Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G340500.1
Synonym AtPP2-B12, PP2-B12, Sb04g036800
Functional annotation SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence. (PubMedID : 27586543)
OsFBX65 - F-box domain containing protein, expressed
UniProt C5XV90
Pfam PF14299
Panther DB PTHR32278 PTHR32278:SF5
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G24560 : phloem protein 2-B12
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g56750.1 : OsFBX65 - F-box domain containing protein, expressed
MaizeGDB (Corn) Zm00025a022558 , Zm00025a032823
Brachypodium -
Barley -
Wheat TraesCS6B02G421100 , TraesCS6D02G366600 , TraesCS6A02G381900
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G076900 MTD1, putative, expressed -
2 Sobic.005G036300 expressed protein -
3 Sobic.010G078200 SAG (Senescence-associated gene): up-regulated gene during dark-induced senescence.(PubMedID : 27586543)@expressed protein -
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5 Sobic.003G421800 Ser/Thr protein phosphatase family protein, putative, expressed -
6 Sobic.009G229900 ATROPGEF7/ROPGEF7, putative, expressed -
7 Sobic.006G082200 CorA-like magnesium transporter protein, putative, expressed K16075: MRS2, magnesium transporter
8 Sobic.005G083160 - -
9 Sobic.005G003750 - -
10 Sobic.005G226150 - -
11 Sobic.010G107300 - -
12 Sobic.009G218100 transcription initiation factor IIB, putative, expressed K03124: TFIIB, GTF2B, SUA7, transcription initiation factor TFIIB
13 Sobic.005G003001 - -
14 Sobic.009G227000 expressed protein -
15 Sobic.007G108000 - -
16 Sobic.010G022600 encodes granule-bound ADP-glucose-gluosyl transferase(PubMedID : 20585750)@-(PubMedID : 9866201)@starch synthase, putative, expressed K13679: granule-bound starch synthase
17 Sobic.002G360900 GASR9 - Gibberellin-regulated GASA/GAST/Snakin family protein precursor, expressed -
18 Sobic.008G088881 - -
19 Sobic.009G071600 no apical meristem protein, putative, expressed -
20 Sobic.001G277800 transferase family protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
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Octagon: transcription factors


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