Gene annotation
Transcriptome id Sobic.005G141900.2
Synonym
Functional annotation -
UniProt A0A1Z5RJH4
Pfam -
Panther DB -
NCBI CDD -
KEGG Orthology -
Gene Ontology -


Orthologs (automatic annotation)
TAIR -
RAP-DB (Rice) -
MaizeGDB (Corn) -
Brachypodium -
Barley -
Wheat -
Populus -


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Expression pattern by RNA-Seq analysis
FPKM plot


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Top 20 genes with similar expressed profiles

Rank Gene Function KEGG orthology
1 Sobic.010G062950 - -
2 Sobic.002G248800 expressed protein -
3 Sobic.007G031500 GEX1, putative, expressed -
4 Sobic.004G101800 osFTL13 FT-Like13 homologous to Flowering Locus T gene@ contains Pfam profile PF01161: Phosphatidylethanolamine-binding protein, expressed K16223: protein FLOWERING LOCUS T
5 Sobic.004G212250 - -
6 Sobic.010G083100 CXE carboxylesterase, putative, expressed -
7 Sobic.006G201350 - -
8 Sobic.001G144100 expressed protein -
9 Sobic.002G168100 Plant PDR ABC transporter associated domain containing protein, expressed -
10 Sobic.002G231700 - -
11 Sobic.008G111150 - -
12 Sobic.009G026900 protein kinase, putative, expressed -
13 Sobic.009G235801 - -
14 Sobic.010G025600 OsWAK112d - OsWAK receptor-like protein kinase, expressed -
15 Sobic.004G203666 - -
16 Sobic.003G210500 leucine rich repeat protein, putative, expressed -
17 Sobic.004G026900 ubiquitin conjugating enzyme protein, putative, expressed -
18 Sobic.003G229650 - -
19 Sobic.001G543000 glycosyl hydrolase, putative, expressed K01183: chitinase
20 Sobic.005G150700 resistance protein, putative, expressed -


