Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G252700.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RP06
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.004G235900 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
2 Sobic.008G148700 B3 DNA binding domain containing protein, expressed -
3 Sobic.005G026300 transferase family protein, putative, expressed -
4 Sobic.003G087600 MYB family transcription factor, putative, expressed K09422: transcription factor MYB, plant
5 Sobic.002G057550 - -
6 Sobic.002G266100 - -
7 Sobic.003G248700 saccharopine dehydrogenase, putative, expressed -
8 Sobic.006G178200 GDSL-like lipase/acylhydrolase, putative, expressed -
9 Sobic.003G111900 laccase precursor protein, putative, expressed K05909: laccase
10 Sobic.007G120100 ABC transporter, ATP-binding protein, putative, expressed -
11 Sobic.007G006350 - -
12 Sobic.002G035766 - -
13 Sobic.004G019900 GTP-binding protein, putative, expressed -
14 Sobic.005G082950 - -
15 Sobic.009G150100 expressed protein -
16 Sobic.004G023733 - -
17 Sobic.001G528000 SNARE domain containing protein, putative, expressed K08503: syntaxin of plants SYP5
18 Sobic.007G100275 - -
19 Sobic.K042700 OsMADS70 - MADS-box family gene with M-alpha type-box, expressed -
20 Sobic.003G091100 seven in absentia protein family domain containing protein, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G252700 Sobic004G252700 Sobic004G235900 Sobic004G235900 Sobic004G252700--Sobic004G235900 Sobic008G148700 Sobic008G148700 Sobic004G252700--Sobic008G148700 Sobic005G026300 Sobic005G026300 Sobic004G252700--Sobic005G026300 Sobic003G087600 Sobic003G087600 Sobic004G252700--Sobic003G087600 Sobic002G057550 Sobic002G057550 Sobic004G252700--Sobic002G057550 Sobic002G266100 Sobic002G266100 Sobic004G252700--Sobic002G266100 Sobic003G248700 Sobic003G248700 Sobic004G252700--Sobic003G248700 Sobic006G178200 Sobic006G178200 Sobic004G252700--Sobic006G178200 Sobic003G111900 Sobic003G111900 Sobic004G252700--Sobic003G111900 Sobic004G235900--Sobic005G026300 Sobic004G235900--Sobic002G057550 Sobic004G023733 Sobic004G023733 Sobic004G235900--Sobic004G023733 Sobic002G069601 Sobic002G069601 Sobic004G235900--Sobic002G069601 Sobic002G035766 Sobic002G035766 Sobic004G235900--Sobic002G035766 Sobic006G236100 Sobic006G236100 Sobic004G235900--Sobic006G236100 Sobic005G082950 Sobic005G082950 Sobic004G235900--Sobic005G082950 Sobic004G235900--Sobic008G148700 Sobic003G141550 Sobic003G141550 Sobic004G235900--Sobic003G141550 Sobic008G148700--Sobic002G057550 Sobic001G272300 Sobic001G272300 Sobic008G148700--Sobic001G272300 Sobic005G026300--Sobic004G235900 Sobic005G156800 Sobic005G156800 Sobic005G026300--Sobic005G156800 Sobic002G380750 Sobic002G380750 Sobic005G026300--Sobic002G380750 Sobic010G021600 Sobic010G021600 Sobic005G026300--Sobic010G021600 Sobic005G026300--Sobic002G057550 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic005G026300--Sobic001G452400 Sobic005G026300--Sobic008G148700 Sobic003G162200 Sobic003G162200 Sobic005G026300--Sobic003G162200 Sobic007G139950 Sobic007G139950 Sobic005G026300--Sobic007G139950 Sobic001G528000 Sobic001G528000 Sobic003G087600--Sobic001G528000 Sobic007G069750 Sobic007G069750 Sobic003G087600--Sobic007G069750 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic003G087600--Sobic005G199500 Sobic002G213050 Sobic002G213050 Sobic003G087600--Sobic002G213050 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic003G087600--Sobic006G018500 Sobic001G267950 Sobic001G267950 Sobic003G087600--Sobic001G267950 Sobic006G261000 Sobic006G261000 Sobic003G087600--Sobic006G261000 Sobic010G129900 Sobic010G129900 Sobic003G087600--Sobic010G129900 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic003G087600--Sobic004G055400 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic002G057550--Sobic003G291050 Sobic002G302400 Sobic002G302400 Sobic002G057550--Sobic002G302400 Sobic002G057550--Sobic001G272300 Sobic004G169800 Sobic004G169800 Sobic002G266100--Sobic004G169800 Sobic002G266100--Sobic008G148700 Sobic002G143600 Sobic002G143600 Sobic002G266100--Sobic002G143600 Sobic002G266100--Sobic002G035766 Sobic003G286650 Sobic003G286650 Sobic002G266100--Sobic003G286650 Sobic009G178000 Sobic009G178000 Sobic002G266100--Sobic009G178000 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic002G266100--Sobic004G026900 Sobic002G266100--Sobic002G069601 Sobic010G206100 Sobic010G206100 Sobic002G266100--Sobic010G206100 Sobic002G348200 Sobic002G348200 Sobic003G248700--Sobic002G348200 Sobic005G108501 Sobic005G108501 Sobic003G248700--Sobic005G108501 Sobic001G220066 Sobic001G220066 Sobic003G248700--Sobic001G220066 Sobic002G157350 Sobic002G157350 Sobic003G248700--Sobic002G157350 Sobic001G318366 Sobic001G318366 Sobic003G248700--Sobic001G318366 Sobic003G248700--Sobic002G035766 Sobic003G248700--Sobic004G023733 Sobic003G429101 Sobic003G429101 Sobic003G248700--Sobic003G429101 SobicK042700 SobicK042700 Sobic003G248700--SobicK042700 Sobic006G178200--Sobic005G082950 Sobic004G019900 Sobic004G019900 Sobic006G178200--Sobic004G019900 Sobic006G178200--Sobic002G302400 Sobic006G178200--Sobic001G272300 Sobic010G248900 Sobic010G248900 Sobic003G111900--Sobic010G248900 Sobic006G189900 Sobic006G189900 Sobic003G111900--Sobic006G189900 Sobic004G255000 Sobic004G255000 Sobic003G111900--Sobic004G255000 Sobic003G072801 Sobic003G072801 Sobic003G111900--Sobic003G072801 Sobic006G174400 Sobic006G174400 Sobic003G111900--Sobic006G174400 Sobic001G254200 Sobic001G254200 Sobic003G111900--Sobic001G254200 Sobic008G024400 Sobic008G024400 Sobic003G111900--Sobic008G024400 Sobic003G111900--Sobic004G252700 Sobic007G071800 Sobic007G071800 Sobic003G111900--Sobic007G071800
Octagon: transcription factors


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