Gene annotation
Transcriptome id Sobic.001G097800.1
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5S5K6
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


JBrowse

Open New Page


Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


Find similar expressed genes
Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.009G229500 expressed protein -
2 Sobic.003G365450 - -
3 Sobic.003G024450 - -
4 Sobic.004G143550 - -
5 Sobic.004G023800 verticillium wilt disease resistance protein, putative, expressed -
6 Sobic.010G149000 - -
7 Sobic.004G207733 - -
8 Sobic.003G396050 - -
9 Sobic.001G440401 - -
10 Sobic.001G045900 polygalacturonase, putative, expressed -
11 Sobic.010G225175 - -
12 Sobic.006G037800 - -
13 Sobic.004G092950 - -
14 Sobic.003G388201 - -
15 Sobic.001G202800 - -
16 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
17 Sobic.001G087850 - -
18 Sobic.003G288700 expressed protein -
19 Sobic.006G065000 - -
20 Sobic.004G194600 - -


Gene co-expression network
sample Sobic001G097800 Sobic001G097800 Sobic009G229500 Sobic009G229500 Sobic001G097800--Sobic009G229500 Sobic003G365450 Sobic003G365450 Sobic001G097800--Sobic003G365450 Sobic003G024450 Sobic003G024450 Sobic001G097800--Sobic003G024450 Sobic004G143550 Sobic004G143550 Sobic001G097800--Sobic004G143550 Sobic004G023800 Sobic004G023800 Sobic001G097800--Sobic004G023800 Sobic010G149000 Sobic010G149000 Sobic001G097800--Sobic010G149000 Sobic004G207733 Sobic004G207733 Sobic001G097800--Sobic004G207733 Sobic003G396050 Sobic003G396050 Sobic001G097800--Sobic003G396050 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic001G097800--Sobic001G440401 Sobic001G045900 Sobic001G045900 Sobic009G229500--Sobic001G045900 Sobic001G045100 Sobic001G045100 Sobic009G229500--Sobic001G045100 Sobic010G225175 Sobic010G225175 Sobic009G229500--Sobic010G225175 Sobic009G229500--Sobic004G207733 Sobic004G194600 Sobic004G194600 Sobic009G229500--Sobic004G194600 Sobic009G229500--Sobic004G143550 Sobic007G127200 Sobic007G127200 Sobic009G229500--Sobic007G127200 Sobic010G052100 Sobic010G052100 Sobic009G229500--Sobic010G052100 Sobic004G127733 Sobic004G127733 Sobic009G229500--Sobic004G127733 Sobic002G025900 Sobic002G025900 Sobic003G365450--Sobic002G025900 Sobic003G365450--Sobic003G024450 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic003G365450--Sobic003G361150 Sobic004G092950 Sobic004G092950 Sobic003G365450--Sobic004G092950 Sobic003G365450--Sobic004G194600 Sobic003G365450--Sobic004G143550 Sobic002G289300 Sobic002G289300 Sobic003G365450--Sobic002G289300 Sobic006G064900 Sobic006G064900 Sobic003G365450--Sobic006G064900 Sobic003G365450--Sobic010G225175 Sobic003G024450--Sobic004G143550 Sobic003G024450--Sobic004G023800 Sobic003G024450--Sobic010G149000 Sobic003G024450--Sobic004G092950 Sobic003G388201 Sobic003G388201 Sobic003G024450--Sobic003G388201 Sobic001G202800 Sobic001G202800 Sobic003G024450--Sobic001G202800 Sobic002G117800 Sobic002G117800 Sobic003G024450--Sobic002G117800 Sobic003G024450--Sobic003G365450 Sobic008G060800 Sobic008G060800 Sobic003G024450--Sobic008G060800 Sobic004G143550--Sobic003G024450 Sobic004G143550--Sobic004G023800 Sobic004G143550--Sobic003G388201 Sobic004G143550--Sobic010G149000 Sobic004G143550--Sobic004G194600 Sobic004G143550--Sobic004G207733 Sobic004G143550--Sobic001G045900 Sobic002G147550 Sobic002G147550 Sobic004G143550--Sobic002G147550 Sobic004G143550--Sobic010G225175 Sobic004G023800--Sobic003G024450 Sobic004G023800--Sobic004G143550 Sobic003G288700 Sobic003G288700 Sobic004G023800--Sobic003G288700 Sobic006G065000 Sobic006G065000 Sobic004G023800--Sobic006G065000 Sobic008G053800 Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic008G053800 Sobic004G023800--Sobic001G440401 Sobic004G023800--Sobic004G092950 Sobic009G184450 Sobic009G184450 Sobic004G023800--Sobic009G184450 Sobic004G023800--Sobic010G149000 Sobic006G037800 Sobic006G037800 Sobic010G149000--Sobic006G037800 Sobic007G134700 Sobic007G134700 Sobic010G149000--Sobic007G134700 Sobic002G154450 Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic002G154450 Sobic010G149000--Sobic010G052100 Sobic010G149000--Sobic003G024450 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic010G149000--Sobic008G056000 Sobic010G149000--Sobic010G225175 Sobic010G149000--Sobic001G202800 Sobic010G149000--Sobic004G143550 Sobic001G087850 Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G087850 Sobic004G207733--Sobic001G045900 Sobic006G176900 Sobic006G176900 Sobic004G207733--Sobic006G176900 Sobic004G207733--Sobic004G127733 Sobic010G123650 Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic010G123650 Sobic004G207733--Sobic002G147550 Sobic003G112100 Sobic003G112100 Sobic004G207733--Sobic003G112100 Sobic004G207733--Sobic002G154450 Sobic001G436450 Sobic001G436450 Sobic004G207733--Sobic001G436450 Sobic003G123950 Sobic003G123950 Sobic003G396050--Sobic003G123950 Sobic010G053700 Sobic010G053700 Sobic003G396050--Sobic010G053700 Sobic006G033601 Sobic006G033601 Sobic003G396050--Sobic006G033601 Sobic008G156800 Sobic008G156800 Sobic003G396050--Sobic008G156800 Sobic002G170000 Sobic002G170000 Sobic003G396050--Sobic002G170000 Sobic001G062066 Sobic001G062066 Sobic003G396050--Sobic001G062066 Sobic003G396050--Sobic004G143550 Sobic008G116800 Sobic008G116800 Sobic003G396050--Sobic008G116800 Sobic003G396050--Sobic003G112100 Sobic001G440401--Sobic003G288700 Sobic001G440401--Sobic008G056000 Sobic008G167900 Sobic008G167900 Sobic001G440401--Sobic008G167900 Sobic002G168750 Sobic002G168750 Sobic001G440401--Sobic002G168750 Sobic001G440401--Sobic010G149000 Sobic001G440401--Sobic002G025900 Sobic001G440401--Sobic004G092950 Sobic001G440401--Sobic007G134700 Sobic001G440401--Sobic004G023800
Octagon: transcription factors


© 2015- RIKEN, All rights reserved.