Gene annotation
Transcriptome id Sobic.004G349237.1
Synonym -
Functional annotation -
UniProt C5XW01
Pfam PF13912
Panther DB PTHR26374 PTHR26374:SF201
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR AT5G43540 : C2H2 and C2HC zinc fingers superfamily protein
RAP-DB (Rice) LOC_Os02g57550.1 : ZOS2-18 - C2H2 zinc finger protein, expressed
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium KQK01423
Barley HORVU2Hr1G064890.1 , HORVU2Hr1G064890.2
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.002G361600 ZOS7-10 - C2H2 zinc finger protein, expressed -
2 Sobic.003G265150 - -
3 Sobic.002G421501 - -
4 Sobic.006G130700 expressed protein K14638: SLC15A3_4, solute carrier family 15 (peptide/histidine transporter), member 3/4
5 Sobic.001G097800 - -
6 Sobic.001G284450 - -
7 Sobic.008G014601 - -
8 Sobic.009G240100 receptor-like protein kinase homolog RK20-1, putative, expressed -
9 Sobic.002G372900 - -
10 Sobic.001G404950 - -
11 Sobic.010G192700 polyphenol oxidase, putative, expressed K00422: polyphenol oxidase
12 Sobic.003G380700 expressed protein -
13 Sobic.006G138966 - -
14 Sobic.002G247700 expressed protein -
15 Sobic.008G167900 - -
16 Sobic.003G288700 expressed protein -
17 Sobic.009G025950 - -
18 Sobic.004G194950 - -
19 Sobic.002G248800 expressed protein -
20 Sobic.007G176300 STIGL3 - Stigma-specific Stig1 family protein precursor, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic004G349237 Sobic004G349237 Sobic002G361600 Sobic002G361600 Sobic004G349237--Sobic002G361600 Sobic003G265150 Sobic003G265150 Sobic004G349237--Sobic003G265150 Sobic002G421501 Sobic002G421501 Sobic004G349237--Sobic002G421501 Sobic006G130700 Sobic006G130700 Sobic004G349237--Sobic006G130700 Sobic001G097800 Sobic001G097800 Sobic004G349237--Sobic001G097800 Sobic001G284450 Sobic001G284450 Sobic004G349237--Sobic001G284450 Sobic008G014601 Sobic008G014601 Sobic004G349237--Sobic008G014601 Sobic009G240100 Sobic009G240100 Sobic004G349237--Sobic009G240100 Sobic002G372900 Sobic002G372900 Sobic004G349237--Sobic002G372900 Sobic002G361600--Sobic004G349237 Sobic002G361600--Sobic003G265150 Sobic002G361600--Sobic002G421501 Sobic003G414900 Sobic003G414900 Sobic002G361600--Sobic003G414900 Sobic002G361600--Sobic001G097800 Sobic004G034100 Sobic004G034100 Sobic002G361600--Sobic004G034100 Sobic002G311300 Sobic002G311300 Sobic002G361600--Sobic002G311300 Sobic002G242100 Sobic002G242100 Sobic002G361600--Sobic002G242100 Sobic002G361600--Sobic006G130700 Sobic003G265150--Sobic004G349237 Sobic003G265150--Sobic002G361600 Sobic003G265150--Sobic003G414900 Sobic006G138966 Sobic006G138966 Sobic003G265150--Sobic006G138966 Sobic003G265150--Sobic002G421501 Sobic001G512633 Sobic001G512633 Sobic003G265150--Sobic001G512633 Sobic003G265150--Sobic002G372900 Sobic002G185400 Sobic002G185400 Sobic003G265150--Sobic002G185400 Sobic003G265150--Sobic004G034100 Sobic002G421501--Sobic004G349237 Sobic002G421501--Sobic003G265150 Sobic002G421501--Sobic002G372900 Sobic002G421501--Sobic002G361600 Sobic002G421501--Sobic008G014601 Sobic010G188700 Sobic010G188700 Sobic002G421501--Sobic010G188700 Sobic003G380700 Sobic003G380700 Sobic002G421501--Sobic003G380700 Sobic007G047200 Sobic007G047200 Sobic002G421501--Sobic007G047200 