Gene co-expression network
sample Sobic005G141900 Sobic005G141900 Sobic010G062950 Sobic010G062950 Sobic005G141900--Sobic010G062950 Sobic002G248800 Sobic002G248800 Sobic005G141900--Sobic002G248800 Sobic007G031500 Sobic007G031500 Sobic005G141900--Sobic007G031500 Sobic004G101800 Sobic004G101800 Sobic005G141900--Sobic004G101800 Sobic004G212250 Sobic004G212250 Sobic005G141900--Sobic004G212250 Sobic010G083100 Sobic010G083100 Sobic005G141900--Sobic010G083100 Sobic006G201350 Sobic006G201350 Sobic005G141900--Sobic006G201350 Sobic001G144100 Sobic001G144100 Sobic005G141900--Sobic001G144100 Sobic002G168100 Sobic002G168100 Sobic005G141900--Sobic002G168100 Sobic010G062950--Sobic007G031500 Sobic010G062950--Sobic002G168100 Sobic010G062950--Sobic006G201350 Sobic006G138850 Sobic006G138850 Sobic010G062950--Sobic006G138850 Sobic001G543000 Sobic001G543000 Sobic010G062950--Sobic001G543000 Sobic010G062950--Sobic005G141900 Sobic006G075100 Sobic006G075100 Sobic010G062950--Sobic006G075100 Sobic010G062950--Sobic004G212250 Sobic002G231700 Sobic002G231700 Sobic010G062950--Sobic002G231700 Sobic001G449300 Sobic001G449300 Sobic002G248800--Sobic001G449300 Sobic010G025600 Sobic010G025600 Sobic002G248800--Sobic010G025600 Sobic010G174000 Sobic010G174000 Sobic002G248800--Sobic010G174000 Sobic002G075300 Sobic002G075300 Sobic002G248800--Sobic002G075300 Sobic002G163500 Sobic002G163500 Sobic002G248800--Sobic002G163500 Sobic002G074700 Sobic002G074700 Sobic002G248800--Sobic002G074700 Sobic003G012750 Sobic003G012750 Sobic002G248800--Sobic003G012750 Sobic005G150700 Sobic005G150700 Sobic002G248800--Sobic005G150700 Sobic008G053500 Sobic008G053500 Sobic002G248800--Sobic008G053500 Sobic007G031500--Sobic010G062950 Sobic007G031500--Sobic002G168100 Sobic007G031500--Sobic006G138850 Sobic007G031500--Sobic006G075100 Sobic007G031500--Sobic006G201350 Sobic007G031500--Sobic005G141900 Sobic007G031500--Sobic001G543000 Sobic008G079733 Sobic008G079733 Sobic007G031500--Sobic008G079733 Sobic003G347480 Sobic003G347480 Sobic007G031500--Sobic003G347480 Sobic001G325500 Sobic001G325500 Sobic004G101800--Sobic001G325500 Sobic004G026900 Sobic004G026900 Sobic004G101800--Sobic004G026900 Sobic010G252301 Sobic010G252301 Sobic004G101800--Sobic010G252301 Sobic004G061300 Sobic004G061300 Sobic004G101800--Sobic004G061300 Sobic001G250800 Sobic001G250800 Sobic004G101800--Sobic001G250800 Sobic009G235801 Sobic009G235801 Sobic004G101800--Sobic009G235801 Sobic001G137050 Sobic001G137050 Sobic004G101800--Sobic001G137050 Sobic003G361150 Sobic003G361150 Sobic004G101800--Sobic003G361150 Sobic009G244450 Sobic009G244450 Sobic004G101800--Sobic009G244450 Sobic008G111150 Sobic008G111150 Sobic004G212250--Sobic008G111150 Sobic002G268250 Sobic002G268250 Sobic004G212250--Sobic002G268250 Sobic004G212250--Sobic006G201350 Sobic002G162900 Sobic002G162900 Sobic004G212250--Sobic002G162900 Sobic003G278800 Sobic003G278800 Sobic004G212250--Sobic003G278800 Sobic003G177350 Sobic003G177350 Sobic004G212250--Sobic003G177350 Sobic004G212250--Sobic010G083100 Sobic001G299300 Sobic001G299300 Sobic004G212250--Sobic001G299300 Sobic009G218450 Sobic009G218450 Sobic004G212250--Sobic009G218450 Sobic004G055400 Sobic004G055400 Sobic010G083100--Sobic004G055400 Sobic009G030701 Sobic009G030701 Sobic010G083100--Sobic009G030701 Sobic001G418300 Sobic001G418300 Sobic010G083100--Sobic001G418300 Sobic006G281300 Sobic006G281300 Sobic010G083100--Sobic006G281300 Sobic002G185000 Sobic002G185000 Sobic010G083100--Sobic002G185000 Sobic005G199500 Sobic005G199500 Sobic010G083100--Sobic005G199500 Sobic003G076300 Sobic003G076300 Sobic010G083100--Sobic003G076300 Sobic006G018500 Sobic006G018500 Sobic010G083100--Sobic006G018500 Sobic010G083100--Sobic002G162900 Sobic006G201350--Sobic004G212250 Sobic006G201350--Sobic002G168100 Sobic001G177700 Sobic001G177700 Sobic006G201350--Sobic001G177700 Sobic006G201350--Sobic001G543000 Sobic006G201350--Sobic002G268250 Sobic002G088500 Sobic002G088500 Sobic006G201350--Sobic002G088500 Sobic007G129500 Sobic007G129500 Sobic006G201350--Sobic007G129500 Sobic006G201350--Sobic009G235801 Sobic006G201350--Sobic010G062950 Sobic001G144100--Sobic010G025600 Sobic001G144100--Sobic005G150700 Sobic002G219100 Sobic002G219100 Sobic001G144100--Sobic002G219100 Sobic001G144100--Sobic001G325500 Sobic001G144100--Sobic010G083100 Sobic003G229650 Sobic003G229650 Sobic001G144100--Sobic003G229650 Sobic010G045966 Sobic010G045966 Sobic001G144100--Sobic010G045966 Sobic001G144100--Sobic010G252301 Sobic006G199601 Sobic006G199601 Sobic001G144100--Sobic006G199601 Sobic002G168100--Sobic001G543000 Sobic002G168100--Sobic010G062950 Sobic002G168100--Sobic002G231700 Sobic002G168100--Sobic006G201350 Sobic002G168100--Sobic009G235801 Sobic002G168100--Sobic007G031500 Sobic010G212900 Sobic010G212900 Sobic002G168100--Sobic010G212900 Sobic001G452400 Sobic001G452400 Sobic002G168100--Sobic001G452400 Sobic007G100275 Sobic007G100275 Sobic002G168100--Sobic007G100275
Octagon: transcription factors


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