Gene annotation
Transcriptome id Sobic.002G248800.1
Synonym Sb02g028480
Functional annotation expressed protein
UniProt C5X3Y4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) LOC_Os09g31462.1 : expressed protein
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.001G449300 LYK, putative, expressed -
2 Sobic.010G025600 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
3 Sobic.010G174000 1-aminocyclopropane-1-carboxylate oxidase protein, putative, expressed K05933: aminocyclopropanecarboxylate oxidase
4 Sobic.002G075300 receptor kinase, putative, expressed -
5 Sobic.002G163500 expressed protein -
6 Sobic.002G074700 receptor kinase, putative, expressed -
7 Sobic.003G012750 - -
8 Sobic.005G150700 resistance protein, putative, expressed -
9 Sobic.008G053500 bile acid sodium symporter family protein, putative, expressed K03453: bile acid:Na+ symporter, BASS family
10 Sobic.004G140900 - -
11 Sobic.001G144100 expressed protein -
12 Sobic.002G163400 - -
13 Sobic.005G141900 - -
14 Sobic.003G301050 - -
15 Sobic.006G199601 - -
16 Sobic.001G440401 - -
17 Sobic.002G025900 expressed protein -
18 Sobic.008G056000 nifU, putative, expressed -
19 Sobic.002G365200 - -
20 Sobic.001G288500 expressed protein K10756: replication factor C subunit 3/5


Gene co-expression network
sample Sobic002G248800 Sobic002G248800 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic002G248800--Sobic001G449300 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic002G248800--Sobic010G025600 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic002G248800--Sobic010G174000 Sobic002G075300 Sobic002G075300 Sobic002G248800--Sobic002G075300 Sobic002G163500 Sobic002G163500 Sobic002G248800--Sobic002G163500 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic002G248800--Sobic002G074700 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic002G248800--Sobic003G012750 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic002G248800--Sobic005G150700 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic002G248800--Sobic008G053500 Sobic001G449300--Sobic002G074700 Sobic003G172000 Sobic003G172000 Sobic001G449300--Sobic003G172000 SobicK043600 SobicK043600 Sobic001G449300--SobicK043600 Sobic002G121050 Sobic002G121050 Sobic001G449300--Sobic002G121050 Sobic002G149600 Sobic002G149600 Sobic001G449300--Sobic002G149600 Sobic001G154450 Sobic001G154450 Sobic001G449300--Sobic001G154450 Sobic004G127350 Sobic004G127350 Sobic001G449300--Sobic004G127350 Sobic006G094900 Sobic006G094900 Sobic001G449300--Sobic006G094900 Sobic004G272950 Sobic004G272950 Sobic001G449300--Sobic004G272950 Sobic010G025600--Sobic003G012750 Sobic005G110517 Sobic005G110517 Sobic010G025600--Sobic005G110517 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic010G025600--Sobic003G229650 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic010G025600--Sobic006G199601 Sobic010G025600--Sobic008G053500 Sobic004G140900 Sobic004G140900 Sobic010G025600--Sobic004G140900 Sobic010G025600--Sobic005G150700 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic010G025600--Sobic001G325500 Sobic001G144100 Sobic001G144100 Sobic010G025600--Sobic001G144100 Sobic008G056000 Sobic008G056000 Sobic010G174000--Sobic008G056000 Sobic002G163400 Sobic002G163400 Sobic010G174000--Sobic002G163400 Sobic003G251000 Sobic003G251000 Sobic010G174000--Sobic003G251000 Sobic009G030501 Sobic009G030501 Sobic010G174000--Sobic009G030501 Sobic006G149900 Sobic006G149900 Sobic010G174000--Sobic006G149900 Sobic004G072600 Sobic004G072600 Sobic010G174000--Sobic004G072600 Sobic001G440401 Sobic001G440401 Sobic010G174000--Sobic001G440401 Sobic010G011100 Sobic010G011100 Sobic010G174000--Sobic010G011100 Sobic006G223601 Sobic006G223601 Sobic010G174000--Sobic006G223601 Sobic002G018200 Sobic002G018200 Sobic002G075300--Sobic002G018200 Sobic003G263450 Sobic003G263450 Sobic002G075300--Sobic003G263450 Sobic007G079901 Sobic007G079901 Sobic002G075300--Sobic007G079901 Sobic002G075300--Sobic002G074700 Sobic002G075300--Sobic002G149600 Sobic002G075300--Sobic008G053500 Sobic004G334501 Sobic004G334501 Sobic002G075300--Sobic004G334501 Sobic004G159866 Sobic004G159866 Sobic002G075300--Sobic004G159866 Sobic002G365200 Sobic002G365200 Sobic002G075300--Sobic002G365200 Sobic002G163500--Sobic002G163400 Sobic004G305733 Sobic004G305733 Sobic002G163500--Sobic004G305733 Sobic002G163500--Sobic004G072600 Sobic002G163500--Sobic010G174000 Sobic002G008400 Sobic002G008400 Sobic002G163500--Sobic002G008400 Sobic002G163500--Sobic002G074700 Sobic002G163500--Sobic003G263450 Sobic002G163500--Sobic002G149600 Sobic001G032850 Sobic001G032850 Sobic002G163500--Sobic001G032850 Sobic002G074700--Sobic002G149600 Sobic002G074700--Sobic002G121050 Sobic002G074700--Sobic003G172000 Sobic002G074700--Sobic003G263450 Sobic002G074700--Sobic001G154450 Sobic002G074700--Sobic004G072600 Sobic002G074700--Sobic002G163400 Sobic009G094100 Sobic009G094100 Sobic002G074700--Sobic009G094100 Sobic002G074700--Sobic006G094900 Sobic003G012750--Sobic010G025600 Sobic003G012750--Sobic006G199601 Sobic003G012750--Sobic008G053500 Sobic003G012750--Sobic005G110517 Sobic003G012750--Sobic002G365200 Sobic003G012750--Sobic004G140900 Sobic001G288500 Sobic001G288500 Sobic003G012750--Sobic001G288500 Sobic010G167700 Sobic010G167700 Sobic003G012750--Sobic010G167700 Sobic001G251750 Sobic001G251750 Sobic003G012750--Sobic001G251750 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic005G150700--Sobic002G219100 Sobic009G037500 Sobic009G037500 Sobic005G150700--Sobic009G037500 Sobic005G150700--Sobic010G025600 Sobic003G210500 Sobic003G210500 Sobic005G150700--Sobic003G210500 Sobic001G279800 Sobic001G279800 Sobic005G150700--Sobic001G279800 Sobic005G150700--Sobic003G012750 Sobic007G175000 Sobic007G175000 Sobic005G150700--Sobic007G175000 Sobic005G150700--Sobic008G053500 Sobic003G068200 Sobic003G068200 Sobic005G150700--Sobic003G068200 Sobic008G053500--Sobic002G365200 Sobic008G053500--Sobic006G199601 Sobic001G325100 Sobic001G325100 Sobic008G053500--Sobic001G325100 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic010G045966 Sobic008G053500--Sobic003G012750 Sobic008G053500--Sobic002G074700 Sobic008G053500--Sobic010G025600 Sobic008G053500--Sobic001G288500 Sobic008G138850 Sobic008G138850 Sobic008G053500--Sobic008G138850
Octagon: transcription factors


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