Sobic002G247700 Sobic002G247700 Sobic002G421501--Sobic002G247700 Sobic009G025950 Sobic009G025950 Sobic006G130700--Sobic009G025950 Sobic006G130700--Sobic009G240100 Sobic002G223550 Sobic002G223550 Sobic006G130700--Sobic002G223550 Sobic006G130700--Sobic003G380700 Sobic003G146450 Sobic003G146450 Sobic006G130700--Sobic003G146450 Sobic002G342901 Sobic002G342901 Sobic006G130700--Sobic002G342901 Sobic007G176300 Sobic007G176300 Sobic006G130700--Sobic007G176300 Sobic006G130700--Sobic008G014601 Sobic007G227401 Sobic007G227401 Sobic006G130700--Sobic007G227401 Sobic009G229500 Sobic009G229500 Sobic001G097800--Sobic009G229500 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic001G097800--Sobic003G365450 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G097800--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic001G097800--Sobic004G143550 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G097800--Sobic004G023800 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic001G097800--Sobic010G149000 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G097800--Sobic004G207733 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic001G097800--Sobic003G396050 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic001G097800--Sobic001G440401 Sobic004G194950 Sobic004G194950 Sobic001G284450--Sobic004G194950 Sobic002G232100 Sobic002G232100 Sobic001G284450--Sobic002G232100 Sobic003G350850 Sobic003G350850 Sobic001G284450--Sobic003G350850 Sobic010G157600 Sobic010G157600 Sobic001G284450--Sobic010G157600 Sobic005G073101 Sobic005G073101 Sobic001G284450--Sobic005G073101 Sobic002G143600 Sobic002G143600 Sobic001G284450--Sobic002G143600 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic001G284450--Sobic009G184450 Sobic002G243100 Sobic002G243100 Sobic001G284450--Sobic002G243100 Sobic001G284450--Sobic004G349237 Sobic008G014601--Sobic006G130700 Sobic008G014601--Sobic003G380700 Sobic008G014601--Sobic009G025950 Sobic008G014601--Sobic007G176300 Sobic008G014601--Sobic009G240100 Sobic008G014601--Sobic003G146450 Sobic008G014601--Sobic002G247700 Sobic008G014601--Sobic002G342901 Sobic005G227900 Sobic005G227900 Sobic008G014601--Sobic005G227900 Sobic009G240100--Sobic006G130700 Sobic009G240100--Sobic007G047200 Sobic002G174600 Sobic002G174600 Sobic009G240100--Sobic002G174600 Sobic009G240100--Sobic007G176300 Sobic003G059600 Sobic003G059600 Sobic009G240100--Sobic003G059600 Sobic010G043350 Sobic010G043350 Sobic009G240100--Sobic010G043350 Sobic006G252532 Sobic006G252532 Sobic009G240100--Sobic006G252532 Sobic009G240100--Sobic008G014601 Sobic007G191400 Sobic007G191400 Sobic009G240100--Sobic007G191400 Sobic002G372900--Sobic006G138966 Sobic009G066850 Sobic009G066850 Sobic002G372900--Sobic009G066850 Sobic001G192750 Sobic001G192750 Sobic002G372900--Sobic001G192750 Sobic001G084200 Sobic001G084200 Sobic002G372900--Sobic001G084200 Sobic009G168700 Sobic009G168700 Sobic002G372900--Sobic009G168700 Sobic002G057550 Sobic002G057550 Sobic002G372900--Sobic002G057550 Sobic003G291050 Sobic003G291050 Sobic002G372900--Sobic003G291050 Sobic002G372900--Sobic003G380700 Sobic001G443850 Sobic001G443850 Sobic002G372900--Sobic001G443850
Octagon: transcription factors


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