sobic010G037200 Sobic004G274500--Sobic010G037200 Sobic004G274500--Sobic009G025100 Sobic001G394900 Sobic001G394900 Sobic004G274500--Sobic001G394900 Sobic003G402100 Sobic003G402100 Sobic004G274500--Sobic003G402100 Sobic004G274500--Sobic001G170500 Sobic004G274500--Sobic003G304500 Sobic008G039700 Sobic008G039700 Sobic004G274500--Sobic008G039700 Sobic003G303500 Sobic003G303500 Sobic004G274500--Sobic003G303500 Sobic008G037100 Sobic008G037100 Sobic004G274500--Sobic008G037100 Sobic003G438300--Sobic007G109400 Sobic003G438300--Sobic002G061200 Sobic003G438300--Sobic010G195600 Sobic003G438300--Sobic009G039500 Sobic005G051700 Sobic005G051700 Sobic003G438300--Sobic005G051700 Sobic005G153400 Sobic005G153400 Sobic003G438300--Sobic005G153400 Sobic009G040100 Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic009G040100 Sobic003G438300--Sobic005G109800 Sobic009G039900 Sobic009G039900 Sobic003G438300--Sobic009G039900 Sobic007G109400--Sobic002G061200 Sobic007G109400--Sobic009G039500 Sobic007G109400--Sobic003G438300 Sobic007G109400--Sobic005G109800 Sobic007G109400--Sobic010G195600 Sobic005G109900 Sobic005G109900 Sobic007G109400--Sobic005G109900 Sobic005G174700 Sobic005G174700 Sobic007G109400--Sobic005G174700 Sobic005G174600 Sobic005G174600 Sobic007G109400--Sobic005G174600 Sobic007G109400--Sobic005G051700 Sobic002G061200--Sobic007G109400 Sobic002G061200--Sobic009G039500 Sobic002G061200--Sobic005G109800 Sobic002G061200--Sobic003G438300 Sobic002G061200--Sobic005G109900 Sobic002G061200--Sobic005G174700 Sobic002G061200--Sobic005G174600 Sobic002G061200--Sobic010G195600 Sobic009G039700 Sobic009G039700 Sobic002G061200--Sobic009G039700 Sobic010G195600--Sobic005G051700 Sobic010G195600--Sobic005G153400 Sobic005G116000 Sobic005G116000 Sobic010G195600--Sobic005G116000 Sobic001G328900 Sobic001G328900 Sobic010G195600--Sobic001G328900 Sobic009G039100 Sobic009G039100 Sobic010G195600--Sobic009G039100 Sobic010G195600--Sobic003G438300 Sobic010G195600--Sobic009G039900 Sobic006G064700 Sobic006G064700 Sobic010G195600--Sobic006G064700 Sobic002G345400 Sobic002G345400 Sobic010G195600--Sobic002G345400 Sobic009G039500--Sobic002G061200 Sobic009G039500--Sobic005G109800 Sobic009G039500--Sobic007G109400 Sobic009G039500--Sobic005G109900 Sobic009G039500--Sobic005G174700 Sobic009G039500--Sobic005G174600 Sobic009G039500--Sobic003G438300 Sobic009G039500--Sobic009G039700 Sobic005G221200 Sobic005G221200 Sobic009G039500--Sobic005G221200 Sobic005G109800--Sobic009G039500 Sobic005G109800--Sobic005G109900 Sobic005G109800--Sobic002G061200 Sobic005G109800--Sobic007G109400 Sobic005G109800--Sobic005G174600 Sobic009G006800 Sobic009G006800 Sobic005G109800--Sobic009G006800 Sobic003G415800 Sobic003G415800 Sobic005G109800--Sobic003G415800 Sobic005G141500 Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G141500 Sobic005G109800--Sobic005G221200
Octagon: transcription factors


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